MED24 - MED24 - Wikipedia

MED24
Идентификаторы
Псевдонимы	MED24, ARC100, CRSP100, CRSP4, DRIP100, THRAP4, TRAP100, MED5, субъединица 24 медиаторного комплекса
Внешние идентификаторы	OMIM: 607000 MGI: 1344385 ГомолоГен: 40795 Генные карты: MED24
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q21.1 Начинать 40,019,097 бп[1] Конец 40,061,215 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 D | 11 62,46 см Начинать 98,704,591 бп[2] Конец 98,729,435 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001104 активность корегулятора транскрипции • связывание рецептора тироидного гормона • GO: 0001948 связывание с белками • коактиватор транскрипции лиганд-зависимого ядерного рецептора • связывание рецептора витамина D • сигнальная активность рецептора Сотовый компонент • нуклеоплазма • ядро клетки • посреднический комплекс Биологический процесс • сигнальный путь рецептора андрогена • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • сигнальный путь внутриклеточного рецептора стероидного гормона • транскрипция, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9862	23989
Ансамбль	ENSG00000008838	ENSMUSG00000017210
UniProt	O75448	Q99K74
RefSeq (мРНК)	NM_001079518 NM_001267797 NM_014815 NM_001330211	NM_011869 NM_001361993 NM_001361994 NM_001361995 NM_001378926 NM_001378927
RefSeq (белок)	NP_001072986 NP_001254726 NP_001317140 NP_055630	NP_035999 NP_001348922 NP_001348923 NP_001348924 NP_001365855 NP_001365856
Расположение (UCSC)	Chr 17: 40.02 - 40.06 Мб	Chr 11: 98,7 - 98,73 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Медиатор субъединицы транскрипции РНК-полимеразы II 24 является фермент что у людей кодируется MED24 ген.^[5]

Функция

Этот ген кодирует компонент комплекса медиатора (также известного как TRAP, SMCC, DRIP или ARC), комплекса транскрипционных коактиваторов, который, как считается, необходим для экспрессии почти всех генов. Медиаторный комплекс рекрутируется активаторами транскрипции или ядерными рецепторами для индукции экспрессии генов, возможно, путем взаимодействия с РНК-полимеразой II и стимулирования образования комплекса пре-инициации транскрипции. Для этого гена было обнаружено множество вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы.^[5]

Взаимодействия

MED24 был показан взаимодействовать с Рецептор эстрогена альфа,^[6][7] Циклинзависимая киназа 8,^[7][8] Рецептор кальцитриола^[6][8] и BRCA1.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000008838 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017210 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: белок 4, связанный с рецептором тироидного гормона THRAP4».
6. Китагава Х, Фудзики Р., Йошимура К., Мезаки И, Уэмацу Й, Мацуи Д., Огава С., Унно К., Окубо М, Токита А, Накагава Т, Ито Т, Ишими И, Нагасава Х, Мацумото Т, Янагисава Дж, Като С. (Июнь 2003 г.). «Комплекс WINAC, модифицирующий хроматин, нацеливается на ядерный рецептор на промоторы и нарушается при синдроме Вильямса». Ячейка. 113 (7): 905–17. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00436-7. PMID  12837248.
7. Кан Ю.К., Гермах М., Юань С.Х., Родер Р.Г. (март 2002 г.). «Коактиваторный комплекс TRAP / медиатор напрямую взаимодействует с альфа- и бета-рецепторами эстрогена через субъединицу TRAP220 и напрямую усиливает функцию рецептора эстрогена in vitro». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (5): 2642–7. Дои:10.1073 / pnas.261715899. ЧВК  122401. PMID  11867769.
8. Ито М., Юань С.Х., Малик С., Гу В., Фонделл Д.Д., Ямамура С., Фу З.Й., Чжан Х, Цинь Дж., Рёдер Р.Г. (март 1999 г.). «Идентичность между комплексами TRAP и SMCC указывает на новые пути функционирования ядерных рецепторов и различных активаторов млекопитающих». Молекулярная клетка. 3 (3): 361–70. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80463-3. PMID  10198638.
9. Вада О, Оиси Х., Такада И., Янагисава Дж., Яно Т., Като С. (август 2004 г.). «Функция BRCA1 опосредует комплекс TRAP / DRIP посредством прямого взаимодействия с TRAP220». Онкоген. 23 (35): 6000–5. Дои:10.1038 / sj.onc.1207786. PMID  15208681.

