Филип Борн - Philip Bourne

Фил Борн
Phil E Bourne.jpg
Филип Эрик Борн
Родившийся
Филип Эрик Борн

1953 (66–67 лет)[1]
Альма-матерУниверситет Флиндерса (Кандидат наук)
Известен
Супруг (а)
Рома Чалупа
​
(м. 1983)​
Дети
  • Скотт Борн (род. 1985)
  • Мелани Борн (р. 1997)
Награды
Научная карьера
ПоляData Science
Вычислительная биология
Научное общение[9]
Биоинформатика
Учреждения
ТезисАнализ кристаллической структуры: комплексы металлов, представляющие биологический интерес, и стереохимия замещенных фонилбициклооктанов  (1979)
Известные студентыВернер Г. Кребс
Интернет сайтнаука о данных.virginia.edu/люди/ Фил-Борн

Филип Эрик Борн (1953 г.р.) - австралиец биоинформатик,[10] писатель-фантаст,[2] и бизнесмен.[4] В настоящее время он является заведующим кафедрой наук о данных Стивенсона и директором Школы наук о данных и профессором биомедицинской инженерии.[11] и был первым заместителем директора по науке о данных в Национальные институты здоровья, где его проекты включают управление От больших данных к знаниям Инициативы, и бывший помощник вице-канцлера в UCSD.[12] Он внес свой вклад в разработку учебников и является решительным сторонником литературы и программного обеспечения с открытым доступом. Его разнообразные интересы охватывали структурная биология, медицинская информатика, информационные технологии, структурные биоинформатика, научное общение и фармацевтические науки.[10] Его статьи очень цитируются, и у него индекс Хирша выше 50.[13][14][9]

Образование

Борн получил образование в области физической химии в середине-конце 1970-х годов и получил докторскую степень в 1979 году.[1] на Университет Флиндерса.

Карьера и исследования

Получив докторскую степень, Борн перешел в Университет Шеффилда сделать постдокторские исследования в 1979-1981 гг.,[15] с последующим переходом на Колумбийский университет, Нью-Йорк, в 1981 году. В 1995 году он переехал в Калифорнийский университет в Сан-Диего, где он был профессором кафедры фармакологии. В 2014 году он перешел в NIH, чтобы стать его заместителем директора по науке о данных. В январе 2017 года было объявлено, что он принял должность директора Университет Вирджинии Институт науки о данных.[16]

Он известен написанием книги Unix за VMS Пользователи (1990)[2] и за то, что он был соавтором Комбинаторное расширение алгоритм для трехмерное выравнивание белковых структур,[17] совместно с И. Шиндяловым (1998). В 1999 году он стал содиректором Банк данных белков.[18] Он был президентом ISCB (2002–2003).[19] Он член Американская ассоциация медицинской информатики с 2002 г.[20] Он является основателем главного редактора PLoS вычислительная биология (2005-). В 2007 году он стал соучредителем Наука.[4] Борн - редактор популярного Десять простых правил серия редакционных статей, опубликованных в PLoS вычислительная биология журнал.[21] Он работал заместителем вице-канцлера по инновациям и промышленным альянсам.[12] и профессор фармакологии Школа фармации и фармацевтических наук Skaggs на Калифорнийский университет в Сан-Диего (UCSD).[22][23]Он советник Hypothes.is проект[24] и заместитель директора по науке о данных в Национальные институты здоровья где его проекты включают управление От больших данных к знаниям инициатива.[25][26]

Публикации

Борн - автор многочисленных научных статей и глав книг и редактор журнала Структурная биоинформатика учебник.[27][28] и Аптечная информатика[29] Прочие публикации[9] включают:

  • Структурная биоинформатика 1-е издание [27]
  • Структурная биоинформатика 2-е издание[28]
  • Аптечная информатика[29]
  • Unix для пользователей Vms[2]
  • Борн, Филип Э. (1 января 1997 г.). Поваренная книга для обслуживания Интернета для UNIX. Прентис Холл. ISBN  9780135199923.
  • Харт, Дэвид Л .; Борн, Филип Э. (1998-08-12). Поваренная книга веб-сервера Mac OS 8 (1-е изд.). Prentice Hall PTR. ISBN  9780135200162.
  • Борн, Филип Э. (1 января 2000 г.). Подземный гид Unix. Прентис Холл. ISBN  9780131844582.
  • Berman, H.M .; Westbrook, J .; Feng, Z .; Gilliland, G .; Bhat, T. N .; Weissig, H .; Шиндялов, И. Н .; Борн, П. Э. (1 января 2000 г.). «Банк данных о белках». Исследования нуклеиновых кислот. 28 (1): 235–242. Дои:10.1093 / nar / 28.1.235. ISSN  0305-1048. ЧВК  102472. PMID  10592235.

