MUBII-TB-DB - MUBII-TB-DB - Wikipedia

MUBII-TB-DB
Содержание
ОписаниеБаза данных, которая документирует и отслеживает гены устойчивости к антибиотикам туберкулеза.
Типы данных
захвачен		Гены туберкулезной устойчивости к антибиотикам
ОрганизмыБактерии
Контакт
Основное цитированиеPMID  24731071
Доступ
Интернет сайтumr5558-bibiserv.univ-lyon1.fr/ mubii/ mubii-select.cgi.
Разное
Закладки
сущности		да

MUBII-TB-DB это база данных который фокусируется на туберкулез устойчивость к антибиотикам гены.[1] Это хорошо структурированный текстовый база данных сфокусироваться на Микобактерии туберкулеза в семи разных мутация локусы: rpoB, pncA, катГ; mabA (fabG1) -inhA, gyrA, gyrB и rrs.[1][2][3][4][5] MUBII анализирует запрос, используя две параллельные стратегии: 1). А ВЗРЫВ поиск по ранее мутировавшим последовательностям. 2). Согласование последовательностей запросов с последовательностями дикого типа. MUBII выводит графики выравнивания и описание мутация и терапевтическое значение.[1] Терапевтически релевантный мутации помечены как «Высокая уверенность» на основании критериев, установленных Sandgren et al.[6] MUBII-TB-DB предоставляет платформу, которая проста в использовании даже для пользователей, не обученных биоинформатика.[1]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c d Фландруа, Жан-Пьер; Лина, Жерар; Думитреску, Оана (декабрь 2014 г.). «MUBII-TB-DB: база данных мутаций, связанных с устойчивостью к антибиотикам у Mycobacterium tuberculosis». BMC Bioinformatics. 15 (1): 107. Дои:10.1186/1471-2105-15-107. ISSN  1471-2105. ЧВК  4021062. PMID  24731071.
  2. ^ Хейм, Б. (февраль 1997 г.). «Множественная лекарственная устойчивость Mycobacterium tuberculosis». Международный журнал противомикробных агентов. 8 (1): 61–70. Дои:10.1016 / s0924-8579 (96) 00356-1. ISSN  0924-8579. PMID  18611785.
  3. ^ Musser, JM (октябрь 1995 г.). «Устойчивость микобактерий к противомикробным агентам: молекулярно-генетические исследования». Обзоры клинической микробиологии. 8 (4): 496–514. Дои:10,1128 / см. 8.4.496. ISSN  0893-8512. ЧВК  172873. PMID  8665467.
  4. ^ Алмейда да Силва, П. Э .; Паломино, Дж. К. (01.07.2011). «Молекулярные основы и механизмы лекарственной устойчивости Mycobacterium tuberculosis: классические и новые препараты». Журнал антимикробной химиотерапии. 66 (7): 1417–1430. Дои:10.1093 / jac / dkr173. ISSN  0305-7453. PMID  21558086.
  5. ^ Zhang, Y .; Тис, З-З. (2015-11-01). «Механизмы лекарственной устойчивости у Микобактерии туберкулеза: обновление 2015 ». Международный журнал туберкулеза и болезней легких. 19 (11): 1276–1289. Дои:10.5588 / ijtld.15.0389. ISSN  1027-3719. PMID  26467578.
  6. ^ Сандгрен, Андреас; Сильный, Майкл; Мутукришнан, Притика; Вайнер, Брайан К.; Церковь, Джордж М; Мюррей, Меган Б. (10 февраля 2009 г.). «База данных мутаций устойчивости к лекарственным средствам от туберкулеза». PLoS Медицина. 6 (2): e1000002. Дои:10.1371 / journal.pmed.1000002. ISSN  1549-1676. PMID  19209951.