Михаэль Фишбах - Michael Fischbach

Михаэль Фишбах
Родившийся(1980-11-03)3 ноября 1980 г.
Альма-матер
Научная карьера
Учреждения
Интернет сайтwww.fischbachgroup.org

Майкл Эндрю Фишбах (родился 3 ноября 1980 г.) - американский химик, микробиолог и генетик. Он является доцентом биоинженерии и научным сотрудником факультета ChEM-H в Стэндфордский Университет[1][2] и Чан Цукерберг Биохаб Следователь.[3]

Образование

Фишбах получил степень A.B. в Биохимический Науки из Гарвардский колледж в 2003 году. В течение этого времени (2000-2003) он работал в лаборатории Джеффри Сеттлмана в онкологическом центре Массачусетской больницы общего профиля над биохимией онкогенных мутантов малой GTPase. Рас.[4] В 2007 году он защитил докторскую диссертацию. доктор химии и химической биологии Гарвардского университета, работает в Кристофера Т. Уолша лаборатория в Гарвардская медицинская школа о приобретении железа бактериальными патогенами и биохимии биосинтеза натуральных продуктов.[5][6]

Карьера

Фишбах был младшим научным сотрудником кафедры молекулярной биологии в Массачусетская больница общего профиля (2007-2009) до поступления на факультет Калифорнийский университет в Сан-Франциско в 2009 году. Он перешел в Стэнфордский университет в качестве адъюнкт-профессора в сентябре 2017 года. В качестве исследователя биохаба Чана Цукерберга Фишбах является одним из восьми преподавателей в Стэнфорде, Университете Калифорнийского университета в США и Калифорнийском университете в Беркли, который возглавляет запущенную CZ Biohub Microbiome Initiative в 2018 году с целью понять, как микробиота может влиять на здоровье человека.[7]

В настоящее время Фишбах является членом научно-консультативного совета NGM Biopharmaceuticals.[8] и соучредитель Revolution Medicines.[9]

Исследование

Лаборатория Фишбаха занимается обнаружением и характеристикой небольших молекул микроорганизмов, уделяя особое внимание микробиому человека.[10][11]

Небольшие молекулы микробиоты человека

В 2014 году Фишбах и его лаборатория опубликовали обзор биосинтетических генов в человеческий микробиом, описывающий способность связанных с человеком микробов производить тиопептид антибиотики.[12][13][14][15] Лаборатория Фишбаха обнаружила, что комменсальный кишечник Bacteroides fragilis вырабатывает иммуномодулирующий сфинголипид альфа-галактозилцерамид,[16] показали, что производство нейротрансмиттеров распространено среди комменсальных кишечных бактерий,[17] и открыл путь биосинтеза для общего класса желчные кислоты продуцируется кишечными бактериями.[18]

Вычислительные подходы к открытию натуральных продуктов

Лаборатория Фишбаха разработала алгоритм ClusterFinder, который автоматизирует процесс идентификации биосинтетических генов малых молекул в последовательностях бактериального генома.[19][20] Вместе с Марниксом Медема он разработал второй алгоритм для идентификации кластеров биосинтетических генов, antiSMASH,[21] с которым был объединен ClusterFinder.

Личная жизнь

Фишбах женат на Элизабет Саттели, Доцент кафедры химической инженерии в Стэнфорде.[22]

