INTS6 - INTS6 - Wikipedia

INTS6
Идентификаторы
Псевдонимы	INTS6, DBI-1, DDX26, DDX26A, DICE1, HDB, INT6, Notchl2, субъединица комплекса интегратора 6
Внешние идентификаторы	OMIM: 604331 MGI: 1202397 ГомолоГен: 8121 Генные карты: INTS6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 13 (человек)[1] Группа 13q14.3 Начинать 51,354,077 бп[1] Конец 51,454,264 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 14 (мышь)[2] Группа 14 | 14 D1 Начинать 62,676,330 бп[2] Конец 62,761,169 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • активность трансмембранного сигнального рецептора Сотовый компонент • интеграторный комплекс • актиновый цитоскелет • нуклеоплазма • ядро клетки Биологический процесс • процессинг мяРНК • транскрипция мяРНК с промотора РНК-полимеразы II • преобразование сигнала • процессинг 3'-конца мяРНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	26512	18130
Ансамбль	ENSG00000102786	ENSMUSG00000035161
UniProt	Q9UL03	Q6PCM2
RefSeq (мРНК)	NM_001039937 NM_001039938 NM_001306091 NM_012141	NM_008715
RefSeq (белок)	NP_001035026 NP_001035027 NP_001293020 NP_036273	NP_032741
Расположение (UCSC)	Chr 13: 51.35 - 51.45 Мб	Chr 14: 62,68 - 62,76 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Интеграторный комплекс субъединица 6 это белок что у людей кодируется INTS6 ген.^[5][6][7]

МЕРТВАЯ коробка белки, характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), предположительно РНК геликасы. Белок, кодируемый этим геном, представляет собой белок DEAD-бокса, который является частью комплекса, который взаимодействует с C-концом РНК-полимераза II и участвует в процессинге 3'-конца мяРНК. Кроме того, этот ген является кандидатом подавитель опухолей и расположен в критической области потеря гетерозиготности (LOH). Три варианта транскрипции, кодирующие два разных изоформы были обнаружены для этого гена.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000102786 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035161 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Виланд I, Арден К.С., Михельс Д., Кляйн-Хитпасс Л., Бом М., Виарс К.С., Вайдле UH (октябрь 1999 г.). «Выделение DICE1: гена, на который часто влияет LOH и который подавляется при карциномах легких». Онкоген. 18 (32): 4530–7. Дои:10.1038 / sj.onc.1202806. PMID  10467397.
6. Байлат Д., Хакими М.А., Наар А.М., Шилатифард А., Куч Н., Шихаттар Р. (октябрь 2005 г.). «Интегратор, мультипротеиновый медиатор процессинга малой ядерной РНК, связывается с С-концевым повтором РНК-полимеразы II». Клетка. 123 (2): 265–76. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.019. PMID  16239144.
7. "Entrez Gene: субъединица 6 интегратора INTS6".

дальнейшее чтение

• Бухсбаум С., Моррис С., Бочард В., Джалинот П. (2007). «Человеческий INT6 взаимодействует с MCM7 и регулирует его стабильность во время S фазы клеточного цикла». Онкоген. 26 (35): 5132–44. Дои:10.1038 / sj.onc.1210314. PMID  17310990.
• Эрнандес М., Пападопулос Н., Алмейда Т.А. (2006). «Отсутствие мутаций в гене DICE1 / DDX26 в линиях раковых клеток человека с частыми делециями 13q14». Рак Генет. Цитогенет. 163 (1): 91–2. Дои:10.1016 / j.cancergencyto.2005.04.014. PMID  16271964.
• Репке А., Бухтц П., Бем М. и др. (2005). «Промотор гиперметилирования CpG и подавление экспрессии DICE1 при раке простаты». Онкоген. 24 (44): 6667–75. Дои:10.1038 / sj.onc.1208824. PMID  16007164.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виланд I, Sell C, Weidle UH, Wieacker P (2005). «Эктопическая экспрессия DICE1 подавляет рост опухолевых клеток». Онкол. Представитель. 12 (2): 207–11. Дои:10.3892 / или 12.2.207. PMID  15254679.
• Данэм А., Мэтьюз Л.Х., Бертон Дж. И др. (2004). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 13 человека». Природа. 428 (6982): 522–8. Дои:10.1038 / природа02379. ЧВК  2665288. PMID  15057823.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Ли В.Дж., Ху Н, Су Х и др. (2003). «Утрата аллеля на хромосоме 13q14 и мутация в гене делетированного рака 1 при плоскоклеточном раке пищевода». Онкоген. 22 (2): 314–8. Дои:10.1038 / sj.onc.1206098. PMID  12527901.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Виланд I, Рёпке А., Штумм М. и др. (2002). «Молекулярная характеристика гена-супрессора опухоли DICE1 (DDX26) в клетках карциномы легких». Онкол. Res. 12 (11–12): 491–500. PMID  11939413.
• Камарго А.А., Нунес Д.Н., Самайя Н.Б. и др. (2002). «Молекулярная характеристика DDX26, человеческой DEAD-бокс-РНК-геликазы, расположенной на хромосоме 7p12». Braz. J. Med. Биол. Res. 34 (10): 1237–45. Дои:10.1590 / с0100-879x2001001000002. PMID  11593297.