Индолеамин 2,3-диоксигеназа 2 - Indoleamine 2,3-dioxygenase 2

IDO2
Идентификаторы
Псевдонимы	IDO2, INDOL1, индоламин-2,3-диоксигеназа 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 612129 MGI: 2142489 ГомолоГен: 48830 Генные карты: IDO2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8p11.21 Начинать 39,934,614 бп[1] Конец 40,016,391 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 | 8 A2 Начинать 24,531,892 бп[2] Конец 24,576,333 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • оксидоредуктазная активность • активность индоламин-2,3-диоксигеназы • активность триптофана 2,3-диоксигеназы • гемовое связывание • активность диоксигеназы • связывание ионов металлов Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • катаболический процесс триптофана • окислительно-восстановительный процесс • иммунная система • катаболический процесс триптофана до кинуренина • Процесс биосинтеза НАД из триптофана de novo Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	169355	209176
Ансамбль	ENSG00000188676	ENSMUSG00000031549
UniProt	Q6ZQW0	Q8R0V5
RefSeq (мРНК)	NM_194294	NM_145949
RefSeq (белок)	NP_919270	NP_666061
Расположение (UCSC)	Chr 8: 39.93 - 40.02 Мб	Chr 8: 24,53 - 24,58 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Индолеамин 2,3-диоксигеназа 2 (IDO2) - это белок что у человека кодируется IDO2 ген.^[5]

Функция

IDO2 (индоламин-2,3-диоксигеназа) - это фермент с размером белка 420 аминокислот (47 кДа), который используется для катаболизма триптофана. В организмах другие ферменты участвуют в L-триптофан расщепление, а именно IDO1 и TDO. Несмотря на то, что IDO1 и IDO2 являются тесно связанными ферментами, возникающими в результате дупликации генов и имеющими высокий уровень (43%) гомологии последовательностей,^[6][7] они различаются своей кинетикой, функцией и характером экспрессии. Гены, кодирующие IDO1 и IDO2, имеют схожую геномную структуру и расположены близко друг к другу на хромосоме 8.^[8] IDO2 продуцируется в очень ограниченном типе тканей, таких как почки, печень или антигенпредставляющие клетки.^[9] IDO2 менее активен на субстратах IDO1, лучше катаболизирует другие производные Trp в виде 5-метокситриптофана. В популяции есть несколько изоформ, полученных в результате альтернативного сплайсинга.^[10] Как и IDO1, IDO2 упоминается в Трег дифференциация in vitro,^[11] предполагая роль в поддержании толерантности. Его экспрессия была обнаружена при нескольких видах рака, опухолях желудка, толстой кишки или почек.^[12]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000188676 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031549 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Ген: индолеамин-2,3-диоксигеназа 2».
6. Yuasa HJ, Mizuno K, Ball HJ (июль 2015 г.). «Ферменты IDO2 с низкой эффективностью сохраняются у низших позвоночных, тогда как ферменты IDO1 с более высокой эффективностью не требуются». Журнал FEBS. 282 (14): 2735–45. Дои:10.1111 / фев.13316. PMID  25950090. S2CID  25834690.
7. Болл Х.Дж., Санчес-Перес А., Вайзер С., Остин С.Дж., Астельбауэр Ф., Миу Дж., Маккуиллан Дж.А., Стокер Р., Джермейн Л.С., Хант NH (июль 2007 г.). «Характеристика белка, подобного индоламин-2,3-диоксигеназе, обнаруженного у людей и мышей». Ген. 396 (1): 203–13. Дои:10.1016 / j.gene.2007.04.010. PMID  17499941.
8. Болл Х.Дж., Санчес-Перес А., Вайзер С., Остин С.Дж., Астельбауэр Ф., Миу Дж., Маккуиллан Дж.А., Стокер Р., Джермейн Л.С., Хант NH (июль 2007 г.). «Характеристика белка, подобного индоламин-2,3-диоксигеназе, обнаруженного у людей и мышей». Ген. 396 (1): 203–13. Дои:10.1016 / j.gene.2007.04.010. PMID  17499941.
9. Мерло Л. М., Мандик-Наяк Л. (2016). «IDO2: патогенный медиатор воспалительного аутоиммунитета». Insights Clinical Medicine. Патология. 9 (Дополнение 1): 21–28. Дои:10.4137 / CPath.S39930. ЧВК  5119657. PMID  27891058.
10. Мец Р., Духадуэй Дж. Б., Камасани Ю., Лори-Кляйнтоп Л., Мюллер А. Дж., Prendergast GC (август 2007 г.). «Новый катаболический фермент триптофана IDO2 является предпочтительной биохимической мишенью противоопухолевого соединения, ингибирующего индоламин-2,3-диоксигеназу. D-1-метил-триптофан ». Исследования рака. 67 (15): 7082–7. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-1872. PMID  17671174.
11. Мец Р., Смит С., Духадуэй Дж. Б., Чендлер П., Бабан Б., Мерло Л. М., Пиготт Е., Кео М. П., Руст С., Меллор А. Л., Мандик-Наяк Л., Мюллер А. Дж., Прендергаст Г. К. (июль 2014 г.). «IDO2 имеет решающее значение для IDO1-опосредованной регуляции Т-клеток и выполняет неизбыточную функцию при воспалении». Международная иммунология. 26 (7): 357–67. Дои:10.1093 / intimm / dxt073. ЧВК  4432394. PMID  24402311.
12. Лёб С., Кенигсрайнер А., Цикер Д., Брюхер Б.Л., Раммензее Х.Г., Опельц Г., Тернесс П. (январь 2009 г.). «IDO1 и IDO2 экспрессируются в опухолях человека: лево-, но не декстро-1-метилтриптофан ингибирует катаболизм триптофана». Иммунология рака, Иммунотерапия. 58 (1): 153–7. Дои:10.1007 / s00262-008-0513-6. PMID  18418598. S2CID  6199515.

