LACTB2 - LACTB2

LACTB2
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыLACTB2, CGI-83, бета-лактамаза 2
Внешние идентификаторыMGI: 2442551 ГомолоГен: 9349 Генные карты: LACTB2
Расположение гена (человек)
Хромосома 8 (человек)
Chr.Хромосома 8 (человек)[1]
Хромосома 8 (человек)
Геномное расположение LACTB2
Геномное расположение LACTB2
Группа8q13.3Начинать70,635,318 бп[1]
Конец70,669,185 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_016027

NM_145381

RefSeq (белок)

NP_057111

NP_663356

Расположение (UCSC)Chr 8: 70.64 - 70.67 МбChr 1: 13.62 - 13.66 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Лактамаза, бета 2 это белок что у человека кодируется LACTB2 ген.[5]

Структура

LACTB2 расположен на 8-й хромосоме, а его конкретное местоположение - 8q13.3. Ген содержит 7 экзонов.[5]

В Белок LACTB2 имеет металл-β-лактамазную складку (MBL) с двумя ионами цинка в активном центре.

Функция

Металло-бета-лактамазы впервые были идентифицированы у бактерий; они придают некоторым штаммам устойчивость к антибиотикам за счет разложения бета-лактамных антибиотиков (например, пенициллинов). Однако семейство белков включает в себя множество членов, которые представляют собой рибонуклеазы (РНКазы), дезоксирибонуклеазы (ДНКазы) и другие метаболические ферменты. [6] Рибонуклеазы MBL отвечают за процессинг РНК, генерируя 3'-конец тРНК, (РНКаза Z [7]) мРНК эукариот (CPSF-73 ) и молекулы мяРНК [8] LACTB2 - митохондриальная эндорибонуклеаза, которая может играть роль в деградации митохондриальных мРНК.[9]

Клиническое значение

Опухоль-специфичное слияние LACTB2-NCOA2, происходящее в результате внутрихромосомной перестройки хромосомы 8, было идентифицировано как на уровне ДНК, так и на уровне РНК. В отличие от обычных онкогенных химерных белков, в продукте слияния отсутствует функциональный домен соответствующих генов, что свидетельствует об аморфной перестройке. Этот химерный транскрипт LACTB2-NCOA2 был обнаружен в 6 из 99 (6,1%) случаев колоректального рака (CRC), где уровень NCOA2 был значительно снижен. Принудительное выражение дикого типа NCOA2 но не слитый белок LACTB2-NCOA2 нарушал про-туморогенные фенотипы клеток CRC, тогда как нокдаун эндогенного NCOA2 в нормальных колоноцитах имел противоположные эффекты. Механически NCOA2 ингибирует передачу сигналов Wnt / β-catenin посредством одновременного усиления ингибиторов и подавления стимуляторов пути Wnt / β-catenin. NCOA2 представляет собой новый негативный ген, регулирующий рост, репрессирующий путь Wnt / β-catenin в CRC, где повторяющееся слияние с LACTB2 способствует его нарушению.[10]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000147592 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025937 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Энтрез Ген: лактамаза, бета 2». Получено 2015-07-07.
  6. ^ Dominski Z (2007-03-01). «Нуклеазы семейства металло-бета-лактамаз и их роль в метаболизме ДНК и РНК». Критические обзоры в биохимии и молекулярной биологии. 42 (2): 67–93. Дои:10.1080/10409230701279118. PMID  17453916. S2CID  26906168.
  7. ^ Фогель А., Шиллинг О., Шпет Б., Марчфельдер А. (декабрь 2005 г.). «Семейство белков тРНКазы Z: физиологические функции, субстратная специфичность и структурные свойства». Биологическая химия. 386 (12): 1253–64. Дои:10.1515 / BC.2005.142. PMID  16336119. S2CID  22522356.
  8. ^ Альбрехт Т.Р., Вагнер Э.Дж. (март 2012 г.). «Образование 3 'конца мяРНК требует гетеродимерной ассоциации субъединиц интегратора». Молекулярная и клеточная биология. 32 (6): 1112–23. Дои:10.1128 / MCB.06511-11. ЧВК  3295014. PMID  22252320.
  9. ^ Леви С., Аллерстон С.К., Ливяну В., Хабиб М.Р., Гилеади О., Шустер Г. (февраль 2016 г.). «Идентификация LACTB2, белка металло-β-лактамазы, как митохондриальной эндорибонуклеазы человека». Исследования нуклеиновых кислот. 44 (4): 1813–32. Дои:10.1093 / nar / gkw050. ЧВК  4770246. PMID  26826708.
  10. ^ Yu J, Wu WK, Liang Q, Zhang N, He J, Li X, Zhang X, Xu L, Chan MT, Ng SS, Sung JJ (январь 2016 г.). «Нарушение NCOA2 рецидивирующим слиянием с LACTB2 при колоректальном раке». Онкоген. 35 (2): 187–95. Дои:10.1038 / onc.2015.72. ЧВК  4717154. PMID  25823027.