Фактор трансляционного высвобождения митохондрий 1 - Mitochondrial translational release factor 1

MTRF1
Идентификаторы
Псевдонимы	MTRF1, MRF1, MTTRF1, RF1, фактор высвобождения трансляции митохондрий 1, фактор высвобождения трансляции митохондрий 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 604601 MGI: 2384815 ГомолоГен: 20903 Генные карты: MTRF1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 13 (человек)[1] Группа 13q14.11 Начинать 41,216,369 бп[1] Конец 41,263,577 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 14 (мышь)[2] Группа 14 | 14 D3 Начинать 79,397,772 бп[2] Конец 79,423,587 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • активность фактора освобождения перевода • активность фактора высвобождения трансляции, специфичная для кодона • связывание рибосом Сотовый компонент • митохондрия • цитоплазма Биологический процесс • прекращение перевода • регулирование прекращения перевода • биосинтез белка • прекращение трансляции митохондрий Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9617	211253
Ансамбль	ENSG00000120662	ENSMUSG00000022022
UniProt	O75570 Q8N6Z2	Q8K126
RefSeq (мРНК)	NM_004294 NM_001354073 NM_001354074 NM_001354076	NM_145960
RefSeq (белок)	NP_004285 NP_001341002 NP_001341003 NP_001341005	NP_666072
Расположение (UCSC)	Chr 13: 41.22 - 41.26 Мб	Chr 14: 79,4 - 79,42 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор трансляционного высвобождения митохондрий 1, также известный как MTRF1 человек ген.^[5][6]

В белок кодируемый этим геном, направляет прекращение перевод в ответ на пептидную цепь кодоны терминации. Первоначально считалось, что он играет роль в прекращении митохондрии синтез белка. Предполагается, что mtRF1 распознает нестандартные стоп-кодоны AGA и AGG у позвоночных. В качестве альтернативы, на основе подробного трехмерного моделирования было предложено распознавать застопорившиеся рибосомы, в которых тРНК все еще связана с пептидной цепью, но в которых А-сайт рибосомы пуст.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000120662 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022022 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Zhang Y, Spremulli LL (ноябрь 1998 г.). «Идентификация и клонирование фактора высвобождения трансляции митохондрий человека 1 и фактора рециклинга рибосом». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1443 (1–2): 245–50. Дои:10.1016 / S0167-4781 (98) 00223-1. PMID  9838146.
6. Хансен Л.Л., Йоргенсен Р., Юстесен Дж. (2000). «Отнесение фактора высвобождения трансляции митохондрий 1 человека (MTRF1) к хромосоме 13q14.1 → q14.3 и фактора рециклинга митохондриальных рибосом человека (MRRF) к хромосоме 9q32 → q34.1 с помощью радиационного гибридного картирования». Цитогенетика и клеточная генетика. 88 (1–2): 91–2. Дои:10.1159/000015494. PMID  10773675.

дальнейшее чтение

• Нодзаки Ю., Мацунага Н., Исидзава Т. и др. (2008). «HMRF1L представляет собой фактор высвобождения трансляции митохондрий человека, участвующий в декодировании терминационных кодонов UAA и UAG». Гены Клетки. 13 (5): 429–38. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2008.01181.x. PMID  18429816.
• Данэм А., Мэтьюз Л.Х., Бертон Дж. И др. (2004). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 13 человека». Природа. 428 (6982): 522–8. Дои:10.1038 / природа02379. ЧВК  2665288. PMID  15057823.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Геномные исследования. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Природа Генетика. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Труды Национальной академии наук. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Soleimanpour-Lichaei HR, Kühl I, Gaisne M, et al. (2007). «mtRF1a представляет собой фактор высвобождения трансляции митохондрий человека, декодирующий основные кодоны терминации UAA и UAG». Молекулярная клетка. 27 (5): 745–57. Дои:10.1016 / j.molcel.2007.06.031. ЧВК  1976341. PMID  17803939.
• Молодой ди-джей, Эдгар С.Д., Мерфи Дж. И др. (2010). «Биоинформатический, структурный и функциональный анализы подтверждают, что подобный фактору высвобождения MTRF1 является белком, способным декодировать нестандартные стоп-кодоны, начинающиеся с аденина, в митохондриях позвоночных». РНК. 16 (6): 1146–55. Дои:10.1261 / rna.1970310. ЧВК  2874167. PMID  20421313.
• Huynen, MA, Martijn; Дуарте I; Chrzanowska-Lightowlers ZM; Набуурс СБ. (8 мая 2012 г.). «Структурная гипотеза механизма спасения митохондриальных рибосом». Биология Директ. 7 (1): 14. Дои:10.1186/1745-6150-7-14. ЧВК  3418547. PMID  22569235.
• Линд, С; Sund J; Аквист Дж (2013). «Особенности считывания кодонов факторов высвобождения митохондрий и прекращение трансляции нестандартных стоп-кодонов». Nature Communications. 4: 2940. Дои:10.1038 / ncomms3940. PMID  24352605.