ЛЕКТИ - LEKTI

SPINK5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1H0Z, 1HDL, 1UUC, 1UVF, 1UVG
Идентификаторы
Псевдонимы	SPINK5, ЛЕКТИ, ЛЕТКИ, НЕТС, НС, ВАКТИ, ингибитор сериновой пептидазы, Казал типа 5, ингибитор сериновой пептидазы Казал типа 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 605010 MGI: 1919682 ГомолоГен: 4987 Генные карты: SPINK5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q32 Начните 148,025,683 бп[1] Конец 148,137,289 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 18 (мышь)[2] Группа 18 B3 | 18 23,74 см Начните 43,963,235 бп[2] Конец 44,022,501 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность ингибитора пептидазы • активность ингибитора эндопептидазы серинового типа Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • мембрана эндоплазматического ретикулума • клеточная кора • эндоплазматический ретикулум • перинуклеарная область цитоплазмы • эпидермальное пластинчатое тело • внеклеточная область • внутриклеточная мембраносвязанная органелла Биологический процесс • дифференцировка эпидермальных клеток • отрицательная регуляция протеолиза • отрицательная регуляция активности пептидазы серинового типа • отрицательная регуляция активности пептидазы • дифференцировка эпителиальных клеток • дифференциация волосковых клеток • организация внеклеточного матрикса • отрицательное регулирование выработки антибактериальных пептидов • отрицательная регуляция иммунного ответа • регуляция клеточной адгезии • отрицательная регуляция ангиогенеза • отрицательная регуляция активности эндопептидазы серинового типа • регуляция дифференцировки Т-клеток • ороговение • регулирование сроков анагена Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	11005	72432
Ансамбль	ENSG00000133710	ENSMUSG00000055561
UniProt	Q9NQ38	Q148R4
RefSeq (мРНК)	NM_001127698 NM_001127699 NM_006846	NM_001081180
RefSeq (белок)	NP_001121170 NP_001121171 NP_006837	NP_001074649
Расположение (UCSC)	Chr 5: 148.03 - 148.14 Мб	Chr 18: 43.96 - 44.02 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Лимфоэпителиальный ингибитор типа Kazal (LEKTI) также известный как ингибитор сериновой протеазы Казал-тип 5 (SPINK5) - это белок что у людей кодируется SPINK5 ген.^[5][6]

Структура и функции

LEKTI - крупная многодоменная сериновая протеаза ингибитор экспрессируется в многослойной эпителиальной ткани. Он состоит из 15 доменов, которые расщепляются протеазой на более мелкие функциональные фрагменты. фурин. Только две из этих областей (2 и 15) содержат 6 равномерно расположенных цистеины отвечает за 3 внутримолекулярных дисульфидные связи характеристика Ингибиторы, связанные с казалом. Остальные домены содержат 4 цистеина.^[7] Эти дисульфидные связи заставляют молекулу принимать жесткую конформацию, которая позволяет белку взаимодействовать с протеазой-мишенью через расширенную бета-лист. Все домены (кроме 1, 2 и 15) содержат аргинин на P1, указывая на то, что вероятными мишенями являются трипсиноподобные протеазы.^[7]

В эпидермисе LEKTI участвует в регуляции шелушение благодаря его способности избирательно подавлять KLK5, KLK7 и KLK14.^[8] Рекомбинантный полноразмерный LEKTI ингибирует экзогенные сериновые протеазы трипсин, плазмин, субтилизин А, катепсин G и нейтрофилы человека эластаза.^[9]

LEKTI может играть роль в морфогенезе кожи и волос, а также в противовоспалительной и / или антимикробной защите слизистого эпителия.^[6]

Ген

SPINK5 входит в семейный кластер генов, расположенный на хромосома 5q32,^[10] которые кодируют ингибиторы сериновых протеаз. Это включает другие эпидермальные белки SPINK6 и ЛЭКТИ-2 (SPINK9). В SPINK5 ген имеет длину 61 т.п.н. и содержит 33 экзона.^[7] Альтернативная обработка SPINK5 приводит к образованию трех различных генных продуктов, которые были идентифицированы в дифференцированных кератиноцитах.^[11]

