KCNQ1OT1 - KCNQ1OT1

KCNQ1OT1
Идентификаторы
ПсевдонимыKCNQ1OT1, KCNQ1-AS2, KCNQ10T1, KvDMR1, KvLQT1-AS, LIT1, NCRNA00012, Kncq1, KCNQ1 противоположная цепь / антисмысловой транскрипт 1 (не кодирует белок), KCNQ1 противоположная цепь / антисмысловой транскрипт 1
Внешние идентификаторыOMIM: 604115 Генные карты: KCNQ1OT1
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

н / д

н / д

RefSeq (белок)

н / д

н / д

Расположение (UCSC)н / дн / д
PubMed поиск[1]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

KCNQ1 перекрывающаяся стенограмма 1, также известен как KCNQ1OT1, это длинная некодирующая РНК ген найдено в KCNQ1 локус. Этот локус состоит из 8–10 генов, кодирующих белок, специфически экспрессируется от материнского аллеля (в том числе KCNQ1 ген), и отцовский экспрессируемый ген некодирующей РНК KCNQ1OT1.[2] KCNQ1OT1 и KCNQ1 являются импринтированные гены и являются частью области контроля импринтинга (ICR). Мицуя идентифицировал, что KCNQ1OT1 является антисмысловым транскриптом KCNQ1. KCNQ1OT1 - это отцовский аллель а KCNQ1 - это материнский аллель.[3] KCNQ1OT1 - это ядерный транскрипт размером 91 kb, обнаруженный в непосредственной близости от ядрышко в определенных типах клеток.[4][5]

Он взаимодействует с хроматин, то гистон-метилтрансфераза G9a (ответственный за моно- и диметилирование гистона 3, лизина 9, H3K9) и репрессивный комплекс Polycomb 2, PRC2, (отвечает за триметилирование H3K27).[4] Он играет важную роль в подавление транскрипции локуса KCNQ1, регулируя метилирование гистонов.[2] Ан 890 бп регион в 5′ конец KCNQ1OT1 действует как домен молчания.[6][7] Этот регион регулирует CpG метилирование уровни соматически приобретенные дифференциально метилированные области (DMR), опосредуют взаимодействие KCNQ1OT1 с хроматином и с ДНК (цитозин-5) -метилтрансферазой 1 (DNMT1 ), но не влияет на взаимодействия гистоновых метилтрансфераз с KCNQ1OT1.[7]

Неправильная регуляция импринтированного гена KCNQ1OT1 может приводить к множеству аномалий. Утрата материнского метилирования аллеля KCNQ1OT1 чаще всего связана с Синдром Беквита-Видеманна.[8] Удаление KCNQ1OT1 у самцов может привести к удалению репрессора в шести цис-генах.[9] Потомство от самцов, у которых был нокаутирован KCNQ1OT1, весил на 20-25% меньше контроля.[9] Если делеция произошла у самок, то их потомство не имело ограничений роста. Более того, однопородная отцовская дисомия (UPD) KCNQ1OT1 тесно связана с Опухоль Вильмса. Фактически, трое из четырех пациентов с синдромом Беквита-Видемана и опухолью Вильмса имели UPD.[10] Когда транскрипт KCNQ1OT1 усечен, вместо этого экспрессируются обычно репрессированные аллели на отцовской хромосоме.[11] Как показывают данные, неправильная регуляция KCNQ1OT1 может привести к катастрофическим физическим и генетическим последствиям.

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  2. ^ а б Кандури C (июнь 2011 г.). «Kcnq1ot1: регуляторная РНК хроматина». Семинары по клеточной биологии и биологии развития. 22 (4): 343–350. Дои:10.1016 / j.semcdb.2011.02.020. PMID  21345374.
  3. ^ Мицуя К., Мегуро М., Ли М.П., ​​Като М., Шульц Т.С., Куго Х., Йошида М.А., Ниикава Н., Фейнберг А.П., Осимура М. (июль 1999 г.). «LIT1, импринтированная антисмысловая РНК в локусе KvLQT1 человека, идентифицированная путем скрининга дифференциально экспрессируемых транскриптов с использованием монохромосомных гибридов». Молекулярная генетика человека. 8 (7): 1209–1217. Дои:10.1093 / hmg / 8.7.1209. PMID  10369866.
  4. ^ а б Пандей Р.Р., Мондал Т., Мохаммад Ф., Энрот С., Редруп Л., Коморовски Дж., Нагано Т., Манчини-Динардо Д., Кандури С. (октябрь 2008 г.). «Антисмысловая некодирующая РНК Kcnq1ot1 опосредует клон-специфическое подавление транскрипции посредством регуляции на уровне хроматина». Молекулярная клетка. 32 (2): 232–246. Дои:10.1016 / j.molcel.2008.08.022. PMID  18951091.
  5. ^ Fedoriw AM, Calabrese JM, Mu W, Yee D, Magnuson T (декабрь 2012 г.). «Управляемая дифференцировкой ассоциация ядрышек импринтированного нами локуса Kcnq1». G3. 2 (12): 1521–1528. Дои:10.1534 / g3.112.004226. ЧВК  3516474. PMID  23275875.
  6. ^ Мохаммад Ф., Пандей Р.Р., Нагано Т., Чакалова Л., Мондал Т., Фрейзер П., Кандури С. (июнь 2008 г.). «Некодирующая РНК Kcnq1ot1 / Lit1 опосредует подавление транскрипции путем нацеливания на перинуклеолярную область». Молекулярная и клеточная биология. 28 (11): 3713–3728. Дои:10.1128 / MCB.02263-07. ЧВК  2423283. PMID  18299392.
  7. ^ а б Мохаммад Ф., Мондал Т., Гусева Н., Пандей Г.К., Кандури С. (август 2010 г.). «Некодирующая РНК Kcnq1ot1 опосредует подавление транскрипционного гена путем взаимодействия с Dnmt1». Развитие. 137 (15): 2493–2499. Дои:10.1242 / dev.048181. PMID  20573698.
  8. ^ Энгель Дж. Р., Смоллвуд А., Харпер А., Хиггинс М. Дж., Осимура М., Рейк В., Шофилд П. Н., Махер Э. Р. (декабрь 2000 г.). «Эпигенотип-фенотип корреляции при синдроме Беквита-Видемана». Журнал медицинской генетики. 37 (12): 921–926. Дои:10.1136 / jmg.37.12.921. ЧВК  1734494. PMID  11106355.
  9. ^ а б Фитцпатрик Г.В., Солоуэй П.Д., Хиггинс М.Дж. (ноябрь 2002 г.). «Региональная потеря импринтинга и дефицит роста у мышей с целенаправленной делецией KvDMR1». Природа Генетика. 32 (3): 426–431. Дои:10.1038 / ng988. PMID  12410230. S2CID  24387570.
  10. ^ Генри I, Бонайти-Пеллие С., Чеенссе В., Бельджорд С., Шварц С., Утерманн Г., Жуниен С. (июнь 1991 г.). «Однородительская отцовская дисомия в генетическом предрасполагающем к раку синдроме». Природа. 351 (6328): 665–667. Bibcode:1991Натура.351..665H. Дои:10.1038 / 351665a0. PMID  1675767. S2CID  4365894.
  11. ^ Манчини-Динардо Д., Стил С.Дж., Леворс Дж.М., Инграм Р.С., Тилгман С.М. (май 2006 г.). «Удлинение транскрипта Kcnq1ot1 необходимо для геномного импринтинга соседних генов». Гены и развитие. 20 (10): 1268–1282. Дои:10.1101 / gad.1416906. ЧВК  1472902. PMID  16702402.

дальнейшее чтение