IGF2BP1 - IGF2BP1

IGF2BP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3KRM
Идентификаторы
Псевдонимы	IGF2BP1, CRD-BP, CRDBP, IMP-1, IMP1, VICKZ1, ZBP1, инсулиноподобный фактор роста 2, связывающий мРНК белок 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 608288 MGI: 1890357 ГомолоГен: 4772 Генные карты: IGF2BP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q21.32 Начните 48,997,385 бп[1] Конец 49,056,145 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 D | 11 59,08 см Начните 95,957,163 бп[2] Конец 96,005,940 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • деятельность регулятора перевода • Связывание мРНК 3'-UTR • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание мРНК 5'-UTR • связывание мРНК • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • CRD-опосредованный комплекс стабильности мРНК • проекция клетки • филоподий • конус роста • дендритный позвоночник • аксон • дендрит • перинуклеарная область цитоплазмы • Гранула стресса • ядро клетки • ламеллиподиум • нуклеоплазма • цитозоль • рибонуклеопротеин Биологический процесс • CRD-опосредованная стабилизация мРНК • транспорт мРНК • отрицательное регулирование перевода • пролиферация клеток паллия в переднем мозге • поддержание популяции нейрональных стволовых клеток • регуляция процесса биосинтеза цитокинов • Локализация РНК • регулирование перевода • регуляция стабильности мРНК, участвующая в ответе на стресс • регуляция стабильности мРНК • транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	10642	140486
Ансамбль	ENSG00000159217	ENSMUSG00000013415
UniProt	Q9NZI8	O88477
RefSeq (мРНК)	NM_001160423 NM_006546	NM_009951
RefSeq (белок)	NP_001153895 NP_006537	NP_034081
Расположение (UCSC)	Chr 17:49 - 49,06 Мб	Chr 11: 95.96 - 96.01 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Инсулиноподобный фактор роста 2 мРНК-связывающий белок 1 это белок что у людей кодируется IGF2BP1 ген.^[5][6][7]

Этот ген кодирует члена семейства мРНК-связывающих белков (IMP) IGF-II. Белок, кодируемый этим геном, содержит четыре гомологических домена K и два РНК узнаваемость мотивов. Он функционирует путем привязки к 5 'UTR инсулиноподобный фактор роста 2 (IGF2) мРНК и регулирование трансляции IGF2.^[7]

Смотрите также

• IGF2BP2
• IGF2BP3

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000159217 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000013415 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нильсен Дж., Кристиансен Дж., Ликке-Андерсен Дж., Йонсен А. Х., Вевер УМ, Нильсен ФК (февраль 1999 г.). «Семейство мРНК-связывающих белков инсулиноподобного фактора роста II подавляет трансляцию в позднем развитии». Mol Cell Biol. 19 (2): 1262–70. Дои:10.1128 / MCB.19.2.1262. ЧВК  116055. PMID  9891060.
6. Янив К., Исраэли Дж. К. (май 2002 г.). «Участие консервативного семейства РНК-связывающих белков в эмбриональном развитии и канцерогенезе». Ген. 287 (1–2): 49–54. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00866-6. PMID  11992722.
7. "Ген Entrez: IGF2BP1 инсулиноподобный фактор роста 2 мРНК связывающий белок 1".

