Микроцин - Microcin

Subtilosin_A
PDB 1pxq EBI.jpg
структура субтилозина А
Идентификаторы
СимволSubtilosin_A
PfamPF11420
ИнтерПроIPR021539
TCDB1.C.84
OPM суперсемейство379
Белок OPM1pxq

Микроцины очень маленькие бактериоцины, состоящий из относительно небольшого количества аминокислоты. По этой причине они отличаются от своих более крупных белок кузены. Классическим примером является микроцин V, из кишечная палочка. Субтилозин А - еще один бактериоцин из Bacillus subtilis. В пептид имеет циклизованный каркас и образует три поперечные связи между серой Cys13, Cys7 и Cys4 и альфа-положениями Phe22, Thr28 и Phe31.[1]

Микроцины производства комменсальный Кишечная палочка штаммы нацелены и устранены кишечный патогены, такие как Salmonella enterica подражая сидерофоры патогены используют для удаления железа. Микроцины также помогают комменсальным штаммам Кишечная палочка побеждать патогенные штаммы.[2]

БАКТИБАЗА[3][4] database - это база данных с открытым доступом для бактериоцинов, включая микоцины.

Рекомендации

  1. ^ Kawulka KE, Sprules T, Diaper CM, Whittal RM, McKay RT, Mercier P, Zuber P, Vederas JC (март 2004 г.). «Структура субтилозина А, циклического антимикробного пептида из Bacillus subtilis с необычными поперечными связями серы и альфа-углерода: образование и восстановление производных альфа-тио-альфа-аминокислот». Биохимия. 43 (12): 3385–95. Дои:10.1021 / bi0359527. PMID  15035610.
  2. ^ Тине Хесман Сэй, «Крошечные токсичные белки помогают кишечным бактериям побеждать соперников», Журнал Science News Vol. 190, No. 12, 10 декабря 2016 г., с. 5
  3. ^ Хаммами Р., Зухир А., Бен Хамида Дж., Флисс I (2007). "BACTIBASE: новая доступная в Интернете база данных для характеристики бактериоцина". BMC Microbiology. 7: 89. Дои:10.1186/1471-2180-7-89. ЧВК  2211298. PMID  17941971.
  4. ^ Hammami R, Zouhir A, Le Lay C, Ben Hamida J, Fliss I (2010). «Второй выпуск BACTIBASE: база данных и инструментальная платформа для характеристики бактериоцина». BMC Microbiology. 10: 22. Дои:10.1186/1471-2180-10-22. ЧВК  2824694. PMID  20105292.