Лаговирус - Lagovirus

Лаговирус
	КриоЭМ реконструкция Вирус геморрагической болезни кроликов (RHDV) капсид. EMDB Вход EMD-1933
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область:	Рибовирия
Королевство:	Орторнавиры
Тип:	Писувирикота
Учебный класс:	Pisoniviricetes
Заказ:	Пикорнавиралес
Семья:	Caliciviridae
Род:	Лаговирус
Типовой вид
	Вирус геморрагической болезни кроликов;
Разновидность
	Вирус синдрома русого зайца; Вирус геморрагической болезни кроликов;

Лаговирус это род вирусы, в семье Caliciviridae.^[2]^[3] Зайцеобразные служат естественными хозяевами. В настоящее время в этом роде всего два вида, включая типовой вид. Вирус геморрагической болезни кроликов. Заболевания, связанные с этим видом, включают: некротический гепатит, ведущий к смертельным кровотечениям.^[4]

Таксономия

Группа: оцРНК (+)Заказ: PicornaviralesСемья: CaliciviridaeРод: Лаговирус

^[3]

Свойства вириона

Морфология

Вирионы состоят из капсид. Капсид вируса не обволакивает, круглый с Т = 3 икосаэдрическая симметрия. Изометрический капсид имеет диаметр 35–39 нм. Также наблюдаются частицы с симметрией T = 1, состоящие из 60 капсидных белков, которые имеют диаметр около 15 нм.^[4] Капсиды округляются до шестиугольник в общих чертах. Структура поверхности капсида имеет регулярный узор с отличительными особенностями. В капсомер расположение хорошо видно. Капсид с 32 чашеобразными углублениями.

Род	Структура	Симметрия	Капсид	Геномное расположение	Геномная сегментация
Лаговирус	Икосаэдр	Т = 1, Т = 3	Без оболочки	Линейный	Одночастный

Жизненный цикл

Репликация вируса происходит в цитоплазме. Проникновение в клетку-хозяин достигается путем прикрепления к рецепторам хозяина, которые опосредуют эндоцитоз. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Трансляция происходит путем терминации-повторной инициации РНК. Зайцеобразные служат естественным хозяином.^[3]^[4]

Род	Детали хоста	Тканевый тропизм	Детали входа	Детали выпуска	Сайт репликации	Сайт сборки	Передача инфекции
Лаговирус	Зайцеобразные	Печень	Эндоцитоз клеточных рецепторов	Лизис	Цитоплазма	Цитоплазма	Контакт

Физические и химические свойства

В молекулярная масса (Mr) вирионов - 15×10⁶. Вирионы обладают плавучесть в Хлорид цезия (CsCl) 1,33–1,36 г / см³. В градиент плотности вирионов в Калий тартрат-глицерин 1,29 г / см³. В коэффициент седиментации 170–187 Сведберг (с_{20, Вт}); другой (ых) - пик 160–170 Сведберг (с_{20, Вт}) (предполагается, что они состоят из дефектных мешающих частиц). Под in vitro условиях вирионы инактивированы в кислой среде pH 4,5–7; стабильный в щелочной среда pH 7–10,5. Вирионы нестабильны при повышенной температуре в присутствии высокой концентрации Mg⁺⁺. Вирионы чувствительны к лечению трипсин (в некоторых напряжения, нечувствительны к обработке мягкими моющими средствами, или эфир, или же хлороформ. В заразительность усиливается после лечения трипсином (у некоторых штаммов).

Геном

В геном не является сегментированный и содержит одну молекулу линейного позитивный смысл, SSРНК. Незначительные виды не-геномный Нуклеиновая кислота иногда также встречается в вирионах. Инкапсидированная нуклеиновая кислота в основном имеет геномное происхождение, но вирионы также могут содержать субгеномную РНК. Полный геном - 7450 нуклеотиды длинный. В геноме есть гуанин + цитозин содержание 49,3–50,1%. В 5 'конец генома имеет обычно связанный с геном белок (VPg ), или же метилированный нуклеотидный кэп (в случае Вирус гепатита Е ). В 3 'конечная точка имеет поли (А) тракт. Каждый вирион содержит полную копию, или дефектные мешающие копии.

Белки

В популярный геном кодирует вирусный структурный белок. Вирионы состоят из 1 структурного белка (ов) (основные виды расположены в капсиде.

Вирусный структурный белок: белок капсида имеет молярная масса из 59000–71000 Да; это белок оболочки. Белок капсида имеет небольшую молекулярную массу «растворимых» 28–30 кг.Да.

Антигенность

Перекрестная реактивность находится. Перекрестная реактивность между видами одного и того же серотип, но не с видами другого серотипа и некоторыми видами того же серотипа, но не со всеми. Хотя степень антигенной специфичности зависит от степени родства, антигенность отличается от серогрупп того же рода. Большинство видов этого рода имеют антигенное родство. Они делятся некоторыми эпитопы в структурных белках.

внешняя ссылка

[1] Luque, D .; González, J.M .; Gómez-Blanco, J .; Marabini, R .; Chichón, J .; Mena, I .; Angulo, I .; Carrascosa, J. L .; Verdaguer, N .; Trus, B.L .; Bárcena, J .; Кастон, Дж. Р. (2012). «Вставка эпитопа в N-концевой молекулярный переключатель вируса геморрагической болезни кроликов T = 3 капсидного белка приводит к увеличению T = 4 капсидов» (PDF). Журнал вирусологии. 86 (12): 6470–6480. Дои:10.1128 / JVI.07050-11. ЧВК 3393579. PMID 22491457.

[2] Vinjé, J; Эстес, МК; Esteves, P; Грин, Кентукки; Катаяма, К. Ноулз, штат Нью-Джерси; L'Homme, Y; Мартелла, V; Vennema, H; Белый, PA; Консорциум отчетов ICTV (ноябрь 2019 г.). "Профиль таксономии вирусов ICTV: Caliciviridae". Журнал общей вирусологии. 100 (11): 1469–1470. Дои:10.1099 / jgv.0.001332. PMID 31573467.

[ICTV-3] а ^б ^c "Отчет ICTV о Caliciviridae".

[ViralZone-4] а ^б ^c «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.

[1]

[2]

[3]

[4]