ЛЯР - LYAR

ЛЯР
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1WJV
Идентификаторы
Псевдонимы	ЛЯР, ZC2HC2, ZLy1 антитела реактивные
Внешние идентификаторы	OMIM: 617684 MGI: 107470 ГомолоГен: 41200 Генные карты: ЛЯР
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4п16.3 Начинать 4,267,701 бп[1] Конец 4,290,154 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 B3 | 5 20,29 см Начинать 38,220,470 бп[2] Конец 38,234,306 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • Связывание ДНК Сотовый компонент • ядро клетки • ядрышко • внешний сегмент фоторецептора • цитоплазма • проекция клетки Биологический процесс • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • обработка рРНК • развитие эритроцитов • положительная регуляция фагоцитоза Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55646	17089
Ансамбль	ENSG00000145220	ENSMUSG00000067367
UniProt	Q9NX58	Q08288
RefSeq (мРНК)	NM_001145725 NM_017816	NM_025281
RefSeq (белок)	NP_001139197 NP_060286	NP_079557
Расположение (UCSC)	Chr 4: 4.27 - 4.29 Мб	Chr 5: 38.22 - 38.23 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ядрышковый белок, регулирующий рост клеток это белок что у людей кодируется ЛЯР ген (Реактивный клон с антителом Ly-1).^[5]

LYAR содержит цинковый палец мотив и три копии сигналы ядерной локализации. LYAR в основном локализован на ядрышки. LYAR присутствует в больших количествах у ранних эмбрионов и предпочтительно в печень плод вилочковая железа.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000145220 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000067367 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: гипотетический белок LYAR FLJ20425».
6. Су Л., Хершбергер Р.Дж., Вайсман И.Л. (май 1993 г.). «LYAR, новый ядрышковый белок с ДНК-связывающими мотивами цинкового пальца, участвует в регуляции роста клеток». Genes Dev. 7 (5): 735–48. Дои:10.1101 / gad.7.5.735. PMID  8491376.

дальнейшее чтение

• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Биол. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID  11790298. S2CID  14132033.
• Scherl A, Couté Y, Déon C и др. (2003). «Функциональный протеомный анализ ядрышка человека». Мол. Биол. Клетка. 13 (11): 4100–9. Дои:10.1091 / mbc.E02-05-0271. ЧВК  133617. PMID  12429849.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Ким Дж. Э., Танненбаум SR, Белый FM (2005). «Глобальный фосфопротеом клеток аденокарциномы толстой кишки человека HT-29». J. Proteome Res. 4 (4): 1339–46. Дои:10.1021 / pr050048h. PMID  16083285.
• Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID  16169070. S2CID  8235923.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.