Клиническое значение

Мутации в гене SPINK5 приводят к Синдром Нетертона, расстройство, характеризующееся ихтиоз и специфические дефекты иммунной системы.^[6]

Смотрите также

• Домен ингибитора сериновой протеазы Kazal-типа

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000133710 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000055561 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Magert HJ, Standker L, Kreutzmann P, Zucht HD, Reinecke M, Sommerhoff CP, Fritz H, Forssmann WG (август 1999 г.). «LEKTI, новый 15-доменный ингибитор сериновой протеиназы человека». J Biol Chem. 274 (31): 21499–502. Дои:10.1074 / jbc.274.31.21499. PMID  10419450.
6. «Entrez Gene: ингибитор сериновой пептидазы SPINK5, Kazal типа 5».
7. Фурио Л., Овнанян А. (ноябрь 2011 г.). «Когда активность требует разрыва: каскад протеолитической активации LEKTI для специфического ингибирования протеиназ». J Invest Dermatol. 131 (11): 2169–73. Дои:10.1038 / jid.2011.295. PMID  21997416.
8. Дерайсон С., Боннар С., Лопес Ф., Бессон С., Робинсон Р., Джаякумар А., Вагберг Ф., Браттсанд М., Хашем Дж. П., Леонардссон Г., Овнанян А. (сентябрь 2007 г.). «Фрагменты LEKTI специфически ингибируют KLK5, KLK7 и KLK14 и контролируют десквамацию посредством pH-зависимого взаимодействия». Мол. Биол. Ячейка. 18 (9): 3607–19. Дои:10.1091 / mbc.E07-02-0124. ЧВК  1951746. PMID  17596512.
9. Мицудо К., Джаякумар А., Хендерсон Ю., Фредерик М.Дж., Кан И., Ван М., Эль-Наггар А.К., Клейман Г.Л. (апрель 2003 г.). «Ингибирование сериновых протеиназ плазмина, трипсина, субтилизина А, катепсина G и эластазы с помощью LEKTI: кинетический анализ». Биохимия. 42 (13): 3874–81. Дои:10.1021 / bi027029v. PMID  12667078.
10. «Ингибитор сериновой пептидазы SPINK5, Kazal типа 5 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI».
11. Тарталья-Польчини А., Боннар С., Микелони А., Чианфарани Ф., Андре А., Замбруно Г., Овнанян А., Д'Алессио М. (февраль 2006 г.). «SPINK5, дефектный ген при синдроме Нетертона, кодирует несколько изоформ LEKTI, полученных в результате альтернативного процессинга пре-мРНК». J Invest Dermatol. 126 (2): 315–24. Дои:10.1038 / sj.jid.5700015. PMID  16374478.

