LYPD3 - LYPD3

LYPD3
Идентификаторы
Псевдонимы	LYPD3, C4.4A, домен LY6 / PLAUR, содержащий 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 609484 MGI: 1919684 ГомолоГен: 8672 Генные карты: LYPD3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.31 Начинать 43,460,787 бп[1] Конец 43,465,608 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 A3 Начинать 24,636,550 бп[2] Конец 24,641,118 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ламинина Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • закрепленный компонент мембраны • закрепленный компонент плазматической мембраны • мембрана • внеклеточная область • внеклеточный • клеточная мембрана Биологический процесс • адгезия клеточного матрикса • Липидирование C-концевого белка Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	27076	72434
Ансамбль	ENSG00000124466	ENSMUSG00000057454
UniProt	O95274	Q91YK8
RefSeq (мРНК)	NM_014400	NM_133743
RefSeq (белок)	NP_055215	NP_598504
Расположение (UCSC)	Chr 19: 43.46 - 43.47 Мб	Chr 7: 24,64 - 24,64 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок 3, содержащий домен Ly6 / PLAUR это белок что у людей кодируется LYPD3 ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000124466 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000057454 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Вурфель Дж, Зайтер С., Стассар М., Клаас А., Клас Р., Розель М., Мархаба Р., Савельева Л., Шваб М., Мацку С., Золлер М. (февраль 2001 г.). «Клонирование человеческого гомолога крысы C4.4A, связанной с метастазами». Ген. 262 (1–2): 35–41. Дои:10.1016 / S0378-1119 (00) 00515-1. PMID  11179665.
6. Смит Б.А., Кеннеди В.Дж., Харден П., Селби П.Дж., Трейдосевич Л.К., Саутгейт Дж. (Март 2001 г.). «Идентификация генов, участвующих во взаимодействиях уротелиальных клеток и матрикса человека: последствия для путей прогрессирования злокачественного уротелия». Рак Res. 61 (4): 1678–85. PMID  11245483.
7. «Ген Entrez: домен LYPD3 LY6 / PLAUR, содержащий 3».

дальнейшее чтение

• Парет С., Хильдебранд Д., Вейтц Дж. И др. (2007). «C4.4A как кандидат в маркер в диагностике колоректального рака». Br. J. Рак. 97 (8): 1146–56. Дои:10.1038 / sj.bjc.6604012. ЧВК  2360445. PMID  17912244.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных кДНК человека, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID  16303743.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Сузуки Ю., Ямасита Р., Широта М. и др. (2004). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях». Genome Res. 14 (9): 1711–8. Дои:10.1101 / гр.2435604. ЧВК  515316. PMID  15342556.
• Гримвуд Дж., Гордон Л.А., Олсен А. и др. (2004). «Последовательность ДНК и биология хромосомы 19 человека». Природа. 428 (6982): 529–35. Дои:10.1038 / природа02399. PMID  15057824.
• Hansen LV, Gårdsvoll H, Nielsen BS и др. (2004). «Структурный анализ и тканевая локализация человеческого C4.4A: белкового гомолога рецептора урокиназы». Biochem. J. 380 (Pt 3): 845–57. Дои:10.1042 / BJ20031478. ЧВК  1224211. PMID  15012588.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретируемого белка (SPDI), широкомасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: биоинформатическая оценка». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Флетчер Г.К., Патель С., Тайсон К. и др. (2003). «hAG-2 и hAG-3, человеческие гомологи генов, участвующих в дифференцировке, связаны с эстроген-положительными опухолями молочной железы и взаимодействуют с геном метастазирования C4.4a и дистрогликаном». Br. J. Рак. 88 (4): 579–85. Дои:10.1038 / sj.bjc.6600740. ЧВК  2377166. PMID  12592373.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Адам П.Дж., Бойд Р., Тайсон К.Л. и др. (2003). «Всесторонний протеомный анализ клеточных мембран рака молочной железы позволяет выявить уникальные белки, которые могут сыграть роль в клиническом раке». J. Biol. Chem. 278 (8): 6482–9. Дои:10.1074 / jbc.M210184200. PMID  12477722.