Coronaviridae - Coronaviridae

Coronaviridae
Коронавирус
Вирусы-07-01700-g002.jpg
Диаграмма, электронная микрофотография, и геном коронавирус типы.
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Писувирикота
Класс:Pisoniviricetes
Порядок:Нидовиралес
Подотряд:Cornidovirineae
Семья:Coronaviridae
Подсемейства и роды

Coronaviridae это семья окутанный, вирусы с положительной цепью РНК которые заражают амфибии, птицы, и млекопитающие. В группу входят подсемейства Letovirinae и Ортокоронавирины; члены последнего известны как коронавирусы.

Вирусный геном 26–32 килобазы в длину. Частицы обычно украшены крупными (~ 20 нм) выступами в форме булавов или лепестков ("пепломеры "или" шипы "), которые в электронные микрофотографии сферических частиц создают изображение, напоминающее солнечная корона.[1][2]

Вирусология

Цикл репликации коронавируса.

Концы 5 'и 3' генома имеют кепка и поли (А) тракт соответственно. В вирусный конверт, полученные почкованием через мембраны эндоплазматический ретикулум (ER) или аппарат Гольджи, неизменно содержит два вирус-специфичных (глико) белка, S и M. Гликопротеин S включает большие выступы на поверхности, а M - трансмембранный белок с тройным охватом. Торовирусы и избранная подгруппа коронавирусов (в частности, члены подгруппы А рода Бетакоронавирус) обладают, помимо пепломеров, состоящих из S, вторым типом поверхностных выступов, состоящих из белка гемагглютинин-эстеразы. Еще одно важное структурное белок это фосфопротеин N, который отвечает за спиральную симметрию нуклеокапсида, в котором заключена геномная РНК.[3]

Генетическая рекомбинация может возникнуть, когда минимум два вирусных геномы присутствуют в одной и той же инфицированной клетке-хозяине. Рекомбинация РНК, по-видимому, является основной движущей силой эволюции коронавируса. Рекомбинация может определять генетическую изменчивость внутри вида CoV, способность видов CoV переходить от одного хозяина к другому и, нечасто, появление нового CoV.[4] Точный механизм рекомбинации в CoVs не известен, но, вероятно, включает переключение матрицы во время репликации генома.[4]

Таксономия

Таксономия семьи Coronaviridae с видами, патогенными для человека.
Иллюстрация коронавируса

Семья Coronaviridae подразделяется на 2 подсемейства, 5 родов, 26 подродов и 46 видов.[5] Дополнительные виды ожидают рассмотрения или предположительно.[6]

Коронавирус

Основная статья: Коронавирус

Коронавирус - это общее название для Coronaviridae и Ортокоронавирины, также называется Coronavirinae.[8][9] Коронавирусы вызывают заболевания у млекопитающих и птиц. У людей вирусы вызывают респираторные инфекции, в том числе простуда, которые обычно являются мягкими, но более редкими формами, такими как ОРВИ (в том числе вызывающий COVID-19 ) и MERS может быть смертельным.[10] Симптомы различаются у других видов: у кур они вызывают заболевание верхних дыхательных путей, а у коров и свиней коронавирусы вызывают диарею. Не существует вакцин или противовирусных препаратов для профилактики или лечения коронавирусных инфекций человека. Они есть оболочечные вирусы с положительный смысл одноцепочечный РНК геном и нуклеокапсид спиральной симметрии. В размер генома коронавирусов колеблется примерно от 26 до 32 килобазы, один из крупнейших за РНК-вирус (уступает только 41-кб нидовирус недавно обнаруженный в планария ).[11]

Ортокоронавирины таксономия

использованная литература

  1. ^ Кинг, Эндрю М. К .; Адамс, Майкл Дж .; Карстенс, Эрик Б .; Лефковиц, Эллиот Дж., Ред. (2012-01-01), «Орден - Нидовиралес», Таксономия вирусов, Elsevier, стр. 784–794, ISBN  978-0-12-384684-6, получено 2020-06-08
  2. ^ Бухари, Хулуд; Малли, Джеральдин; Гуляева Анастасия А .; Чжао, Ланьинг; Шу, Гочэн; Цзян, Цзяньпин; Нойман, Бенджамин В. (2018-11-01). «Описание и первоначальная характеристика метатранскриптомных геномов, подобных нидовирусам, из предложенного нового семейства Abyssoviridae и из сестринской группы Coronavirinae, предлагаемого рода Alphaletovirus». Вирусология. 524: 160–171. Дои:10.1016 / j.virol.2018.08.010. ISSN  0042-6822. ЧВК  7112036. PMID  30199753.
  3. ^ Макбрайд Р., ван Зил М., Филдинг BC (август 2014 г.). «Нуклеокапсид коронавируса - многофункциональный белок». Вирусы. 6 (8): 2991–3018. Дои:10.3390 / v6082991. ЧВК  4147684. PMID  25105276.
  4. ^ а б Су С., Вонг Дж., Ши В., Лю Дж., Лай АКК, Чжоу Дж., Лю В., Би Й., Гао Г. Ф. Эпидемиология, генетическая рекомбинация и патогенез коронавирусов. Trends Microbiol. 2016 июн; 24 (6): 490-502. DOI: 10.1016 / j.tim.2016.03.003. Epub 2016 21 марта. Обзор. PMID  27012512
  5. ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2019 г.». talk.ictvonline.org. Международный комитет по таксономии вирусов. Получено 11 мая 2020.
  6. ^ Горбаленя А., Бейкер С., Барик Р., де Гроот Р., Дростен С., Гуляева А., Хаагманс Б., Лаубер С., Леонтович А., Нойман Б., Пензар Д., Перлман С., Пун Л., Самборский Д., Сидоров И., Сола И., Зибур J (2020). «Виды коронавируса, связанного с тяжелым острым респираторным синдромом: классификация 2019-nCoV и присвоение ему названия SARS-CoV-2» (PDF). Природная микробиология. 5 (4): 536–44. Дои:10.1038 / s41564-020-0695-z. ЧВК  7095448. PMID  32123347.
  7. ^ Fan Y, Zhao K, Shi ZL, Zhou P (март 2019). «Коронавирусы летучих мышей в Китае». Вирусы. 11 (3): 210. Дои:10.3390 / v11030210. ЧВК  6466186. PMID  30832341.
  8. ^ «2017.012-015С» (xlsx). Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Октябрь 2018. В архиве из оригинала 14 мая 2019 г.. Получено 24 января 2020.
  9. ^ "История таксономии ICTV: Ортокоронавирины". Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Получено 24 января 2020.
  10. ^ «Пандемия нового коронавируса 2019–2020 гг. (Тяжелый острый респираторный синдром - коронавирус 2): Консенсусный документ Многопрофильной рабочей группы по COVID ‑ 19, объединенный Американским колледжем международной академической медицины и Всемирным академическим советом по неотложной медицине». ResearchGate. Получено 16 мая, 2020.
  11. ^ Сабери А., Гуляева А.А., Брубахер Ю.Л., Ньюмарк П.А., Горбаленя А.Е. (ноябрь 2018 г.). Стэнли П. (ред.). «Планарийный нидовирус расширяет пределы размера генома РНК». Патогены PLOS. 14 (11): e1007314. Дои:10.1371 / journal.ppat.1007314. ЧВК  6211748. PMID  30383829.

внешние ссылки