LIME1 - LIME1

LIME1
Идентификаторы
Псевдонимы	LIME1, LIME, LP8067, dJ583P15.4, Lck взаимодействующий трансмембранный адаптер 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 609809 MGI: 1919949 ГомолоГен: 56785 Генные карты: LIME1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q13.33 Начинать 63,736,283 бп[1] Конец 63,739,103 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 H4 Начинать 181,380,078 бп[2] Конец 181,383,628 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание протеинкиназы Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • клеточная мембрана • мембрана • внеклеточный • Сплайсосомный комплекс пост-мРНК высвобождения U2-типа • В-клеточный рецепторный комплекс Биологический процесс • Путь передачи сигналов рецептора В-клеток • Путь передачи сигналов рецептора Т-клеток • адаптивный иммунный ответ • иммунная система • разборка сплайсосомального комплекса • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция передачи сигналов фосфатидилинозитол-3-киназы • регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • регуляция активности киназы MAP • регулирование высвобождения секвестрированного иона кальция в цитозоль • регуляция передачи сигналов NIK / NF-kappaB Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	54923	72699
Ансамбль	ENSG00000203896	ENSMUSG00000090077
UniProt	Q9H400	Q9EQR5
RefSeq (мРНК)	NM_017806 NM_001305654 NM_001305655	NM_023684
RefSeq (белок)	NP_001292583 NP_001292584 NP_060276	NP_076173
Расположение (UCSC)	Chr 20: 63,74 - 63,74 Мб	Chr 2: 181.38 - 181.38 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Lck-взаимодействующий трансмембранный адаптер 1 это белок что у людей кодируется LIME1 ген.^[5][6]

LIME1 - трансмембранный адаптер, связанный с плотом фосфопротеин что предпочтительно выражается в кроветворный клетки, в частности Т-клетки (Brdickova et al., 2003; Hur et al., 2003) [предоставлено OMIM]^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000203896 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000090077 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T. , Макс С.И., Ван Дж., Се Ф., Дьяченко Л., Марусина К., Фармер А.А., Рубин Г.М., Хонг Л., Стэплтон М., Соарес МБ, Боналдо М.Ф., Казавант Т.Л., Шитц Т.Э., Браунштейн М.Дж., Усдин Т.Б., Тошиюки С., Карнинчи П, Прейндж С., Раха С.С., Локеллано Н.А., Питерс Дж. Дж., Абрамсон Р. Д., Муллахи С. Дж., Босак С. А., МакЭван П. Дж., МакКернан К. Дж., Малек Дж. А., Гунаратне П. Х., Ричардс С., Уорли К. К., Хейл С., Гарсия А. М., Гей Л. Дж., Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG , Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (декабрь 2002). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
6. "Entrez Gene: LIME1 Lck взаимодействующий трансмембранный адаптер 1".

дальнейшее чтение

• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.
• Hur EM, Son M, Lee OH и др. (2004). «LIME, новый трансмембранный адаптерный белок, ассоциирует с p56lck и опосредует активацию Т-клеток». J. Exp. Med. 198 (10): 1463–73. Дои:10.1084 / jem.20030232. ЧВК  2194117. PMID  14610044.
• Brdicková N, Brdicka T., Angelisová P, et al. (2004). «LIME: новый белок-адаптер, связанный с мембранным рафтом, участвующий в передаче сигналов корецепторов CD4 и CD8». J. Exp. Med. 198 (10): 1453–62. Дои:10.1084 / jem.20031484. ЧВК  2194115. PMID  14610046.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Сузуки Ю., Ямасита Р., Широта М. и др. (2004). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях». Genome Res. 14 (9): 1711–8. Дои:10.1101 / гр.2435604. ЧВК  515316. PMID  15342556.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ван Д., Гонг И, Цинь В. и др. (2004). «Крупномасштабный скрининг трансфекции кДНК генов, связанных с развитием и прогрессированием рака». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (44): 15724–9. Дои:10.1073 / pnas.0404089101. ЧВК  524842. PMID  15498874.
• Тедольди С., Патерсон Дж. С., Хансманн М.Л. и др. (2006). «Трансмембранные адаптерные молекулы: новая категория маркеров лимфоидных клеток». Кровь. 107 (1): 213–21. Дои:10.1182 / кровь-2005-06-2273. PMID  16160011.
• Ан Э, Ли Х, Юн И (2006). «LIME действует как трансмембранный адаптер, опосредующий BCR-зависимую активацию B-клеток». Кровь. 107 (4): 1521–7. Дои:10.1182 / кровь-2005-05-1859. PMID  16249387.