МАВИД - MAVID

МАВИД
Разработчики)Николас Брей (Калифорнийский университет в Беркли ), Лиор Пахтер (Калифорнийский университет в Беркли )
Стабильный выпуск
2.0.4
Операционная системаUNIX, Linux, Mac
ТипИнструмент биоинформатики
ЛицензияОткрытый исходный код
Интернет сайтMAVID скачать

МАВИД это множественное выравнивание последовательностей программа, подходящая для выравнивания большого количества последовательностей ДНК.[1][2] Последовательности могут быть небольшими митохондриальными геномами или большими геномными областями длиной до мегабаз. Последняя версия - 2.0.4.

Программой можно пользоваться через Веб-сервер MAVID или как отдельная программа, которую можно установить с исходный код.

Ввод, вывод

Эта программа принимает последовательности в Формат FASTA.

Формат вывода включает: Формат FASTA, Clustal, ФИЛИП.

Рекомендации

  1. ^ Дьюи, Колин Н. (2007), «Выравнивание нескольких полных геномов с Меркатором и MAVID», в Бергмане, Николас Х. (ред.), Сравнительная геномика, Методы молекулярной биологии, 395, Humana Press, стр. 221–235, Дои:10.1007/978-1-59745-514-5_14, ISBN  978-1-58829-693-1, PMID  17993677
  2. ^ Брей, Николас; Пахтер, Лиор (2003-07-01). «Сервер множественного выравнивания MAVID». Исследования нуклеиновых кислот. 31 (13): 3525–3526. Дои:10.1093 / нар / gkg623. ISSN  0305-1048. ЧВК  169029. PMID  12824358.

внешняя ссылка