дальнейшее чтение

• Gustafsson CM, Samuelsson T (июль 2001 г.). «Медиатор - универсальный комплекс регуляции транскрипции». Молекулярная микробиология. 41 (1): 1–8. Дои:10.1046 / j.1365-2958.2001.02481.x. PMID  11454195. S2CID  30224146.
• Малик С., Рёдер Р.Г. (май 2005 г.). «Динамическая регуляция транскрипции pol II с помощью комплекса медиатора млекопитающих». Тенденции в биохимических науках. 30 (5): 256–63. Дои:10.1016 / j.tibs.2005.03.009. PMID  15896744.
• Нагасе Т., Секи Н., Танака А., Исикава К., Номура Н. (август 1995 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IV. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0121-KIAA0160), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК исследования. 2 (4): 167–74, 199–210. Дои:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID  8590280.
• Фонделл Дж. Д., Ге Х., Рёдер Р. Г. (август 1996 г.). «Лигандная индукция коактиваторного комплекса транскрипционно активных рецепторов тироидных гормонов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (16): 8329–33. Дои:10.1073 / пнас.93.16.8329. ЧВК  38670. PMID  8710870.
• Рашез К., Сулдан З., Уорд Дж., Чанг С.П., Бураков Д., Эрдджумент-Бромаж Х., Темпст П., Фридман Л.П. (июнь 1998 г.). «Новый белковый комплекс, который взаимодействует с рецептором витамина D3 лиганд-зависимым образом и усиливает трансактивацию VDR в бесклеточной системе». Гены и развитие. 12 (12): 1787–800. Дои:10.1101 / gad.12.12.1787. ЧВК  316901. PMID  9637681.
• Юань С.Х., Ито М., Фонделл Д.Д., Фу З.Й., Родер Р.Г. (июль 1998 г.). «Компонент TRAP220 коактиваторного комплекса белка, ассоциированного с рецептором тироидного гормона (TRAP), напрямую взаимодействует с ядерными рецепторами лиганд-зависимым образом». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (14): 7939–44. Дои:10.1073 / пнас.95.14.7939. ЧВК  20908. PMID  9653119.
• Гу В, Малик С., Ито М., Юань С.Х., Фонделл Д.Д., Чжан Х, Мартинес Э., Цинь Дж., Рёдер Р.Г. (январь 1999 г.). «Новый человеческий SRB / MED-содержащий кофакторный комплекс, SMCC, участвующий в регуляции транскрипции». Молекулярная клетка. 3 (1): 97–108. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80178-1. PMID  10024883.
• Ито М., Юань С.Х., Малик С., Гу В., Фонделл Д.Д., Ямамура С., Фу З.Й., Чжан Х, Цинь Дж., Рёдер Р.Г. (март 1999 г.). «Идентичность между комплексами TRAP и SMCC указывает на новые пути функционирования ядерных рецепторов и различных активаторов млекопитающих». Молекулярная клетка. 3 (3): 361–70. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80463-3. PMID  10198638.
• Rachez C, Lemon BD, Suldan Z, Bromleigh V, Gamble M, Näär AM, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Freedman LP (апрель 1999 г.). «Лиганд-зависимая активация транскрипции ядерными рецепторами требует комплекса DRIP». Природа. 398 (6730): 824–8. Дои:10.1038/19783. PMID  10235266. S2CID  204992765.
• Näär AM, Beaurang PA, Zhou S, Abraham S, Solomon W., Tjian R (апрель 1999 г.). «Комбинированный коактиватор ARC опосредует активацию транскрипции, направленную на хроматин». Природа. 398 (6730): 828–32. Дои:10.1038/19789. PMID  10235267. S2CID  23646963.
• Ryu S, Tjian R (июнь 1999 г.). «Очистка транскрипционного кофакторного комплекса CRSP». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (13): 7137–42. Дои:10.1073 / пнас.96.13.7137. ЧВК  22029. PMID  10377381.
• Zhang J, Fondell JD (июль 1999 г.). «Идентификация мышиного TRAP100: транскрипционного корегуляторного фактора для рецепторов гормона щитовидной железы и витамина D». Молекулярная эндокринология. 13 (7): 1130–40. Дои:10.1210 / me.13.7.1130. PMID  10406464.
• Taatjes DJ, Näär AM, Andel F, Nogales E, Tjian R (февраль 2002 г.). «Структура, функция и индуцированные активатором конформации коактиватора CRSP». Наука. 295 (5557): 1058–62. Дои:10.1126 / science.1065249. PMID  11834832. S2CID  23446878.
• Surapureddi S, Yu S, Bu H, Hashimoto T., Yeldandi AV, Kashireddy P, Cherkaoui-Malki M, Qi C, Zhu YJ, Rao MS, Reddy JK (сентябрь 2002 г.). «Идентификация транскрипционно активного альфа-взаимодействующего кофакторного комплекса с рецептором, активируемым пролифератором пероксисом, в печени крысы и характеристика PRIC285 как коактиватора». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (18): 11836–41. Дои:10.1073 / pnas.182426699. ЧВК  129355. PMID  12189208.
• Ван Кью, Шарма Д., Рен Й., Фонделл Д.Д. (ноябрь 2002 г.). «Корегуляторная роль комплекса TRAP-медиатор в экспрессии генов, опосредованной рецептором андрогена». Журнал биологической химии. 277 (45): 42852–8. Дои:10.1074 / jbc.M206061200. PMID  12218053.
• Сато С., Томомори-Сато С., Бэнкс Калифорния, Пармели Т.Дж., Сорокина И., Брауэр С.С., Конавей Р.К., Конавей Дж. У. (декабрь 2003 г.). «Гомолог транскрипционного коактиватора Drosophila melanogaster в млекопитающем интерсексе является субъединицей медиаторного комплекса млекопитающих». Журнал биологической химии. 278 (50): 49671–4. Дои:10.1074 / jbc.C300444200. PMID  14576168.
• Томомори-Сато К., Сато С., Пармели Т.Дж., Бэнкс Калифорния, Сорокина И., Флоренс Л., Зыбаилов Б., Уошберн М.П., ​​Брауэр С.С., Конавей Р.К., Конавей Дж.В. (февраль 2004 г.). «Медиаторная субъединица млекопитающих, которая имеет общие свойства с медиаторной субъединицей Cse2 Saccharomyces cerevisiae». Журнал биологической химии. 279 (7): 5846–51. Дои:10.1074 / jbc.M312523200. PMID  14638676.