ICAM5 - ICAM5

ICAM5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3БН3, 4OI9, 4OIA, 4OIB
Идентификаторы
Псевдонимы	ICAM5, TLCN, TLN, молекула межклеточной адгезии 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 601852 MGI: 109430 ГомолоГен: 2447 Генные карты: ICAM5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19p13.2 Начните 10,289,952 бп[1] Конец 10,296,778 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 A3 | 9 7,7 см Начните 21,032,073 бп[2] Конец 21,039,036 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание интегрина • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • клеточная мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • мембрана Биологический процесс • клеточная адгезия • фагоцитоз • регуляция иммунного ответа • организация внеклеточного матрикса • межклеточная адгезия Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7087	15898
Ансамбль	ENSG00000105376	ENSMUSG00000032174
UniProt	Q9UMF0	Q60625
RefSeq (мРНК)	NM_003259	NM_008319
RefSeq (белок)	NP_003250	NP_032345
Расположение (UCSC)	Chr 19: 10.29 - 10.3 Мб	Chr 9: 21.03 - 21.04 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Молекула межклеточной адгезии 5 это белок что у людей кодируется ICAM5 ген.^[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, является членом молекула межклеточной адгезии (ICAM) семья. Все белки ICAM являются трансмембранными гликопротеинами I типа, содержат 2-9 иммуноглобулин-подобных доменов C2-типа и связываются с белком адгезии лейкоцитов LFA-1. Этот белок экспрессируется на поверхности нейронов конечного мозга и проявляет два типа адгезионной активности: гомофильное связывание между нейронами и гетерофильное связывание между нейронами и лейкоцитами. Он может быть критическим компонентом взаимодействия нейронов с микроглиальными клетками в ходе нормального развития или как часть нейродегенеративных заболеваний.^[7]

Взаимодействия

ICAM5 продемонстрировал взаимодействовать с PSEN1.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105376 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032174 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Мидзуно Т., Йошихара Й, Инадзава Дж., Кагамияма Х., Мори К. (февраль 1997 г.). «Клонирование кДНК и хромосомная локализация телэнцефалина человека и его отличительное взаимодействие с антигеном-1, связанным с функцией лимфоцитов». J Biol Chem. 272 (2): 1156–63. Дои:10.1074 / jbc.272.2.1156. PMID  8995416.
6. Килганнон П., Тернер Т., Мейер Дж., Уисдом У, Галлатин В.М. (январь 1999 г.). «Картирование гена ICAM-5 (телэнцефалина), члена нейрона семейства ICAM, на место между ICAM-1 и ICAM-3 на хромосоме 19p13.2 человека». Геномика. 54 (2): 328–30. Дои:10.1006 / geno.1998.5565. PMID  9828136.
7. «Ген Entrez: молекула 5 межклеточной адгезии ICAM5, телэнцефалин».
8. Annaert, W. G; Esselens C; Baert V; Boeve C; Snellings G; Куперс П; Craessaerts K; De Strooper B (ноябрь 2001 г.). «Взаимодействие с теленцефалином и белком-предшественником амилоида предсказывает кольцевую структуру пресенилинов». Нейрон. 32 (4): 579–89. Дои:10.1016 / S0896-6273 (01) 00512-8. ISSN  0896-6273. PMID  11719200. S2CID  2096602.

дальнейшее чтение

• Йошихара Й, Мори К. (1995). «Телеэнцефалин: молекула кода нейронной области?». Neurosci. Res. 21 (2): 119–24. Дои:10.1016/0168-0102(94)90153-8. PMID  7724062. S2CID  19931440.
• Хейфлик Дж. С., Килганнон П., Галлатин В. М. (1998). «Семейство белков молекулы межклеточной адгезии (ICAM). Новые члены и новые функции». Иммунол. Res. 17 (3): 313–27. Дои:10.1007 / BF02786454. PMID  9638475. S2CID  19901365.
• Бенсон Д.Л., Йошихара Й., Мори К. (1998). «Поляризованное распределение и специфическая для типа клеток локализация теленцефалина, молекулы межклеточной адгезии». J. Neurosci. Res. 52 (1): 43–53. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4547 (19980401) 52: 1 <43 :: AID-JNR5> 3.0.CO; 2-K. PMID  9556028.
• Рикманн П., Тернер Т., Клиганнон П., Стейнхофф Б.Дж. (1998). «Телеэнцефалин как индикатор височной дисфункции». Ланцет. 352 (9125): 370–1. Дои:10.1016 / S0140-6736 (05) 60469-2. PMID  9717930. S2CID  6255738.
• Арий Н., Мидзугути М., Мори К., Такашима С. (1999). «Развитие телэнцефалина в головном мозге человека». Microsc. Res. Технология. 46 (1): 18–23. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0029 (19990701) 46: 1 <18 :: AID-JEMT2> 3.0.CO; 2-G. PMID  10402269.
• Мидзуно Т., Йошихара Ю., Кагамияма Х. и др. (2000). «Молекула нейрональной адгезии теленцефалин вызывает быстрое распространение клеток микроглии». Мозг Res. 849 (1–2): 58–66. Дои:10.1016 / S0006-8993 (99) 01984-8. PMID  10592287. S2CID  353053.
• Тиан Л., Килганнон П., Йошихара Ю. и др. (2000). «Связывание Т-лимфоцитов с нейронами гиппокампа через ICAM-5 (телэнцефалин) и характеристика его взаимодействия с интегрином лейкоцитов CD11a / CD18». Евро. J. Immunol. 30 (3): 810–8. Дои:10.1002 / 1521-4141 (200003) 30: 3 <810 :: AID-IMMU810> 3.0.CO; 2-X. PMID  10741396.
• Тиан Л., Найман Х., Килганнон П. и др. (2000). «Молекула межклеточной адгезии-5 вызывает рост дендритов за счет гомофильной адгезии». J. Cell Biol. 150 (1): 243–52. Дои:10.1083 / jcb.150.1.243. ЧВК  2185561. PMID  10893271.
• Annaert WG, Esselens C, Baert V и др. (2002). «Взаимодействие с теленцефалином и белком-предшественником амилоида предсказывает кольцевую структуру пресенилинов». Нейрон. 32 (4): 579–89. Дои:10.1016 / S0896-6273 (01) 00512-8. PMID  11719200. S2CID  2096602.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Геваерт К., Геталс М., Мартенс Л. и др. (2004). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Биотехнология. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
• Брилл Л.М., Саломон А.Р., Фикарро С.Б. и др. (2004). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из Т-клеток человека с использованием аффинной хроматографии с иммобилизованным металлом и тандемной масс-спектрометрии». Анальный. Chem. 76 (10): 2763–72. Дои:10.1021 / ac035352d. PMID  15144186.
• Кокс Д. Г., Хэнкинсон С. Е., Хантер Д. Д. (2006). «Полиморфизмы в локусе гена ICAM не связаны с риском рака груди». Cancer Epidemiol. Биомаркеры Назад. 15 (1): 178–9. Дои:10.1158 / 1055-9965.EPI-05-0790. PMID  16434609.