Лоуренс Хантер - Lawrence Hunter
Ларри Хантер | |
---|---|
Ларри Хантер в 2002 году | |
Родившийся | Лоуренс Э. Хантер 18 января 1961 г. |
Альма-матер | Йельский университет (Кандидат наук) |
Известен | Интеллектуальные системы для молекулярной биологии (ISMB) Международное общество вычислительной биологии (ISCB) |
Награды | Член ISCB (2010) |
Научная карьера | |
Поля | Вычислительная биология Искусственный интеллект Биоинформатика[1] |
Учреждения | Медицинский факультет Университета Колорадо Университет Джорджа Мейсона |
Тезис | Планирование приобретения знаний: приобретение знаний через опыт (1989) |
Докторант | Роджер Шэнк[2] |
Интернет сайт | compbio |
Лоуренс Э. Хантер это Профессор и директор Центра вычислительной фармакологии и программы вычислительной биологии Медицинский факультет Университета Колорадо и профессор компьютерных наук в Университет Колорадо в Боулдере.[3] Он всемирно известный ученый,[1][4] сосредоточены на вычислительной биологии, извлечении информации из первичной биомедицинской литературы на основе знаний,[5] то семантическая интеграция ресурсов знаний в области молекулярной биологии и использования знаний в анализе высокопроизводительных данных, а также за его фундаментальную работу в области вычислительной биологии, которая привела к возникновению крупной профессиональной организации в этой области и двух международных конференций.[6]
Образование
Охотник завершил свой кандидат наук в Йельский университет в 1989 г. защитил диссертацию по Планирование приобретения знаний: приобретение знаний через опыт, по диагностике рака легких по гистологическим изображениям с использованием Рассуждения на основе случая,[7] под руководством Роджер Шэнк.[2]
Карьера и исследования
Столкнувшись с выбором между карьерой в основных приложениях искусственного интеллекта - программированием игр и защитой - Хантер решил создать новую дисциплину, биоинформатика. С 1989 по 2000 год Хантер работал компьютерным специалистом и начальником отдела Национальные институты здоровья разделы, посвященные статистическим и биоинформатическим исследованиям. Он был адъюнкт-преподавателем в Университет Джорджа Мейсона с 1991 по 2000 гг.[нужна цитата ] и адъюнкт-профессор Медицинской школы Университета Колорадо в Денвере с 2000 по 2008 год. В 2008 году он был назначен профессором.[8]
ISCB
В 1997 году Хантер основал крупнейшую профессиональную организацию в вычислительная биология и биоинформатика, то Международное общество вычислительной биологии (ISCB).[9]
Конференции
Хантер также был основателем трех успешных международных конференций по биоинформатике, Международной конференции по Интеллектуальные системы для молекулярной биологии (ISMB) и Тихоокеанский симпозиум по биокомпьютингу (PSB)[10] и Конференция по биоинформатике Скалистых гор.[11] Он также является соорганизатором конференции по биологической визуализации Vizbi.[12] Хантер был соучредителем и членом совета директоров Molecular Mining Corporation с 1997 по 2003 год.
Награды, почести и влияние
Охотник - это Парень из Американский колледж медицинской информатики[нужна цитата ][когда? ] и победитель Ассоциация развития искусственного интеллекта (AAAI) Премия Энгельмора 2003 г. за инновационное применение Искусственный интеллект.[нужна цитата ]
Хантеру приписывают то, что он был одним из основателей области биоинформатика.[нужна цитата ] На протяжении своей карьеры Хантер исследовал и руководил исследовательскими группами, изучающими разработку и применение передовых вычислительных методов для биомедицины для высокопроизводительных анализов, в частности, применение статистических и основанных на знаниях методов, в частности био-онтологий[13] к анализу высокопроизводительных данных и биомедицинских текстов. Он предложил нейробиологически и эволюционно обоснованные вычислительные модели познания и этические вопросы, связанные с вычислительной бионаукой. Он выступал за расширение деятельности по науке о данных в биомедицине, чтобы включить в нее методы, основанные на знаниях.[14]
Он стал Член ISCB в 2010 году. Другие награды и награды включают премию Регента за стипендии и технические достижения 1994 года.[нужна цитата ] Награда за заслуги, Национальная медицинская библиотека, 1991, 1992, 1993, 1994, 1995, 1996, 1997, 1998[нужна цитата ] Премия за выдающиеся достижения в области исследований, Медицинский факультет Университета Колорадо Кафедра фармакологии, 2007 г.[нужна цитата ] Премия за выдающиеся достижения в области преподавания, Медицинский факультет Университета Колорадо Кафедра профилактической медицины и биометрии, 2004 г.[нужна цитата ]
Публикации
Избранные публикации включают:
- Rindflesch, T .; Tanabe, L .; Weinstein, J .; Хантер, Л. (2000). «Эдгар: Извлечение лекарств, генов и родственных связей из биомедицинской литературы». Тихоокеанский симпозиум по биокомпьютингу: 517–528. Дои:10.1142/9789814447331_0049. ISBN 978-981-02-4188-9. ЧВК 2709525. PMID 10902199.
- Schank, R.C .; Collins, G.C .; Хантер, Л. Э. (1986). «Преодоление индуктивного образования категорий в обучении». Поведенческие науки и науки о мозге. 9 (4): 639. Дои:10.1017 / S0140525X00051578.
- Rindflesch, T. C .; Rajan, J. V .; Хантер, Л. (2000). «Извлечение отношений молекулярного связывания из биомедицинского текста». Материалы шестой конференции по прикладной обработке естественного языка -. С. 188–195. Дои:10.3115/974147.974173.
