Лиор Пахтер - Lior Pachter

Лиор Пахтер
Лиор Пахтер 2013.jpg
Лиор Пахтер в 2013 году
Родившийся
Лиор Сэмюэл Пахтер

(1973-05-03) 3 мая 1973 г. (47 лет)
Рамат-Ган, Израиль
Альма-матерКалифорнийский технологический институт (BS)
Массачусетский Институт Технологий (Кандидат наук)
НаградыЧлен ISCB (2017)
Научная карьера
ПоляВычислительная биология
Биоинформатика
Геномика
Информатика
Математика[1]
УчрежденияКалифорнийский университет в Беркли
ТезисДомино-мозаика, распознавание генов и мыши  (1999)
ДокторантБонни Бергер[2]
ДокторантыКоул Трапнелл[2][3]
Интернет сайтлиорпахтер.wordpress.com

Лиор Сэмюэл Пахтер это компьютерный биолог. Он работает в Калифорнийский технологический институт, где он - профессор компьютерной биологии Брена. У него самые разные исследовательские интересы, в том числе геномика, комбинаторика, вычислительная геометрия, машинное обучение, научные вычисления, и статистика.[1][4][5]

ранняя жизнь и образование

Пахтер родился в Израиль и вырос в Южная Африка.[6]Он получил степень бакалавра математики в Калифорнийский технологический институт в 1994 г.[4] Он защитил докторскую диссертацию по математике в Массачусетский Институт Технологий в 1999 г. под руководством Бонни Бергер,[2] с Эрик Ландер и Даниэль Клейтман в качестве со-консультантов.[4]

Карьера и исследования

Пахтер был с Калифорнийский университет в Беркли факультет с 1999 по 2018 год[7] и получил кресло Саклера в 2012 году.[4]

Помимо своего технического вклада, Пактер известен тем, что использовал новые средства массовой информации продвигать открытая наука[8] и для мысленный эксперимент он написал в своем блоге, что «ближайший сосед« идеального человека »- из Пуэрто-Рико.[9] Это привлекло большое внимание средств массовой информации,[10] и ответ был опубликован в Scientific American.[11]

Награды и отличия

В 2017 году Пахтер был избран Парень из Международное общество вычислительной биологии (ISCB).[12]

Рекомендации

  1. ^ а б Лиор Пахтер публикации, проиндексированные Google ученый Отредактируйте это в Викиданных
  2. ^ а б c Лиор Пахтер на Проект "Математическая генеалогия"
  3. ^ Трапнелл, Коул; Пахтер, Лиор; Зальцберг, Стивен Л. (2009). «TopHat: обнаружение сплайсинговых соединений с помощью RNA-Seq». Биоинформатика. 25 (9): 1105–1111. Дои:10.1093 / биоинформатика / btp120. ISSN  1460-2059. ЧВК  2672628. PMID  19289445.
  4. ^ а б c d Биографические данные: Лиор Пахтер (PDF), 2017, получено 2017-05-16.
  5. ^ Трапнелл, Коул; Уильямс, Брайан А; Pertea, Geo; Мортазави, Али; Кван, Гордон; ван Барен, Марийке Дж; Зальцберг, Стивен Л; Уолд, Барбара Дж; Пахтер, Лиор (2010). «Сборка и количественное определение транскриптов с помощью RNA-Seq выявляет неаннотированные транскрипты и переключение изоформ во время дифференцировки клеток». Природа Биотехнологии. 28 (5): 511–515. Дои:10.1038 / nbt.1621. ISSN  1087-0156. ЧВК  3146043. PMID  20436464.
  6. ^ Эскенази, Джо (14 июня 2002 г.), "Петиция о лишении U.C. беспокоит произраильских активистов", Еженедельно.
  7. ^ "Калифорнийский университет в Беркли, факультет математики, Лиор Пахтер". Получено 8 июн 2019.
  8. ^ Лезен, Эми Э. (2015), «Новая парадигма научного общения? Социальные сети, твиттер, наука и участие общественности: обзор литературы», в Лезен, Эми Э. (ред.), Ученые, эксперты и гражданское участие: тонкая грань, Исследования Ashgate по экологической политике и практике, Ashgate Publishing, Ltd., стр. 111–136, ISBN  9781472415240. См. В частности стр. 119–120.
  9. ^ Пахтер, Лиор (2 декабря 2014 г.). «Идеальный человек - пуэрториканец». Биты ДНК - Обзоры и комментарии по вычислительной биологии Лиора Пахтера. Получено 11 декабря, 2016.
  10. ^ Вальдес, Мария Г. (4 декабря 2014 г.), «Новое исследование показывает, что идеальный генетически говорящий человек родом с этого Карибского острова!», Latin Times
  11. ^ Олексык, Тарас К .; Мартинес-Крузадо, Хуан Карлос (5 ​​февраля 2015 г.). «Почему нет идеального человека ни в Пуэрто-Рико, ни где-либо еще». Scientific American..
  12. ^ «13 февраля 2017 г .: Международное общество вычислительной биологии объявляет семь членов стипендиатом ISCB 2017 года». www.iscb.org. Получено 13 февраля 2017.

внешняя ссылка