KDM3A - KDM3A

KDM3A
Идентификаторы
Псевдонимы	KDM3A, JHDM2A, JHMD2A, JMJD1, JMJD1A, TSGA, лизиндеметилаза 3A
Внешние идентификаторы	OMIM: 611512 MGI: 98847 ГомолоГен: 10196 Генные карты: KDM3A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п11.2 Начинать 86,440,647 бп[1] Конец 86,492,716 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 C1 Начинать 71,588,972 бп[2] Конец 71,632,990 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов железа • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • активность диоксигеназы • связывание ионов металлов • связывание рецепторов андрогенов • оксидоредуктазная активность • гистоновая деметилаза активность • связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области транскрипции • связывание хроматина с ДНК • активность гистон-деметилазы (специфическая для H3-K9) • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание ДНК с последовательностью корового промотора РНК-полимеразы II Сотовый компонент • цитоплазма • мембрана • нуклеоплазма • ядро клетки • хроматин Биологический процесс • сигнальный путь рецептора андрогена • дифференциация клеток • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • диметилирование гистона H3-K9 • регуляция дифференцировки стволовых клеток • регуляция поддержания популяции стволовых клеток • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • сперматогенез • гормонально-опосредованный сигнальный путь • отрицательная регуляция метилирования гистона H3-K9 • регуляция экспрессии генов • процесс биосинтеза формальдегида • удлинение ядра сперматиды • окислительно-восстановительный процесс • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • ковалентная модификация хроматина • деметилирование гистона H3-K9 • клеточный ответ на фактор ингибирования лейкемии • организация хроматина • положительное регулирование термогенеза, вызванного холодом Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55818	104263
Ансамбль	ENSG00000115548	ENSMUSG00000053470
UniProt	Q9Y4C1	Q6PCM1
RefSeq (мРНК)	NM_001146688 NM_018433	NM_001038695 NM_173001 NM_001362200 NM_001362201
RefSeq (белок)	NP_001140160 NP_060903	NP_001033784 NP_766589 NP_001349129 NP_001349130
Расположение (UCSC)	Chr 2: 86.44 - 86.49 Мб	Chr 6: 71,59 - 71,63 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Лизин деметилаза 3А это белок что у человека кодируется KDM3A ген.^[5]

Функция

Этот ген кодирует цинковый палец белок, который содержит домен jumonji и может играть роль в гормонозависимой транскрипционный активация. Альтернативная сварка приводит к множеству вариантов транскрипции.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115548 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000053470 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Ген: лизин деметилаза 3А».

дальнейшее чтение

• Wellmann S, Bettkober M, Zelmer A, Seeger K, Faigle M, Eltzschig HK, Bührer C (2008). «Гипоксия активирует гистоновую деметилазу JMJD1A через HIF-1». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 372 (4): 892–7. Дои:10.1016 / j.bbrc.2008.05.150. PMID  18538129.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.