внешняя ссылка

Рекомендации

  1. ^ "Профиль Майкла Фишбаха | Стэнфордские профили". profile.stanford.edu. Получено 2019-07-12.
  2. ^ «Стажеры факультета | ЧЭМ-Н». Chemh.stanford.edu. Получено 2019-07-12.
  3. ^ "Программа исследователей - Биохаб Чана Цукерберга". Получено 2019-07-12.
  4. ^ Fischbach MA, Settleman J. Специфическая биохимическая инактивация онкогенных белков Ras нуклеозиддифосфаткиназой. Cancer Res. 15 июля 2003 г .; 63 (14): 4089-94. PMID  12874011.
  5. ^ Фишбах М.А., Линь Х., Лю Д.Р., Уолш К.Т. Характеристика in vitro IroB, патоген-ассоциированной C-гликозилтрансферазы. Proc Natl Acad Sci U S. A. 2005, 18 января; 102 (3): 571-6. Epub 2004 14 декабря. PMID  15598734; ЧВК  545562.
  6. ^ Walsh CT, Fischbach MA. Натуральные продукты версии 2.0: соединение генов с молекулами. J Am Chem Soc. 3 марта 2010 г .; 132 (8): 2469-93. Дои:10.1021 / ja909118a. PMID  20121095; ЧВК  2828520.
  7. ^ «Чан Цукерберг Biohub финансирует новые исследования, инициативу по микробиому». Центр новостей. Получено 2019-07-12.
  8. ^ «Научно-консультативный совет - НГМ Био». www.ngmbio.com. Архивировано из оригинал на 2018-07-20. Получено 2016-01-07.
  9. ^ «Команда - Лекарства Революции». Revolutionmedicines.com.
  10. ^ «Fischbach Group - Главная». fischbachgroup.org.
  11. ^ Дония М.С., Фишбах М.А. Небольшие молекулы микробиоты человека. Наука. 2015 24 июля; 349 (6246): 1254766. Дои: 10.1126 / science.1254766. Epub 2015 23 июля. Обзор. PMID  26206939; ЧВК  4641445
  12. ^ Дония М.С., Цимерманчич П., Шульце С.Дж., Виланд Браун Л.С., Мартин Дж., Митрева М., Кларди Дж., Линингтон Р.Г., Фишбах М.А. Систематический анализ кластеров биосинтетических генов в микробиоме человека показывает общее семейство антибиотиков. Клетка. 2014 11 сентября; 158 (6): 1402-14. Дои:10.1016 / j.cell.2014.08.032. PMID  25215495; ЧВК  4164201.
  13. ^ «Разработка антибиотиков прямо у нас под носом». Нью-Йорк Таймс. 2014-09-11.
  14. ^ Парк, Алиса (2014-09-12). «Лекарства, сделанные своими руками: скоро антибиотики могут быть сделаны из ваших собственных бактерий». Время. Получено 2018-04-26.
  15. ^ «Установите вора ... Бактериальные спутники человечества - хорошее место для поиска новых лекарств». Экономист. 2014-09-20. Получено 2018-04-26.
  16. ^ Wieland Brown LC, Penaranda C, Kashyap PC, Williams BB, Clardy J, Kronenberg M, Sonnenburg JL, Comstock LE, Bluestone JA, Fischbach MA. Производство α-галактозилцерамида видным представителем кишечной микробиоты человека. PLoS Biol. 2013 июл; 11 (7): e1001610. Дои:10.1371 / journal.pbio.1001610. Epub 2013 16 июля. PMID  23874157; ЧВК  3712910.
  17. ^ Уильямс Б. Б., Ван Беншотен А. Х., Цимерманчич П., Дония М. С., Циммерманн М., Такетани М., Исихара А., Кашьяп П. С., Фрейзер Дж. С., Фишбах М. А.. Открытие и характеристика декарбоксилаз кишечной микробиоты, которые могут продуцировать нейромедиатор триптамин. Клеточный микроб-хозяин. 2014 8 октября; 16 (4): 495-503. Дои:10.1016 / j.chom.2014.09.001. Epub 2014 25 сентября. PMID  25263219; ЧВК  4260654.
  18. ^ Девлин А.С., Фишбах М.А. Путь биосинтеза выдающегося класса желчных кислот, полученных из микробиоты. Nat Chem Biol. 2015 сентябрь; 11 (9): 685-90. Дои:10.1038 / nchembio.1864. Epub 2015 20 июля. PMID  26192599; ЧВК  4543561.
  19. ^ Cimermancic P, Medema MH, Claesen J, Kurita K, Wieland Brown LC, Mavrommatis K, Pati A, Godfrey PA, Koehrsen M, Clardy J, Birren BW, Takano E, Sali A, Linington RG, Fischbach MA. Понимание вторичного метаболизма на основе глобального анализа кластеров генов биосинтеза прокариот. Клетка. 2014 17 июля; 158 (2): 412-21. Дои:10.1016 / j.cell.2014.06.034. PMID  25036635; ЧВК  4123684.
  20. ^ Medema MH, Fischbach MA. Вычислительные подходы к открытию натуральных продуктов. Nat Chem Biol. 2015 сентябрь; 11 (9): 639-48. Дои:10.1038 / nchembio.1884. PMID  26284671.
  21. ^ «бактериальный вариант антиСМАШ». antismash.secondarymetabolites.org.
  22. ^ "Профиль Элизабет Саттели | Стэнфордские профили". profile.stanford.edu. Получено 2019-07-12.