Награды и отличия

Борн был избран Член AAAS по фармацевтическим наукам в 2011 г.[5] и Парень из Международное общество вычислительной биологии (ISCB) в 2011 году.[6] В 2010 году он выиграл Microsoft Джим Грей электронная наука награда[7] а в 2009 году выиграл Премия Бенджамина Франклина (2009).[8][30]

Личная жизнь

Борн женат с 1983 года на Роме Чалупе, у них двое детей: Скотт Борн (1985-) и Мелани Борн (1997-).[нужна цитата ] Его интересы включают мотоциклы,[31] полет и походы

Рекомендации

  1. ^ а б Борн, Филип Эрик (1979). Анализ кристаллической структуры: комплексы металлов, представляющие биологический интерес, и стереохимия замещенных фонилбициклооктанов (Кандидатская диссертация). Университет Флиндерса. OCLC  708090572.
  2. ^ а б c d Борн, Фил Э (1990). Unix для пользователей VMS. Диджитал Пресс Ньютон, Массачусетс, США. ISBN  1-55558-034-3.
  3. ^ Берман, Х.М.; Westbrook, J .; Feng, Z .; Gilliland, G .; Bhat, T .; Weissig, H .; Шиндялов, И .; Борн, П. (2000). «Банк данных о белках». Исследования нуклеиновых кислот. 28 (1): 235–242. Дои:10.1093 / nar / 28.1.235. ЧВК  102472. PMID  10592235.
  4. ^ а б c Финк, JL; Борн, ЧП (2007). «Изобретая научную коммуникацию в эпоху электроники». CTWatch Ежеквартально. 3 (3).
  5. ^ а б «Доктор Фил Борн избран научным сотрудником AAAS по фармацевтическим наукам». Pharmacy.ucsd.edu. Получено 2011-02-27.
  6. ^ а б «Стипендиаты ISCB».
  7. ^ а б «Филип Э. Борн выигрывает премию Джима Грея в области электронной науки Microsoft в 2010 году». Eurekalert.org. 2010-10-18. Получено 2011-02-27.
  8. ^ а б «Премия Бенджамина Франклина». Bioinformatics.org. Получено 2011-02-27.
  9. ^ а б c Филип Борн публикации, проиндексированные Google ученый Отредактируйте это в Викиданных
  10. ^ а б Филип Борн публикации, проиндексированные Scopus библиографическая база данных. (требуется подписка)
  11. ^ https://engineering.virginia.edu/faculty/philip-e-bourne
  12. ^ а б http://pharmacy.ucsd.edu/news/Appointment-of-Associate-VC-for-Innovation-%20Industry-Alliances.pdf
  13. ^ страница в Университете Вирджинии
  14. ^ старый сайт Bournes
  15. ^ Clegg, G.A .; Stansfield, R. F. D .; Bourne, P.E .; Харрисон, П. М. (1980). «Упаковка спирали и конформация субъединиц апоферритина селезенки лошади». Природа. 288 (5788): 298–300. Дои:10.1038 / 288298a0. PMID  7432529.
  16. ^ https://www.news.virginia.edu/content/uva-names-nih-researcher-new-director-data-science-institute
  17. ^ Шиндялов, И. Н .; Борн, П. Э. (1998). «Выравнивание структуры белка путем возрастающего комбинаторного удлинения (CE) оптимального пути». Разработка и отбор протеинов. 11 (9): 739–747. Дои:10.1093 / белок / 11.9.739. PMID  9796821.
  18. ^ Берман, Х.М.; Westbrook, J .; Feng, Z .; Gilliland, G .; Bhat, T .; Weissig, H .; Шиндялов, И .; Борн, П. (2000). «Банк данных о белках». Исследования нуклеиновых кислот. 28 (1): 235–242. Дои:10.1093 / nar / 28.1.235. ЧВК  102472. PMID  10592235.
  19. ^ «ISCB - Прошлые президенты». Архивировано из оригинал 3 сентября 2015 г.. Получено 3 сентября, 2015.
  20. ^ Greenes, R.A .; Madsen, E .; Миллер, Р. А. (2003). «Американский колледж медицинских информатиков и международных сотрудников, 2002». Журнал Американской ассоциации медицинской информатики. 10 (3): 281–286. Дои:10.1197 / jamia.M1326. ЧВК  400512.
  21. ^ Десять простых правил
  22. ^ http://www.sdsc.edu/pb/ Веб-страница лаборатории Борна
  23. ^ http://www.sdsc.edu/~bourne/CV.pdf Филип Э. Борн Ph.D. резюме
  24. ^ Официальный сайт Hypothes.is
  25. ^ NIH назначает д-ра Филипа Э. Борна первым заместителем директора по науке о данных
  26. ^ Margolis, R .; Derr, L .; Dunn, M .; Huerta, M .; Larkin, J .; Sheehan, J .; Guyer, M .; Грин, Э. Д. (2014). «Инициатива Национального института здравоохранения от больших данных к знаниям (BD2K): извлечение выгоды из больших биомедицинских данных». Журнал Американской ассоциации медицинской информатики. 21 (6): 957–8. Дои:10.1136 / amiajnl-2014-002974. ISSN  1067-5027. ЧВК  4215061. PMID  25008006.
  27. ^ а б Bourne, Philip E .; Вайссиг, Хельга (2003). Структурная биоинформатика. Джон Вили и сыновья.
  28. ^ а б Гу, Дженни; Борн, Филип Э. (март 2009 г.). Структурная биоинформатика (2-е изд.). Вили-Блэквелл. ISBN  0-470-18105-2.
  29. ^ а б Андерсон, Филип О .; Борн, Филип Э. (декабрь 2009 г.). Аптечная информатика. CRC Press. ISBN  1-4200-7175-0.
  30. ^ «Благодарность Борна: евангелист открытого доступа получает премию Бенджамина Франклина 2009 года». Bio-itworld.com. Получено 2011-02-27.
  31. ^ OFL | Филип Борн | Блог о путешествиях


Предшествует
Расс Альтман		 Президент
Международное общество вычислительной биологии
2002 – 2003		Преемник
Михаил Грибсков

'