IPO5 - IPO5

IPO5
Идентификаторы
Псевдонимы	IPO5, IMB3, KPNB3, Pse1, RANBP5, imp5, importin 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 602008 MGI: 1917822 ГомолоГен: 1710 Генные карты: IPO5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 13 (человек)[1] Группа 13q32.2 Начинать 97,953,658 бп[1] Конец 98,024,296 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 14 (мышь)[2] Группа 14 | 14 E4-E5 Начинать 120,911,224 бп[2] Конец 120,947,999 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Активность ингибитора GTPase • Ran связывание GTPase • GO: 0001948 связывание с белками • связывание с последовательностью ядерной локализации • Связывание РНК • активность рецептора ядерного импортного сигнала Сотовый компонент • мембрана • ядерная периферия • ядерная пора • ядрышко • ядро клетки • не мембрана • цитоплазма Биологический процесс • импорт рибосомального белка в ядро • клеточный ответ на аминокислотный стимул • транспорт белка • положительная регуляция импорта белка в ядро • GO: 0022415 вирусный процесс • внутриклеточный транспорт белка • GO: 0034259 отрицательная регуляция активности GTPase • Импорт NLS-несущего белка в ядро • транспорт • импорт белка в ядро • отрицательная регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3843	70572
Ансамбль	ENSG00000065150	ENSMUSG00000030662
UniProt	O00410	Q8BKC5
RefSeq (мРНК)	NM_002271	NM_023579 NM_001360602
RefSeq (белок)	NP_002262	NP_076068 NP_001347531
Расположение (UCSC)	Chr 13: 97.95 - 98.02 Мб	Chr 14: 120.91 - 120.95 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Импортин-5 это белок что у людей кодируется IPO5 ген.^[5][6][7] Белок, кодируемый этим геном, является членом импортин бета-семья.

Функция

Ядерный транспорт, процесс, зависящий от сигнала и энергии, происходит через комплексы ядерных пор, встроенных в ядерная оболочка. Импорт белков, содержащих сигнал ядерной локализации (NLS) требует рецептора импорта NLS, гетеродимера альфа- и бета-субъединиц импортина, также известного как кариоферины. Импортин альфа связывает NLS-содержащий груз в цитоплазме, а импортин бета закрепляет комплекс на цитоплазматической стороне комплекса ядерных пор. В присутствии нуклеозидтрифосфатов и небольшого GTP-связывающего белка Ран, комплекс перемещается в комплекс ядерной поры, и субъединицы импортина диссоциируют. Импортин альфа проникает в нуклеоплазму со своим белком-пассажиром, а импортин бета остается в порах. Взаимодействия между importin beta и FG-повторами нуклеопоринов важны для транслокации через поровый комплекс.^[8]

IPO5 облегчает транслокацию цитоплазматического белка, связывающего элемент полиаденилирования (CPEB) 3, путем связывания с мотивом RRM1 CPEB3 в нейронах. Передача сигналов NMDAR увеличивает экспрессию RanBP1 и снижает уровень цитоплазматического GTP-связанного Ran. Эти изменения усиливают взаимодействие CPEB3-IPO5, что, следовательно, ускоряет ядерный импорт CPEB3 и способствует его ядерной функции.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000065150 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030662 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ясин Н.Р., Блобель Г. (май 1997 г.). «Клонирование и характеристика человеческого кариоферина бета3». Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (9): 4451–6. Дои:10.1073 / пнас.94.9.4451. ЧВК  20743. PMID  9114010.
6. Дин Р., Шефер В., Циммерманн Х. П., Мюллер Л., Герлих Д., Прен С., Понстингл Х., Бишофф FR (сентябрь 1997 г.). «Ran-связывающий белок 5 (RanBP5) связан с ядерным транспортным фактором importin-beta, но по-другому взаимодействует с RanBP1». Mol Cell Biol. 17 (9): 5087–96. ЧВК  232359. PMID  9271386.
7. Дэн Т., Энгельгардт О.Г., Томас Б., Акулитчев А.В., Браунли Г.Г., Фодор Э. (ноябрь 2006 г.). «Роль ран-связывающего белка 5 в ядерном импорте и сборке комплекса РНК-полимеразы вируса гриппа». J Virol. 80 (24): 11911–9. Дои:10.1128 / JVI.01565-06. ЧВК  1676300. PMID  17005651.
8. «Ген Entrez: RANBP5 RAN-связывающий белок 5».
9. Чао Х.В., Лай Ю.Т., Лу Й.Л., Линь Ц.Л., Май В., Хуанг Ю.С. (сентябрь 2012 г.). «Передача сигналов NMDAR облегчает IPO5-опосредованный ядерный импорт CPEB3». Нуклеиновые кислоты Res. 40 (17): 8484–98. Дои:10.1093 / нар / gks598. ЧВК  3458550. PMID  22730302.

