L1TD1 - L1TD1

L1TD1
Белок L1TD1 PDB 3soo.png
Доступные конструкции
PDBПоиск Human UniProt: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыL1TD1, ECAT11, домен транспозазы типа LINE-1, содержащий 1, домен транспозазы типа LINE1, содержащий 1
Внешние идентификаторыГомолоГен: 136289 Генные карты: L1TD1
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение L1TD1
Геномное расположение L1TD1
Группа1п31.3Начинать62,194,849 бп[1]
Конец62,212,328 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE L1TD1 1457314 at.png

PBB GE L1TD1 219955 at.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_019079
NM_001164835

н / д

RefSeq (белок)

NP_001158307
NP_061952

н / д

Расположение (UCSC)Chr 1: 62.19 - 62.21 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Транспозазный домен типа LINE-1, содержащий 1, также известный как L1TD1, является РНК-связывающий белок что связано с самообновлением недифференцированных человеческих эмбриональные стволовые клетки и раковая клетка распространение. Сообщается, что L1TD1 связан с разработкой нескольких раки.[3][4][5][6]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000240563 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ Ивабучи К.А., Ямакава Т., Сато Ю., Ичисака Т., Такахаши К., Окита К., Яманака С. (май 2011 г.). «ECAT11 / L1td1 обогащен ESC и быстро активируется во время генерации iPSC, но он незаменим для поддержания и индукции плюрипотентности». PLOS ONE. 6 (5): e20461. Дои:10.1371 / journal.pone.0020461. ЧВК  3102727. PMID  21637830.
  4. ^ Нярва Э, Рахконен Н., Эмани М. Р., Лунд Р., Пурсихеймо Дж. П., Нэсти Дж., Аутио Р., Расул О, Денессиук К., Ляхдесмяки Х., Рао А., Лахесмаа Р. (март 2012 г.). «РНК-связывающий белок L1TD1 взаимодействует с LIN28 через РНК и необходим для самообновления эмбриональных стволовых клеток человека и пролиферации раковых клеток». Стволовые клетки. 30 (3): 452–60. Дои:10.1002 / стержень.1013. ЧВК  3507993. PMID  22162396.
  5. ^ Вонг Р.К., Ибрагим А., Фонг Х., Томпсон Н., Лок Л.Ф., Донован П.Дж. (апрель 2011 г.). «L1TD1 - маркер недифференцированных эмбриональных стволовых клеток человека». PLOS ONE. 6 (4): e19355. Дои:10.1371 / journal.pone.0019355. ЧВК  3084827. PMID  21559406.
  6. ^ Ямамото Э, Тойота М, Сузуки Х, Кондо Й, Саномура Т, Мураяма Й, Охе-Тойота М, Маруяма Р, Нодзима М, Ашида М, Фуджи К., Сасаки Й, Хаяши Н., Мори М, Имаи К., Токино Т, Шиномура Y (октябрь 2008 г.). «Гипометилирование LINE-1 связано с повышенным метилированием CpG-островков при гастрите увеличенной складки, связанном с Helicobacter pylori». Биомаркеры эпидемиологии рака Пред.. 17 (10): 2555–64. Дои:10.1158 / 1055-9965.EPI-08-0112. PMID  18842996.

дальнейшее чтение