MED16 - MED16

MED16
Идентификаторы
Псевдонимы	MED16, DRIP92, THRAP5, TRAP95, субъединица комплекса медиатора 16
Внешние идентификаторы	OMIM: 604062 MGI: 2158394 ГомолоГен: 64602 Генные карты: MED16
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19p13.3 Начинать 867,630 бп[1] Конец 893,218 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 C1 Начинать 79,894,708 бп[2] Конец 79,908,923 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • коактиватор рецепторов тироидных гормонов • связывание рецептора витамина D • GO: 0001104 активность корегулятора транскрипции • связывание рецептора тироидного гормона • каталитическая активность • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • сигнальная активность рецептора Сотовый компонент • нуклеоплазма • ядро клетки • посреднический комплекс • мембрана Биологический процесс • транскрипция, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • сигнальный путь рецептора андрогена • сигнальный путь внутриклеточного рецептора стероидного гормона • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция активности рецепторов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10025	216154
Ансамбль	ENSG00000282092 ENSG00000175221	ENSMUSG00000013833
UniProt	Q9Y2X0	Q6PGF3
RefSeq (мРНК)	NM_005481	NM_001163276 NM_198107 NM_001359629
RefSeq (белок)	NP_005472	XP_006513550.1 XP_006513551.1
Расположение (UCSC)	Chr 19: 0,87 - 0,89 Мб	Chr 10: 79,89 - 79,91 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Медиатор субъединицы транскрипции РНК-полимеразы II 16 является фермент что у людей кодируется MED16 ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

MED16 был показан взаимодействовать с Рецептор гормона щитовидной железы альфа,^[6] Рецептор эстрогена альфа^[8] и Циклинзависимая киназа 8.^[6][8]

Рекомендации

1. ENSG00000175221 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000282092, ENSG00000175221 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000013833 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Rachez C, Lemon BD, Suldan Z, Bromleigh V, Gamble M, Naar AM, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Freedman LP (июнь 1999 г.). «Лиганд-зависимая активация транскрипции ядерными рецепторами требует комплекса DRIP». Природа. 398 (6730): 824–8. Bibcode:1999Натура.398..824р. Дои:10.1038/19783. PMID  10235266. S2CID  204992765.
6. Ито М., Юань С.Х., Малик С., Гу В., Фонделл Д.Д., Ямамура С., Фу З.Й., Чжан Икс, Цинь Дж., Редер Р.Г. (апрель 1999 г.). «Идентичность между комплексами TRAP и SMCC указывает на новые пути функционирования ядерных рецепторов и различных активаторов млекопитающих». Mol Cell. 3 (3): 361–70. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80463-3. PMID  10198638.
7. «Ген Entrez: белок 5, связанный с рецептором тироидного гормона THRAP5».
8. Кан, Юн Кён; Гермах Мохамед; Юань Чао-Син; Roeder Robert G (март 2002 г.). «Коактиваторный комплекс TRAP / медиатор напрямую взаимодействует с альфа- и бета-рецепторами эстрогена через субъединицу TRAP220 и напрямую усиливает функцию рецептора эстрогена in vitro». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. Соединенные Штаты. 99 (5): 2642–7. Bibcode:2002PNAS ... 99.2642K. Дои:10.1073 / pnas.261715899. ISSN  0027-8424. ЧВК  122401. PMID  11867769.

дальнейшее чтение

• Фонделл JD, Ge H, Roeder RG (1996). «Лигандная индукция коактиваторного комплекса транскрипционно активных рецепторов тироидных гормонов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (16): 8329–33. Bibcode:1996PNAS ... 93.8329F. Дои:10.1073 / пнас.93.16.8329. ЧВК  38670. PMID  8710870.
• Сузуки Ю., Цунода Т., Сесе Дж. И др. (2001). «Идентификация и характеристика потенциальных промоторных областей 1031 вида генов человека». Genome Res. 11 (5): 677–84. Дои:10.1101 / гр.гр-1640р. ЧВК  311086. PMID  11337467.
• Ван Кью, Шарма Д., Рен Й., Фонделл Дж. Д. (2003). «Корегуляторная роль комплекса TRAP-медиатор в экспрессии генов, опосредованной рецептором андрогена». J. Biol. Chem. 277 (45): 42852–8. Дои:10.1074 / jbc.M206061200. PMID  12218053.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Сато С., Томомори-Сато С., Бэнкс Калифорния и др. (2004). "Гомолог транскрипционного коактиватора Drosophila melanogaster интерсекс у млекопитающих является субъединицей комплекса медиатора млекопитающих". J. Biol. Chem. 278 (50): 49671–4. Дои:10.1074 / jbc.C300444200. PMID  14576168.
• Валлберг А.Е., Ямамура С., Малик С. и др. (2004). «Координация p300-опосредованного ремоделирования хроматина и функции TRAP / медиатора через коактиватор PGC-1alpha». Мол. Клетка. 12 (5): 1137–49. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00391-5. PMID  14636573.
• Tomomori-Sato C, Sato S, Parmely TJ, et al. (2004). «Медиаторная субъединица млекопитающих, которая имеет общие свойства с медиаторной субъединицей Cse2 Saccharomyces cerevisiae». J. Biol. Chem. 279 (7): 5846–51. Дои:10.1074 / jbc.M312523200. PMID  14638676.
• Сато С., Томомори-Сато С., Пармели Т.Дж. и др. (2004). «Набор консенсусных медиаторных субъединиц млекопитающих, идентифицированных с помощью технологии многомерной идентификации белков». Мол. Клетка. 14 (5): 685–91. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.05.006. PMID  15175163.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.

внешняя ссылка

• MED16 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• MED16 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.