дальнейшее чтение

• Букринский М.И., Хаффар О.К. (2004). «Ядерный импорт ВИЧ-1: в поисках лидера». Передний. Biosci. 2: d578–87. Дои:10.2741 / A213. PMID  9366553.
• Букринский М.И., Хаффар О.К. (1998). «Ядерный импорт ВИЧ-1: матричный белок снова в центре внимания, на этот раз вместе с Vpr». Мол. Med. 4 (3): 138–43. Дои:10.1007 / BF03401911. ЧВК  2230352. PMID  9562972.
• Кристоф Д., Кристоф-Хобертус С., Пишон Б. (2000). «Ядерное нацеливание белков: сколько разных сигналов?». Клетка. Сигнал. 12 (5): 337–41. Дои:10.1016 / S0898-6568 (00) 00077-2. PMID  10822175.
• Чук Ю.М., Блобель Г. (2002). «Кариоферины и ядерный импорт». Curr. Мнение. Struct. Биол. 11 (6): 703–15. Дои:10.1016 / S0959-440X (01) 00264-0. PMID  11751052.
• Букринский М.И., Шарова Н., Демпси М.П., ​​Стэнвик Т.Л., Букринская А.Г., Хаггерти С., Стивенсон М. (1992). «Активный ядерный импорт преинтеграционных комплексов вируса иммунодефицита человека 1 типа». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 89 (14): 6580–4. Дои:10.1073 / пнас.89.14.6580. ЧВК  49545. PMID  1631159.
• Букринский М.И., Хаггерти С., Демпси М.П., ​​Шарова Н., Аджубель А., Шпиц Л., Льюис П., Гольдфарб Д., Эмерман М., Стивенсон М. (1993). «Сигнал ядерной локализации в матричном белке ВИЧ-1, который управляет инфекцией неделящихся клеток». Природа. 365 (6447): 666–9. Дои:10.1038 / 365666a0. PMID  8105392.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Галлай П., Надежда Т., Чин Д., Троно Д. (1997). «ВИЧ-1 инфицирование неделящихся клеток через распознавание интегразы путем импорта / кариоферина». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (18): 9825–30. Дои:10.1073 / пнас.94.18.9825. ЧВК  23276. PMID  9275210.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Хендерсон Б.Р., Percipalle P (1998). «Взаимодействие между HIV Rev и ядерными факторами импорта и экспорта: сигнал ядерной локализации Rev опосредует специфическое связывание с человеческим импортином-бета». J. Mol. Биол. 274 (5): 693–707. Дои:10.1006 / jmbi.1997.1420. PMID  9405152.
• Efthymiadis A, Briggs LJ, Jans DA (1998). «Последовательность ядерной локализации Tat ВИЧ-1 придает новые свойства импорта ядер». J. Biol. Chem. 273 (3): 1623–8. Дои:10.1074 / jbc.273.3.1623. PMID  9430704.
• Водичка М.А., Кепп Д.М., Сильвер П.А., Эмерман М. (1998). «ВИЧ-1 Vpr взаимодействует с ядерным транспортным путем, способствуя заражению макрофагами». Genes Dev. 12 (2): 175–85. Дои:10.1101 / gad.12.2.175. ЧВК  316441. PMID  9436978.
• Попов С., Рексач М., Зибарт Г., Рейлинг Н., Ли М.А., Ратнер Л., Лейн С.М., Мур М.С., Блобель Г., Букринский М. (1998). «Вирусный белок R регулирует ядерный импорт преинтеграционного комплекса ВИЧ-1». EMBO J. 17 (4): 909–17. Дои:10.1093 / emboj / 17.4.909. ЧВК  1170440. PMID  9463369.
• Попов С, Рексач М, Ратнер Л, Блобель Г, Букринский М (1998). «Вирусный белок R регулирует стыковку прединтеграционного комплекса ВИЧ-1 с комплексом ядерных пор». J. Biol. Chem. 273 (21): 13347–52. Дои:10.1074 / jbc.273.21.13347. PMID  9582382.
• Фушье Р.А., Мейер Б.Е., Саймон Дж. Х., Фишер У., Олбрайт А. В., Гонсалес-Скарано Ф, Малим М. Х. (1998). «Взаимодействие белка Vpr вируса иммунодефицита человека 1 типа с комплексом ядерных пор». Дж. Вирол. 72 (7): 6004–13. ЧВК  110405. PMID  9621063.