LMO7 - LMO7

LMO7
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2EAQ
Идентификаторы
Псевдонимы	LMO7, FBX20, FBXO20, LOMP, LIM, домен 7, LMO7b
Внешние идентификаторы	OMIM: 604362 MGI: 1353586 ГомолоГен: 83924 Генные карты: LMO7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 13 (человек)[1] Группа 13q22.2 Начните 75,620,434 бп[1] Конец 75,859,870 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 14 (мышь)[2] Группа 14 E2.3 | 14 50,9 см Начните 101,729,957 бп[2] Конец 101,934,710 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • активность убиквитин-протеинтрансферазы • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции Сотовый компонент • цитоплазма • убиквитинлигазный комплекс • ядро клетки • очаговая адгезия • цитозоль • ядерная оболочка • поверхность клетки • апикальная плазматическая мембрана Биологический процесс • регуляция клеточной адгезии • убиквитинирование белков • регулирование сигнализации • полиубиквитинирование белков • посттрансляционная модификация • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4008	380928
Ансамбль	ENSG00000136153	ENSMUSG00000033060
UniProt	Q8WWI1	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001306080 NM_005358 NM_015842 NM_015843 NM_001330583	NM_201529 NM_001347628
RefSeq (белок)	NP_001293009 NP_001317512 NP_005349 NP_056667 NP_001353561 NP_001353562 NP_001353563 NP_001353565 NP_001293009.1	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 13: 75,62 - 75,86 Мб	Chr 14: 101,73 - 101,93 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

LIM домен только белок 7 это белок что у людей кодируется LMO7 ген.^[5][6][7]

Этот ген кодирует белок, содержащий кальпонин гомологии (CH), a PDZ домен, а LIM домен. Домен F-бокса (FBX) присутствует в альтернативных вариантах сплайсинга. Члены семейства белков LIM несут домен LIM, уникальный цинк-связывающий домен, богатый цистеином. Члены Белок FBX семьи участвуют в белок-белковых взаимодействиях. Кодируемый белок может участвовать во взаимодействиях белок-белок. Было описано множество альтернативных вариантов сплайсинга, но их полноразмерные последовательности не определены.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000136153 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033060 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Путилина Т., Яворски С., Джентльмен С., Макдональд Б., Кадири М., Вонг П. (декабрь 1998 г.). «Анализ кДНК человека, содержащей тканеспецифичный альтернативно сплайсированный домен LIM». Biochem Biophys Res Commun. 252 (2): 433–9. Дои:10.1006 / bbrc.1998.9656. PMID  9826547.
6. Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (декабрь 1999 г.). «Идентификация семейства человеческих белков F-бокса». Curr Biol. 9 (20): 1177–9. Дои:10.1016 / S0960-9822 (00) 80020-2. PMID  10531035.
7. "Entrez Gene: LMO7 LIM домен 7".

дальнейшее чтение

• Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Н. и др. (2003). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Res. 9 (3): 99–106. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID  12168954.
• Нагасе Т., Исикава К., Суяма М. и др. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (6): 355–64. Дои:10.1093 / днарес / 5.6.355. PMID  10048485.
• Розенблюм Э., Вахтеристо П., Сандберг Т. и др. (2002). «Геномная карта области размером 6 Mb в 13q21-q22, участвующей в развитии рака: идентификация и характеристика генов-кандидатов». Гм. Genet. 110 (2): 111–21. Дои:10.1007 / s00439-001-0646-6. PMID  11935316.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Биол. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID  15324660.
• Бензингер А., Мустер Н., Кох HB и др. (2005). «Целевой протеомный анализ 14-3-3 сигма, эффектора р53, который обычно подавляется при раке». Мол. Cell. Протеомика. 4 (6): 785–95. Дои:10.1074 / mcp.M500021-MCP200. PMID  15778465.
• Ким Дж., Бхинг А.А., Морган XC, Айер В.Р. (2005). «Картирование взаимодействий ДНК-белок в больших геномах с помощью анализа последовательности тегов геномного обогащения». Nat. Методы. 2 (1): 47–53. Дои:10.1038 / nmeth726. PMID  15782160.
• Ким Дж. Э., Танненбаум SR, Белый FM (2005). «Глобальный фосфопротеом клеток аденокарциномы толстой кишки человека HT-29». J. Proteome Res. 4 (4): 1339–46. Дои:10.1021 / pr050048h. PMID  16083285.
• Ивабучи К., Канеко Т., Кикуяма М. (2006). «Ионный механизм механо-восприятия у Characeae». Физиология растительной клетки. 46 (11): 1863–71. Дои:10.1093 / pcp / pci204. PMID  16192285.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243.
• Холаска Дж. М., Раис-Бахрами С., Уилсон К. Л. (2007). «Lmo7 - это связывающий эмерин белок, который регулирует транскрипцию эмерина и многих других генов, связанных с мышцами». Гм. Мол. Genet. 15 (23): 3459–72. Дои:10.1093 / hmg / ddl423. PMID  17067998.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983.