КРЕМЕН1 - KREMEN1

КРЕМЕН1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 5FWS, 5FWT, 5FWV
Идентификаторы
Псевдонимы	КРЕМЕН1, KREMEN, KRM1, крингл, содержащий трансмембранный белок 1, ECTD13
Внешние идентификаторы	OMIM: 609898 MGI: 1933988 ГомолоГен: 12935 Генные карты: КРЕМЕН1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 22 (человек)[1] Группа 22q12.1 Начинать 29,073,078 бп[1] Конец 29,168,333 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 A1 Начинать 5,191,552 бп[2] Конец 5,261,558 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • клеточная мембрана • тело нейрональной клетки Биологический процесс • регуляция канонического пути передачи сигналов Wnt • сотовая связь • Сигнальный путь Wnt • апоптотический процесс • отрицательное регулирование окостенения • развитие конечностей • отрицательная регуляция канонического сигнального пути Wnt • отрицательная регуляция регенерации аксонов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	83999	84035
Ансамбль	ENSG00000183762	ENSMUSG00000020393
UniProt	Q96MU8	Q99N43
RefSeq (мРНК)	NM_001039570 NM_032045 NM_153379	NM_032396
RefSeq (белок)	NP_001034659 NP_114434	NP_115772
Расположение (UCSC)	Chr 22: 29.07 - 29.17 Мб	Chr 11: 5.19 - 5.26 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Кремень протеин 1 это белок что у людей кодируется КРЕМЕН1 ген.^[5][6] Кремень1 сохраняется в хордовых, включая амфиоксус^[7] и большинство позвоночных видов.^[8] Белок является трансмембранным рецептором типа I лигандов Dickkopf1,^[9] Dickkopf2, Dickkopf3, Dickkopf4, EpCAM^[10] и Rspondin1.

Функция

Этот ген кодирует высокоаффинный трансмембранный рецептор гомолога 1 dickkopf (DKK1), который функционально взаимодействует с DKK1, блокируя передачу сигналов бескрылого (WNT) / бета-катенина. Кодируемый белок является компонентом мембранного комплекса, который модулирует каноническую передачу сигналов WNT через белок 6, связанный с рецептором липопротеинов (LRP6). Он содержит внеклеточные крингл, WSC и CUB домены. Альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы, наблюдались для этого гена.^[6]

Kremen1 также участвует в индукции гибели клеток в результате апоптоза.^[8] Эта проапотическая активность условна и зависит от отсутствия лиганда Dickkopf1.^[8] Эти наблюдения привели к классификации этого белка как Рецептор зависимости.

Мышь из Кремень1 и ее паралог Кремень2 жизнеспособны и плодовиты.^[11]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000183762 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020393 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Накамура Т., Аоки С., Китадзима К., Такахаши Т., Мацумото К., Накамура Т. (март 2001 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика Кремена, нового трансмембранного белка, содержащего крингл». Biochim Biophys Acta. 1518 (1–2): 63–72. Дои:10.1016 / s0167-4781 (01) 00168-3. PMID  11267660.
6. «Ген Entrez: крингл KREMEN1, содержащий трансмембранный белок 1».
7. Чжан, Юйцзюнь; Мао Бинюй (01.09.2010). «Эмбриональная экспрессия и эволюционный анализ генов семейства Amphioxus Dickkopf и Kremen». Журнал генетики и геномики = И Чуань Сюэ Бао. 37 (9): 637–645. Дои:10.1016 / S1673-8527 (09) 60082-5. ISSN  1673-8527. PMID  20933216.
8. Causeret, F .; Sumia, I .; Пиерани, А. (01.02.2016). «Kremen1 и Dickkopf1 контролируют выживаемость клеток независимо от Wnt». Гибель клеток и дифференциация. 23 (2): 323–332. Дои:10.1038 / cdd.2015.100. ISSN  1476-5403. ЧВК  4716294. PMID  26206087.
9. Мао, Бинюй; Ву, Вэй; Дэвидсон, Гэри; Мархольд, Иоахим; Ли, Минфа; Mechler, Bernard M .; Делиус, Хаджо; Хоппе, Дана; Станнек, Питер (2002-06-06). «Белки Кремена представляют собой рецепторы Диккопфа, которые регулируют передачу сигналов Wnt / бета-катенина». Природа. 417 (6889): 664–667. Дои:10.1038 / природа756. ISSN  0028-0836. PMID  12050670.
10. Лу, Хуэцян; Ма, июнь; Ян, Юнь; Ши, Венчао; Ло, Линфэй (2013-03-11). «EpCAM - это специфический для энтодермы депрессор Wnt, который лицензирует развитие печени». Клетка развития. 24 (5): 543–553. Дои:10.1016 / j.devcel.2013.01.021. ISSN  1878-1551. PMID  23484855.
11. Элвангер, Кристина; Сайто, Хироаки; Клеман-Лакруа, Филипп; Мальтри, Николь; Нидермейер, Иоахим; Ли, Вун Гю; Барон, Роланд; Равади, Жорж; Вестфаль, Хайнер (1 августа 2008 г.). «Целенаправленное нарушение регулятора Wnt Кремень вызывает дефекты конечностей и высокую плотность костной ткани». Молекулярная и клеточная биология. 28 (15): 4875–4882. Дои:10.1128 / MCB.00222-08. ISSN  1098-5549. ЧВК  2493355. PMID  18505822.

дальнейшее чтение

• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С. и др. (2005). «Характеристика транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Nat. Биотехнология. 22 (6): 707–16. Дои:10.1038 / nbt971. PMID  15146197.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Мао Б., Ву В., Дэвидсон Г. и др. (2002). «Белки Кремена представляют собой рецепторы Диккопфа, которые регулируют передачу сигналов Wnt / бета-катенина». Природа. 417 (6889): 664–7. Дои:10.1038 / природа756. PMID  12050670.
• Диас Нето Э., Корреа Р.Г., Верджовски-Алмейда С. и др. (2000). «Секвенирование человеческого транскриптома с использованием тегов последовательности, экспрессируемой ORF». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (7): 3491–6. Дои:10.1073 / pnas.97.7.3491. ЧВК  16267. PMID  10737800.
• Данэм И., Шимицу Н., Роу Б.А. и др. (1999). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Дои:10.1038/990031. PMID  10591208.