ХСРП - KHSRP

ХСРП
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2HH2, 2HH3, 2JVZ, 2OPU, 2OPV, 4B8T
Идентификаторы
Псевдонимы	ХСРП, FBP2, FUBP2, KSRP, регуляторный белок сплайсинга KH-типа, p75
Внешние идентификаторы	OMIM: 603445 MGI: 1336214 ГомолоГен: 2734 Генные карты: ХСРП
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19p13.3 Начинать 6,413,348 бп[1] Конец 6,424,794 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 D | 17 29,63 см Начинать 57,021,051 бп[2] Конец 57,031,522 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • связывание мРНК • Связывание мРНК 3'-UTR AU-богатой области • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • мембрана • нуклеоплазма • Гранула стресса • ядро клетки • экзосома (комплекс РНКазы) Биологический процесс • транспорт мРНК • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • катаболический процесс мРНК • Сплайсинг РНК посредством реакций переэтерификации • обработка мРНК • транскрипция, ДНК-шаблон • регуляция метаболического процесса miRNA • Сплайсинг РНК • клеточный ответ на цитокиновый стимул • отрицательная регуляция процесса биосинтеза оксида азота • положительная регуляция катаболического процесса мРНК • 3'-UTR-опосредованная дестабилизация мРНК • регуляция стабильности мРНК • miRNA метаболический процесс • транспорт • отрицательная регуляция клиренса частиц липопротеинов низкой плотности Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8570	16549
Ансамбль	ENSG00000088247	ENSMUSG00000007670
UniProt	Q92945	Q3U0V1
RefSeq (мРНК)	NM_003685 NM_001366299 NM_001366300	NM_010613
RefSeq (белок)	NP_003676 NP_001353228 NP_001353229	NP_034743
Расположение (UCSC)	Chr 19: 6.41 - 6.42 Мб	Chr 17: 57.02 - 57.03 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, связывающий элементы 2 далеко вверх по течению это белок что у людей кодируется ХСРП ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000088247 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000007670 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Мин Х, Турк CW, Николич Дж. М., Блэк DL (май 1997 г.). «Новый регуляторный белок, KSRP, опосредует включение экзона через интронный энхансер сплайсинга». Genes Dev. 11 (8): 1023–36. Дои:10.1101 / gad.11.8.1023. PMID  9136930.
6. Дэвис-Смит Т., Дункан Р.К., Чжэн Т., Микелотти Г., Левенс Д. (январь 1997 г.). «Белки, связывающие элементы, расположенные далеко выше по течению, составляют древнее семейство одноцепочечных трансактиваторов связывания ДНК». J Biol Chem. 271 (49): 31679–87. Дои:10.1074 / jbc.271.49.31679. PMID  8940189.
7. «Ген Entrez: регуляторный белок сплайсинга KHSRP KH-типа (связывающий белок 2 FUSE)».

дальнейшее чтение

• Доусон SJ, Белый LA (1992). «Лечение эндокардита Haemophilus aphrophilus ципрофлоксацином». J. Инфекция. 24 (3): 317–20. Дои:10.1016 / S0163-4453 (05) 80037-4. PMID  1602151.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Чоу М.Ю., Ладья N, Турк CW, Черный DL (1999). «hnRNP H является компонентом комплекса энхансера сплайсинга, который активирует альтернативный экзон c-src в нейрональных клетках». Мол. Клетка. Биол. 19 (1): 69–77. Дои:10.1128 / MCB.19.1.69. ЧВК  83866. PMID  9858532.
• Ring HZ, Vameghi-Meyers V, Nikolic JM и др. (1999). «Картирование гена KHSRP в области консервативной синтении на хромосоме 19p13.3 человека и хромосоме 17 мыши». Геномика. 56 (3): 350–2. Дои:10.1006 / geno.1998.5725. PMID  10087204.
• Леллек Х., Кирстен Р., Диль И. и др. (2000). «Очистка и молекулярное клонирование нового важного компонента ферментного комплекса, редактирующего мРНК аполипопротеина B». J. Biol. Chem. 275 (26): 19848–56. Дои:10.1074 / jbc.M001786200. PMID  10781591.
• Чоу М.Ю., Андервуд Дж. Г., Николич Дж. И др. (2000). «Связывание мультисайтовой РНК и высвобождение связывающего белка полипиримидинового тракта во время регуляции c-src нервно-специфического сплайсинга». Мол. Клетка. 5 (6): 949–57. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80260-9. PMID  10911989.
• Марковцов В., Николич Ю.М., Гольдман Ю.А. и др. (2000). «Совместная сборка комплекса hnRNP, индуцированная тканеспецифическим гомологом белка, связывающего полипиримидиновый тракт». Мол. Клетка. Биол. 20 (20): 7463–79. Дои:10.1128 / MCB.20.20.7463-7479.2000. ЧВК  86300. PMID  11003644.
• Chen CY, Gherzi R, Ong SE и др. (2002). «Связывающие белки AU рекрутируют экзосому для разрушения мРНК, содержащих ARE». Клетка. 107 (4): 451–64. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID  11719186. S2CID  14817671.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Холл МП, Хуанг С., Черный DL (2004). «Вызванная дифференцировкой совместная локализация регуляторного белка сплайсинга KH-типа с белком, связывающим полипиримидиновый тракт, и пре-мРНК c-src». Мол. Биол. Клетка. 15 (2): 774–86. Дои:10.1091 / mbc.E03-09-0692. ЧВК  329392. PMID  14657238.
• Герзи Р., Ли К. Ю., Бриата П. и др. (2004). «РНК-связывающий белок KH-домена, KSRP, способствует ARE-направленному обороту мРНК, задействуя механизм деградации». Мол. Клетка. 14 (5): 571–83. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.05.002. PMID  15175153.
• Suswam EA, Nabors LB, Huang Y и др. (2005). «IL-1beta индуцирует стабилизацию мРНК IL-8 в клетках злокачественного рака груди через 3'-нетранслируемую область: участие дивергентных РНК-связывающих факторов HuR, KSRP и TIAR». Int. J. Рак. 113 (6): 911–9. Дои:10.1002 / ijc.20675. PMID  15514971. S2CID  33272692.
• Wickham L, Benjannet S, Marcinkiewicz E, et al. (2005). «Бета-амилоидный белок, превращающий фермент 1 и специфический для мозга мембранный белок BRI3 типа II: партнеры по связыванию, обработанные фурином». J. Neurochem. 92 (1): 93–102. Дои:10.1111 / j.1471-4159.2004.02840.x. PMID  15606899. S2CID  36799858.
• Чоу К.Ф., Малки А., Майтра С. и др. (2006). «Привязка KSRP, белка, связывающего AU-богатые элементы, к мРНК, вызывает распад мРНК». Мол. Клетка. Биол. 26 (10): 3695–706. Дои:10.1128 / MCB.26.10.3695-3706.2006. ЧВК  1489004. PMID  16648466.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Герзи Р., Трабукки М., Понасси М. и др. (2007). «РНК-связывающий белок KSRP способствует распаду мРНК бета-катенина и инактивируется передачей сигналов PI3K-AKT». ПЛОС Биол. 5 (1): e5. Дои:10.1371 / journal.pbio.0050005. ЧВК  1702562. PMID  17177604.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.