дальнейшее чтение

• Болл Х.Дж., Санчес-Перес А., Вайзер С., Остин С.Дж., Астельбауэр Ф., Миу Дж., Маккуиллан Дж.А., Стокер Р., Джермейн Л.С., Хант NH (июль 2007 г.). «Характеристика белка, подобного индоламин-2,3-диоксигеназе, обнаруженного у людей и мышей». Ген. 396 (1): 203–13. Дои:10.1016 / j.gene.2007.04.010. PMID  17499941.
• Мец Р., Духадуэй Дж. Б., Камасани Ю., Лори-Кляйнтоп Л., Мюллер А. Дж., Prendergast GC (август 2007 г.). «Новый катаболический фермент триптофана IDO2 является предпочтительной биохимической мишенью противоопухолевого соединения D-1-метил-триптофана, ингибирующего индоламин-2,3-диоксигеназу». Исследования рака. 67 (15): 7082–7. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-1872. PMID  17671174.
• Виткевич А.К., Константино С.Л., Мец Р., Мюллер А.Дж., Прендергаст Г.К., Йео С.Дж., Броди-младший (май 2009 г.). «Генотипирование и анализ экспрессии IDO2 при раке поджелудочной железы человека: новая активная мишень». Журнал Американского колледжа хирургов. 208 (5): 781–7, обсуждение 787–9. Дои:10.1016 / j.jamcollsurg.2008.12.018. ЧВК  3176891. PMID  19476837.
• Виткевич А.К., Константино С.Л., Мец Р., Мюллер А.Дж., Прендергаст Г.К., Йео С.Дж., Броди-младший (май 2009 г.). «Генотипирование и анализ экспрессии IDO2 при раке поджелудочной железы человека: новая активная мишень». Журнал Американского колледжа хирургов. 208 (5): 781–7, обсуждение 787–9. Дои:10.1016 / j.jamcollsurg.2008.12.018. ЧВК  3176891. PMID  19476837.
• Huttunen R, Syrjänen J, Aittoniemi J, Oja SS, Raitala A, Laine J, Pertovaara M, Vuento R, Huhtala H, Hurme M (февраль 2010 г.). «Высокая активность фермента индоламин-2,3-диоксигеназы позволяет прогнозировать тяжесть заболевания и летальный исход у пациентов с бактериемией». Шок. 33 (2): 149–54. Дои:10.1097 / SHK.0b013e3181ad3195. PMID  19487973. S2CID  24459411.
• Цетиндере Т., Намбияр С., Сантурлидис С., Эссманн Ф., Хассан М. (февраль 2010 г.). «Индоламин-2, 3-диоксигеназа путем активации рецептора смерти способствует апоптозу клеток меланомы через накопление АФК в зависимости от повреждения митохондрий». Сотовая связь. 22 (2): 197–211. Дои:10.1016 / j.cellsig.2009.09.013. PMID  19799997.
• Мао Р., Чжан Дж., Цзян Д., Цай Д., Леви Дж. М., Куконати А., Блок TM, Гуо Дж. Т., Гуо Х. (январь 2011 г.). «Индолеамин-2,3-диоксигеназа опосредует противовирусный эффект гамма-интерферона против вируса гепатита В в клетках, происходящих из гепатоцитов человека». Журнал вирусологии. 85 (2): 1048–57. Дои:10.1128 / JVI.01998-10. ЧВК  3019998. PMID  21084489.
• Соренсен РБ, Кёльгаард Т., Андерсен Р.С., ван ден Берг Дж. Х., Сване И. М., Стратен П., Андерсен М. Х. (март 2011 г.). «Спонтанная цитотоксическая реактивность Т-клеток против индоламин-2,3-диоксигеназы-2». Исследования рака. 71 (6): 2038–44. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-10-3403. PMID  21406395.
• Майнингер Д., Заламеда Л., Лю Ю., Степан Л. П., Борхес Л., Маккартер Д. Д., Сазерленд С. Л. (декабрь 2011 г.). «Очистка и кинетическая характеристика человеческих индоламин-2,3-диоксигеназ 1 и 2 (IDO1 и IDO2) и открытие селективных ингибиторов IDO1». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Белки и протеомика. 1814 (12): 1947–54. Дои:10.1016 / j.bbapap.2011.07.023. PMID  21835273.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.