дальнейшее чтение

• Perycz M, Urbanska AS, Krawczyk P, Parobczak K, Jaworski J (2011). «Связывающий почтовый индекс белок 1 регулирует развитие дендритных ветвей в нейронах гиппокампа». J. Neurosci. 31 (14): 5271–85. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.2387-10.2011. PMID  21471362.
• Исраэли Дж. К. (2005). «Белки VICKZ: многофункциональное семейство регуляторных РНК-связывающих белков». Биол. Ячейка. 97 (1): 87–96. Дои:10.1042 / BC20040151. PMID  15601260. S2CID  8767105.
• Prokipcak RD, Херрик DJ, Росс J (1994). «Очистка и свойства белка, который связывается с C-концевой кодирующей областью мРНК c-myc человека». J. Biol. Chem. 269 (12): 9261–9. PMID  8132663.
• Дойл Г.А., Бец Н.А., Лидс П.Ф. и др. (1999). «Белок, связывающий детерминанту кодирующей области c-myc: член семейства РНК-связывающих белков домена KH». Нуклеиновые кислоты Res. 26 (22): 5036–44. Дои:10.1093 / nar / 26.22.5036. ЧВК  147974. PMID  9801297.
• Рунге С., Нильсен ФК, Нильсен Дж. И др. (2000). «РНК H19 связывает четыре молекулы мРНК-связывающего белка инсулиноподобного фактора роста II». J. Biol. Chem. 275 (38): 29562–9. Дои:10.1074 / jbc.M001156200. PMID  10875929.
• Нильсен ФК, Нильсен Дж., Кристенсен М.А. и др. (2003). «Цитоплазматический перенос мРНК-связывающего белка IGF-II с помощью консервативных доменов KH». J. Cell Sci. 115 (Pt 10): 2087–97. PMID  11973350.
• Лемм I, Росс Дж. (2002). «Регулирование распада мРНК c-myc путем приостановки трансляции в детерминанте нестабильности кодирующей области». Мол. Cell. Биол. 22 (12): 3959–69. Дои:10.1128 / MCB.22.12.3959-3969.2002. ЧВК  133878. PMID  12024010.
• Иоаннидис П., Махара Л., Пападопулу А. и др. (2003). «Увеличение числа копий 8q24 и экспрессия стабилизирующего мРНК c-myc белка CRD-BP в первичных карциномах молочной железы». Int. J. Рак. 104 (1): 54–9. Дои:10.1002 / ijc.10794. PMID  12532419. S2CID  45119038.
• Nielsen J, Adolph SK, Rajpert-De Meyts E, et al. (2003). «Ядерный транзит человеческого белка, связывающего почтовый индекс IMP1». Biochem. J. 376 (Pt 2): 383–91. Дои:10.1042 / BJ20030943. ЧВК  1223771. PMID  12921532.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Гу Л., Шигемаса К., Охама К. (2004). «Повышенная экспрессия мРНК-связывающего белка 1 IGF II связана с продвинутой клинической стадией и плохим прогнозом у пациентов с раком яичников». Int. Дж. Онкол. 24 (3): 671–8. Дои:10.3892 / ijo.24.3.671. PMID  14767552.
• Хансен Т.В., Хаммер Н.А., Нильсен Дж. И др. (2004). «Карликовость и нарушение развития кишечника у мышей с дефицитом мРНК-связывающего белка 1 инсулиноподобного фактора роста II». Мол. Cell. Биол. 24 (10): 4448–64. Дои:10.1128 / MCB.24.10.4448-4464.2004. ЧВК  400488. PMID  15121863.
• Иоаннидис П., Коттариди С., Димитриадис Э. и др. (2004). «Экспрессия РНК-связывающего белка CRD-BP в головном мозге и немелкоклеточных опухолях легких». Рак Lett. 209 (2): 245–50. Дои:10.1016 / j.canlet.2003.12.015. PMID  15159028.
• Рэкхэм О., Браун CM (2005). «Визуализация РНК-белковых взаимодействий в живых клетках: FMRP и IMP1 взаимодействуют на мРНК». EMBO J. 23 (16): 3346–55. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600341. ЧВК  514514. PMID  15282548.
• Нильсен Дж., Кристенсен М.А., Виллемоэс М. и др. (2004). «Последовательная димеризация человеческого zipcode-связывающего белка IMP1 на РНК: кооперативный механизм, обеспечивающий стабильность RNP». Нуклеиновые кислоты Res. 32 (14): 4368–76. Дои:10.1093 / нар / гх754. ЧВК  514376. PMID  15314207.
• Сузуки Ю., Ямасита Р., Широта М. и др. (2004). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях». Genome Res. 14 (9): 1711–8. Дои:10.1101 / гр.2435604. ЧВК  515316. PMID  15342556.
• Ляо Б., Патель М., Ху Y и др. (2005). «Целенаправленный нокдаун РНК-связывающего белка CRD-BP способствует пролиферации клеток через инсулиноподобный фактор роста II-зависимый путь в клетках лейкемии человека K562». J. Biol. Chem. 279 (47): 48716–24. Дои:10.1074 / jbc.M405853200. PMID  15355996.