MRPL55 - MRPL55

MRPL55
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3J9M
Идентификаторы
Псевдонимы	MRPL55, AAVG5835, L55nt, MRP-L55, PRO19675, митохондриальный рибосомный белок L55
Внешние идентификаторы	OMIM: 611859 MGI: 1914462 ГомолоГен: 12098 Генные карты: MRPL55
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q42.13 Начинать 228,106,679 бп[1] Конец 228,109,312 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 B1.3 Начинать 59,202,486 бп[2] Конец 59,206,134 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • структурная составляющая рибосомы Сотовый компонент • рибосома • митохондрия • митохондриальная внутренняя мембрана • митохондриальная большая рибосомная субъединица Биологический процесс • трансляционное удлинение митохондрий • биосинтез белка • прекращение трансляции митохондрий Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	128308	67212
Ансамбль	ENSG00000162910	ENSMUSG00000036860
UniProt	Q7Z7F7	Q9CZ83
RefSeq (мРНК)	NM_181441 NM_181454 NM_181455 NM_181456 NM_181462 NM_181463 NM_181464 NM_181465 NM_001321284	NM_001302334 NM_001302335 NM_001302336 NM_026035 NM_001362908 NM_001362909
RefSeq (белок)	NP_001308213 NP_852106 NP_852119 NP_852120 NP_852121 NP_852127 NP_852128 NP_852129 NP_852130	NP_001289263 NP_001289264 NP_001289265 NP_080311 NP_001349837 NP_001349838
Расположение (UCSC)	Chr 1: 228.11 - 228.11 Мб	Chr 11: 59.2 - 59.21 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

39S рибосомный белок L55, митохондриальный это белок что у людей кодируется MRPL55 ген.^[5]

Рибосомные белки митохондрий млекопитающих кодируются ядерными генами и помогают в синтезе белка в митохондриях. Митохондриальные рибосомы (миторибосомы) состоят из небольшой 28S-субъединицы и большой 39S-субъединицы. По оценкам, они содержат 75% белка и рРНК по сравнению с прокариотическими рибосомами, где это соотношение обратное. Еще одно различие между миторибосомами млекопитающих и прокариотическими рибосомами состоит в том, что последние содержат 5S рРНК. У разных видов белки, составляющие миторибосому, сильно различаются по последовательности, а иногда и по биохимическим свойствам, что препятствует легкому распознаванию по гомологии последовательностей. Этот ген кодирует белок субъединицы 39S. Множественные варианты транскриптов, кодирующие две разные изоформы, были идентифицированы посредством анализа последовательностей.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000162910 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036860 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: митохондриальный рибосомный белок MRPL55 L55».

дальнейшее чтение

• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Диас Нето Э., Корреа Р.Г., Верджовски-Алмейда С. и др. (2000). «Секвенирование человеческого транскриптома с использованием тегов последовательности, экспрессируемой ORF». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (7): 3491–3496. Дои:10.1073 / pnas.97.7.3491. ЧВК  16267. PMID  10737800.
• Koc EC, Burkhart W., Blackburn K, et al. (2001). «Большая субъединица митохондриальной рибосомы млекопитающих. Анализ набора присутствующих рибосомных белков». J. Biol. Chem. 276 (47): 43958–43969. Дои:10.1074 / jbc.M106510200. PMID  11551941.
• О'Брайен Т.В. (2002). «Эволюция богатой белком митохондриальной рибосомы: последствия для генетических заболеваний человека». Ген. 286 (1): 73–79. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00808-3. PMID  11943462.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–16903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чжан З., Герштейн М (2003). «Идентификация и характеристика более 100 псевдогенов митохондриальных рибосомных белков в геноме человека». Геномика. 81 (5): 468–480. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00004-1. PMID  12706105.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), широкомасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: оценка биоинформатики». Genome Res. 13 (10): 2265–2270. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–45. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–321. Дои:10.1038 / природа04727. PMID  16710414.