LIMK2 - LIMK2 - Wikipedia

LIMK2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1X6A, 4TPT
Идентификаторы
Псевдонимы	LIMK2, LIM-домен киназы 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 601988 MGI: 1197517 ГомолоГен: 55911 Генные карты: LIMK2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 22 (человек)[1] Группа 22q12.2 Начинать 31,212,239 бп[1] Конец 31,280,080 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 A1 Начинать 3,344,256 бп[2] Конец 3,409,189 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность протеин-серин / треонинкиназы • Связывание АТФ • GO: 0001948 связывание с белками • активность гетеродимеризации белков • связывание нуклеотидов • киназная активность • связывание ионов металлов • активность протеинкиназы • трансферазная активность • активность преобразователя сигнала Сотовый компонент • ядро клетки • цитоплазма • сеть цис-Гольджи Биологический процесс • фосфорилирование белков • сперматогенез • фосфорилирование • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • развитие головы • развитие роговицы в глазу камерного типа • организация актинового цитоскелета Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3985	16886
Ансамбль	ENSG00000182541	ENSMUSG00000020451
UniProt	P53671	O54785
RefSeq (мРНК)	NM_016733 NM_001031801 NM_005569	NM_001034030 NM_010718 NM_173053 NM_001361623
RefSeq (белок)	NP_001026971 NP_005560 NP_057952	NP_001029202 NP_034848 NP_774958 NP_001348552
Расположение (UCSC)	Chr 22: 31.21 - 31.28 Мб	Chr 11: 3.34 - 3.41 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

LIM-домен киназы 2 является фермент что у людей кодируется LIMK2 ген.^[5][6][7]

Функция

Существует около 40 известных эукариотических белков LIM, названных так в честь LIM домены в них содержатся. LIM-домены представляют собой высококонсервативные богатые цистеином структуры, содержащие 2 цинковых пальца. Хотя цинковые пальцы обычно функционируют путем связывания с ДНК или РНК, мотив LIM, вероятно, опосредует белок-белковые взаимодействия. LIM-киназа-1 и LIM-киназа-2 принадлежат к небольшому подсемейству с уникальной комбинацией 2 N-концевых мотивов LIM и С-концевого домена протеинкиназы. Белок, кодируемый этим геном, фосфорилируется и активируется с помощью ROCK, нижестоящего эффектора Rho, а кодируемый белок, в свою очередь, фосфорилирует кофилин, ингибируя его активность деполимеризации актина. Считается, что этот путь способствует Rho-индуцированной реорганизации актинового цитоскелета. Для этого гена были обнаружены по крайней мере три варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000182541 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020451 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Окано И., Хираока Дж., Отера Х, Нуноуэ К., Охаши К., Ивашита С., Хираи М., Мидзуно К. (декабрь 1995 г.). «Идентификация и характеристика нового семейства серин / треониновых киназ, содержащих два N-концевых мотива LIM». Журнал биологической химии. 270 (52): 31321–30. Дои:10.1074 / jbc.270.52.31321. PMID  8537403.
6. Данхэм И., Шимидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж. Э., Брускевич Р., Биэр Д.М., Зажим М., Сминк Л.Дж., Эйнскау Р., Алмейда Дж. П., Бэббидж А., Баггулей С., Бейли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бисли О., Берд С. П., Блейки С., Бриджман А. М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В. Д., О'Брайен КП (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Дои:10.1038/990031. PMID  10591208.
7. "Ген Entrez: LIMK2 LIM-домен киназы 2".