- Планирую учиться Материалы двенадцатой ежегодной конференции Общества когнитивных наук, Бостон, Массачусетс, июль 1990 г., стр. 26–34, Lawrence Erlbaum Associates, Хиллсдейл, штат Нью-Джерси. в.[15]
- Хантер, Лоуренс (1993). Искусственный интеллект и молекулярная биология. Менло-Парк, Калифорния: AAAI Press. ISBN 978-0-262-58115-8.
- Baumgartner, W.A .; Коэн, К. Б .; Fox, L.M .; Acquaah-Mensah, G .; Хантер, Л. (2007). «Ручного курирования недостаточно для аннотации геномных баз данных». Биоинформатика. 23 (13): i41 – i48. Дои:10.1093 / биоинформатика / btm229. ЧВК 2516305. PMID 17646325.
- Хантер, Л.; Lu, Z .; Firby, J .; Baumgartner Jr, W. A .; Johnson, H.L .; Огрен, П. В .; Коэн, К. Б. (2008). «OpenDMAP: движок анализа концепций на основе онтологий с открытым исходным кодом, с приложениями для сбора информации о транспорте белков, взаимодействиях белков и экспрессии генов, специфичных для конкретных типов клеток». BMC Биоинформатика. 9: 78. Дои:10.1186/1471-2105-9-78. ЧВК 2275248. PMID 18237434.
- Leach, S.M .; Типни, H .; Feng, W .; Baumgartner, W.A .; Kasliwal, P .; Schuyler, R.P .; Уильямс, Т .; Spritz, R.A .; Хантер, Л. (2009). Мияно, Сатору (ред.). «Ускорение биомедицинских открытий с приложениями к черепно-лицевому развитию». PLOS вычислительная биология. 5 (3): e1000215. Bibcode:2009PLSCB ... 5E0215L. Дои:10.1371 / journal.pcbi.1000215. ЧВК 2653649. PMID 19325874.
- Хантер, Лоуренс (2009). Жизненные процессы: введение в молекулярную биологию. Кембридж, Массачусетс: MIT Press. ISBN 0-262-01305-3.[8]
Рекомендации
- ^ а б Лоуренс Хантер публикации, проиндексированные Google ученый
- ^ а б Хантер, Лоуренс Э. (1989). Планирование приобретения знаний: приобретение знаний через опыт (Кандидатская диссертация). Йельский университет. HDL:10079 / bibid / 9838922. OCLC 24116492. ProQuest 303852846.
- ^ «Лоуренс Хантер, доктор философии». Compbio.ucdenver.edu. Получено 12 апреля 2018.
- ^ Лоуренс Хантер в DBLP Сервер библиографии
- ^ Хантер, Л.; Коэн, К. Б. (2006). «Биомедицинская языковая обработка: что дальше PubMed?». Молекулярная клетка. 21 (5): 589–594. Дои:10.1016 / j.molcel.2006.02.012. ЧВК 1702322. PMID 16507357.
- ^ «Пионер с личностью: Ларри Хантер, основатель Международного общества вычислительной биологии». Мир биоинформатики: 6. Осень 2002.
- ^ Гибсон, Тодд А. (2012). «Корни биоинформатики в ISMB». PLOS вычислительная биология. 8 (8): e1002679. Bibcode:2012PLSCB ... 8E2679G. Дои:10.1371 / journal.pcbi.1002679. ЧВК 3431341. PMID 22952443.
- ^ а б Хантер, Лоуренс (2009). Жизненные процессы: введение в молекулярную биологию. Кембридж, Массачусетс: MIT Press. ISBN 978-0-262-01305-5.
- ^ "Труды 6-й Международной конференции по интеллектуальным системам для молекулярной биологии. Монреаль, Квебек, Канада. 28 июня - 1 июля 1998 г.". Ход работы. Международная конференция по интеллектуальным системам для молекулярной биологии. 6: 1–223. 1998. PMID 9867411.
- ^ "Труды 4-й Международной конференции по интеллектуальным системам для молекулярной биологии. ISMB-96". Ход работы. Международная конференция по интеллектуальным системам для молекулярной биологии. 4: 1–262. 1996. PMID 9005023.
- ^ "Рокки 09 - Добро пожаловать!". Iscb.org. Получено 12 апреля 2018.
- ^ О'Донохью, Шон. «ВИЗБИ - Визуализация биологических данных». Vizbi.org. Получено 12 апреля 2018.
- ^ Ливингстон, Кевин М .; Бада, Майкл; Баумгартнер, Уильям А .; Хантер, Лоуренс Э. (2015-04-23). «KaBOB: семантическая интеграция биомедицинских баз данных на основе онтологий». BMC Биоинформатика. 16: 126. Дои:10.1186 / s12859-015-0559-3. ISSN 1471-2105. ЧВК 4448321. PMID 25903923.
- ^ Хантер, Лоуренс Э. (2017). "Биомедицинские данные, основанные на знаниях". EPJ Data Science. 1 (1–2): 19–25. Дои:10.3233 / DS-170001. ISSN 2193-1127. ЧВК 6171523. PMID 30294517.
- ^ Лик, Дэвид Б.; Рам, Эшвин (1995). Целеустремленное обучение. Кембридж, Массачусетс: MIT Press. ISBN 978-0-262-18165-5.
Предшествует Никто | Президент Международное общество вычислительной биологии 1997 – 2000 | Преемник Расс Альтман |