LYPLA3 - LYPLA3

PLA2G15
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4X90, 4X91, 4X92, 4X93, 4X94, 4X95, 4X97
Идентификаторы
Псевдонимы	PLA2G15, ACS, GXVPLA2, LLPL, LPLA2, LYPLA3, фосфолипаза A2 группы XV
Внешние идентификаторы	OMIM: 609362 MGI: 2178076 ГомолоГен: 8200 Генные карты: PLA2G15
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16q22.1 Начните 68,245,304 бп[1] Конец 68,261,058 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 | 8 D3 Начните 106,150,399 бп[2] Конец 106,164,715 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • О-ацилтрансферазная активность • активность лизофосфолипазы • трансферазная активность, перенос ацильных групп • гидролазная активность • связывание фосфолипидов • кальций-независимая активность фосфолипазы А2 Сотовый компонент • мембрана • митохондрия • лизосома • внеклеточная экзосома • внеклеточный • нуклеоплазма • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • внеклеточная область Биологический процесс • катаболический процесс жирных кислот • катаболический процесс фосфатидилхолина • процесс метаболизма керамидов • липидный обмен • метаболический процесс жирных кислот • липидный катаболический процесс • катаболический процесс фосфатидилэтаноламина • метаболический процесс глицерофосфолипидов • метаболический процесс фосфатидилхолина • фосфолипидный метаболический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23659	192654
Ансамбль	ENSG00000103066	ENSMUSG00000031903
UniProt	Q8NCC3	Q8VEB4
RefSeq (мРНК)	NM_012320 NM_001363551	NM_133792 NM_001357319
RefSeq (белок)	NP_036452 NP_001350480	NP_598553 NP_001344248
Расположение (UCSC)	Chr 16: 68,25 - 68,26 Мб	Chr 8: 106.15 - 106.16 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Группа XV фосфолипаза A2 является фермент что у людей кодируется PLA2G15 ген.^[5][6][7]

Лизофосфолипазы - это ферменты, которые действуют на биологические мембраны для регулирования многофункциональных лизофосфолипидов. Белок, кодируемый этим геном, гидролизует лизофосфатидилхолин к глицерофосфорилхолин и свободная жирная кислота. Этот фермент присутствует в плазме и считается связанным с липопротеином высокой плотности. Более поздняя статья противоречит функции этого гена. Это демонстрирует, что этот ген кодирует лизосомальный фермент вместо лизофосфолипазы и обладает как кальций-независимой фосфолипазой А2, так и трансацилазной активностью.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000103066 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031903 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Танияма Ю., Сибата С., Кита С., Хорикоши К., Фьюз Х, Сирафудзи Х, Сумино Ю., Фуджино М. (май 1999 г.). «Клонирование и экспрессия новой лизофосфолипазы, которая структурно напоминает лецитин-холестерин-ацилтрансферазу». Biochem Biophys Res Commun. 257 (1): 50–6. Дои:10.1006 / bbrc.1999.0411. PMID  10092508.
6. Шалоске Р.Х., Деннис Э.А. (ноябрь 2006 г.). «Суперсемейство фосфолипаз А2 и его система нумерации групп». Biochim Biophys Acta. 1761 (11): 1246–59. Дои:10.1016 / j.bbalip.2006.07.011. PMID  16973413.
7. «Ген Entrez: лизофосфолипаза 3 LYPLA3 (лизосомальная фосфолипаза А2)».

дальнейшее чтение

• Ван А, Деннис Э.А. (1999). «Лизофосфолипазы млекопитающих». Биохим. Биофиз. Acta. 1439 (1): 1–16. Дои:10.1016 / с 1388-1981 (99) 00063-3. PMID  10395961.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Охта Т., Мишель Дж. Дж., Шоттелиус А. Дж., Сюн Й (1999). «ROC1, гомолог APC11, представляет собой семейство партнеров кулина с ассоциированной активностью убиквитинлигазы». Мол. Клетка. 3 (4): 535–41. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80482-7. PMID  10230407.
• Хираока М., Абэ А., Шайман Дж. А. (2002). «Клонирование и характеристика лизосомальной фосфолипазы A2, 1-O-ацилцерамидсинтазы». J. Biol. Chem. 277 (12): 10090–9. Дои:10.1074 / jbc.M111977200. PMID  11790796.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретируемого белка (SPDI), широкомасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: биоинформатическая оценка». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Абэ А., Паучер Х.К., Хираока М., Шайман Дж.А. (2004). «Индукция лизосомальной фосфолипазы A2 через рецептор ретиноида X в клетках THP-1». J. Lipid Res. 45 (4): 667–73. Дои:10.1194 / мл. M300342-JLR200. PMID  14754907.
• Чжан З., Хензель В.Дж. (2005). «Прогнозирование сигнального пептида на основе анализа экспериментально подтвержденных сайтов расщепления». Белковая наука. 13 (10): 2819–24. Дои:10.1110 / пс. 04682504. ЧВК  2286551. PMID  15340161.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных человеческих кДНК, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID  16303743.