дальнейшее чтение

• Норгетт EE, Келселл Д.П. (2002). «СПИНК5: и редкое, и распространенное кожное заболевание». Тенденции в молекулярной медицине. 8 (1): 7. Дои:10.1016 / S1471-4914 (01) 02228-6. PMID  11796258.
• Mägert HJ, Kreutzmann P, Ständker L, et al. (2002). «LEKTI: мультидоменный ингибитор сериновой протеиназы с патофизиологическим значением». Int. J. Biochem. Cell Biol. 34 (6): 573–6. Дои:10.1016 / S1357-2725 (01) 00179-0. PMID  11943586.
• Вальден М., Кройцманн П., Дрогемюллер К. и др. (2003). «Биохимические особенности, молекулярная биология и клиническая значимость человеческого 15-доменного ингибитора сериновой протеиназы LEKTI». Биол. Chem. 383 (7–8): 1139–41. Дои:10.1515 / BC.2002.124. PMID  12437098. S2CID  26084613.
• Чаванас С., Гарнер С., Бодемер С. и др. (2000). «Локализация гена синдрома Нетертона на хромосоме 5q32 с помощью анализа сцепления и картирования гомозиготности». Am. J. Hum. Genet. 66 (3): 914–21. Дои:10.1086/302824. ЧВК  1288172. PMID  10712206.
• Чаванас С., Бодемер С., Рошат А. и др. (2000). «Мутации в SPINK5, кодирующем ингибитор сериновой протеазы, вызывают синдром Нетертона». Nat. Genet. 25 (2): 141–2. Дои:10.1038/75977. PMID  10835624. S2CID  40421711.
• Sprecher E, Chavanas S, DiGiovanna JJ, et al. (2001). «Спектр патогенных мутаций в SPINK5 в 19 семьях с синдромом Нетертона: значение для обнаружения мутаций и первого случая пренатальной диагностики». J. Invest. Дерматол. 117 (2): 179–87. Дои:10.1046 / j.1523-1747.2001.01389.x. PMID  11511292.
• Уолли А.Дж., Чаванас С., Моффатт М.Ф. и др. (2001). «Полиморфизм генов в Нетертоне и распространенное атопическое заболевание». Nat. Genet. 29 (2): 175–8. Дои:10,1038 / ng728. PMID  11544479. S2CID  20292050.
• Ахмед А., Кандола П., Зиада Г., Парентеу Н. (2002). «Очистка и частичная аминокислотная последовательность белков из кондиционированной среды эпидермальных кератиноцитов человека». J. Protein Chem. 20 (4): 273–8. Дои:10.1023 / А: 1010902815953. PMID  11594460. S2CID  11877191.
• Битун Э., Чаванас С., Ирвин А.Д. и др. (2002). «Синдром Нетертона: проявление болезни и спектр мутаций SPINK5 в 21 семье». J. Invest. Дерматол. 118 (2): 352–61. Дои:10.1046 / j.1523-1747.2002.01603.x. PMID  11841556.
• Komatsu N, Takata M, Otsuki N и др. (2002). «Повышенная гидролитическая активность рогового слоя при синдроме Нетертона предполагает ингибирующую регуляцию десквамации пептидами, производными SPINK5». J. Invest. Дерматол. 118 (3): 436–43. Дои:10.1046 / j.0022-202x.2001.01663.x. PMID  11874482.
• Битоун Э., Микелони А., Ламант Л. и др. (2004). «Протеолитический процессинг LEKTI в первичных кератиноцитах человека, тканевое распределение и дефектная экспрессия при синдроме Нетертона». Гм. Мол. Genet. 12 (19): 2417–30. Дои:10.1093 / hmg / ddg247. PMID  12915442.
• Nishio Y, Noguchi E, Shibasaki M, et al. (2004). «Связь между полиморфизмом гена SPINK5 и атопическим дерматитом у японцев». Гены иммунной. 4 (7): 515–7. Дои:10.1038 / sj.gene.6363889. PMID  14551605.
• Рагхунатх М., Тонциду Л., Оджи В. и др. (2004). «SPINK5 и синдром Нетертона: новые мутации, демонстрация отсутствия LEKTI и дифференциальная экспрессия трансглутаминаз». J. Invest. Дерматол. 123 (3): 474–83. Дои:10.1111 / j.0022-202X.2004.23220.x. PMID  15304086.
• Тидоу Х., Лаубер Т., Витцитум К. и др. (2004). «Структура раствора химерного домена LEKTI раскрывает последовательность хамелеона» (PDF). Биохимия. 43 (35): 11238–47. Дои:10.1021 / bi0492399. PMID  15366933.
• Ян Т., Лян Д., Кох П.Дж. и др. (2004). «Эпидермальная отслойка, десмосомная диссоциация и дестабилизация корнеодесмозина у мышей Spink5 - / -». Genes Dev. 18 (19): 2354–8. Дои:10.1101 / gad.1232104. ЧВК  522985. PMID  15466487.
• Исида-Ямамото А., Дерасон С., Боннар С. и др. (2005). «LEKTI локализуется в пластинчатых гранулах, отделенных от KLK5 и KLK7, и секретируется во внеклеточные пространства поверхностного гранулированного слоя». J. Invest. Дерматол. 124 (2): 360–6. Дои:10.1111 / j.0022-202X.2004.23583.x. PMID  15675955.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q9NQ38 (Ингибитор сериновой протеазы Казал-тип 5) на PDBe-KB.