дальнейшее чтение

• Скотт Р.В., Олсон М.Ф. (июнь 2007 г.). «Киназы LIM: функция, регуляция и связь с заболеванием человека». Журнал молекулярной медицины. 85 (6): 555–68. Дои:10.1007 / s00109-007-0165-6. PMID  17294230.
• Осада Х., Хасада К., Инадзава Дж., Учида К., Уэда Р., Такахаши Т., Такахаши Т. (13 декабря 1996 г.). «Субклеточная локализация и взаимодействие белков человеческого гена LIMK2, экспрессирующего альтернативные транскрипты с тканеспецифической регуляцией». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 229 (2): 582–9. Дои:10.1006 / bbrc.1996.1847. PMID  8954941.
• Хираока Дж., Окано И., Хигучи О, Ян Н., Мидзуно К. (9 декабря 1996 г.). «Самоассоциация LIM-киназы 1, опосредованная взаимодействием между N-концевым доменом LIM и C-концевым доменом киназы». Письма FEBS. 399 (1–2): 117–21. Дои:10.1016 / S0014-5793 (96) 01303-8. PMID  8980133.
• Ян Н, Хигучи О, Охаши К., Нагата К., Вада А., Кангава К., Нисида Е., Мидзуно К. (июнь 1998 г.). «Фосфорилирование кофилина с помощью LIM-киназы 1 и его роль в Rac-опосредованной реорганизации актина». Природа. 393 (6687): 809–12. Дои:10.1038/31735. PMID  9655398.
• Номото С., Татемацу Й., Такахаши Т., Осада Х. (август 1999 г.). «Клонирование и характеристика альтернативных промоторных областей гена LIMK2 человека, ответственных за альтернативные транскрипты с тканеспецифической экспрессией». Ген. 236 (2): 259–71. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00280-2. PMID  10452946.
• Суми Т., Мацумото К., Такай Ю., Накамура Т. (27 декабря 1999 г.). «Фосфорилирование кофилина и динамика цитоскелета актина регулируются rho- и Cdc42-активированной LIM-киназой 2». Журнал клеточной биологии. 147 (7): 1519–32. Дои:10.1083 / jcb.147.7.1519. ЧВК  2174243. PMID  10613909.
• Суми Т., Мацумото К., Накамура Т. (январь 2001 г.). «Специфическая активация LIM-киназы 2 посредством фосфорилирования треонина 505 с помощью ROCK, Rho-зависимой протеинкиназы». Журнал биологической химии. 276 (1): 670–6. Дои:10.1074 / jbc.M007074200. PMID  11018042.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Амано Т., Танабэ К., Это Т., Нарумия С., Мизуно К. (февраль 2001 г.). «LIM-киназа 2 индуцирует образование стрессовых волокон, очаговых адгезий и мембранных пузырьков, в зависимости от ее активации Rho-ассоциированным фосфорилированием киназы по треонину-505». Биохимический журнал. 354 (Pt 1): 149–59. Дои:10.1042/0264-6021:3540149. ЧВК  1221639. PMID  11171090.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Суми Т., Мацумото К., Сибуя А., Накамура Т. (июнь 2001 г.). «Активация киназ LIM киназой миотонической дистрофии, связанной с Cdc42-связывающей киназой альфа». Журнал биологической химии. 276 (25): 23092–6. Дои:10.1074 / jbc.C100196200. PMID  11340065.
• Тошима Дж., Тошима Дж. Ю., Такеучи К., Мори Р., Мизуно К. (август 2001 г.). «Активность фосфорилирования кофилина и реорганизации актина тестикулярной протеинкиназы 2 и ее преобладающая экспрессия в клетках Сертоли яичек». Журнал биологической химии. 276 (33): 31449–58. Дои:10.1074 / jbc.M102988200. PMID  11418599.
• Колланд Ф., Жак Икс, Троплин В., Мужен С., Грозело С., Гамбург А., Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Дж. М. (июль 2004 г.). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Геномные исследования. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс Калифорния, Депутат Дэвиса, Гринхэм Дж. А., Коул К. Г., Говард М. Е., Агуадо Б., Малля М., Мокраб И., Хакл Е. Д., Биэр Д. М., Данхэм I. «Основанный на аннотации генома подход к клонированию ORFeome человека». Геномная биология. 5 (10): R84. Дои:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. ЧВК  545604. PMID  15461802.
• Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Вардули Л., Мустакас А., Стурнарас С. (март 2005 г.). «LIM-киназа 2 и фосфорилирование кофилина опосредуют реорганизацию актинового цитоскелета, индуцированную трансформирующим фактором роста-бета». Журнал биологической химии. 280 (12): 11448–57. Дои:10.1074 / jbc.M402651200. PMID  15647284.

внешняя ссылка

• LIMK2 Информация со ссылками в Шлюз миграции ячеек