NDRG4 - NDRG4

NDRG4
Идентификаторы
Псевдонимы	NDRG4, BDM1, SMAP-8, SMAP8, член семейства NDRG 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 614463 MGI: 2384590 ГомолоГен: 23228 Генные карты: NDRG4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16q21 Начните 58,462,846 бп[1] Конец 58,513,628 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 | 8 D1 Начните 95,676,980 бп[2] Конец 95,715,119 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • молекулярная функция Сотовый компонент • цитозоль • базолатеральная плазматическая мембрана • клеточная проекционная мембрана • цитоплазма • митохондрия • мембрана эндоплазматического ретикулума Биологический процесс • визуальное обучение • отрицательная регуляция сигнального пути рецептора фактора роста тромбоцитов • миграция клеток, участвующих в развитии сердца • дифференциация клеток • отрицательная регуляция пролиферации гладкомышечных клеток • регулирование рециркуляции эндоцитов • отрицательная регуляция миграции клеток гладких мышц • пролиферация клеток сердечной мышцы • эмбриональное развитие сердечной трубки • зацикливание сердца • рост клеток • стыковка пузырьков • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • положительная регуляция развития проекции нейронов • развитие мозга • преобразование сигнала Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	65009	234593
Ансамбль	ENSG00000103034	ENSMUSG00000036564
UniProt	Q9ULP0	Q8BTG7
RefSeq (мРНК)	NM_001130487 NM_001242833 NM_001242834 NM_001242835 NM_001242836 NM_020465 NM_022910 NM_001363869	NM_001195006 NM_145602
RefSeq (белок)	NP_001123959 NP_001229762 NP_001229763 NP_001229764 NP_001229765 NP_065198 NP_075061 NP_001350798 NP_001365261 NP_001365262 NP_001365263 NP_001365264 NP_001365265 NP_001365266 NP_001365267 NP_001365268 NP_001365269 NP_001365270 NP_001365271 NP_001365272 NP_001365273 NP_001365274 NP_001365275 NP_001365276	NP_001181935 NP_663577 NP_001359350 NP_001359352 NP_001359354 NP_001359355 NP_001359356 NP_001359357 NP_001359358 NP_001359359 NP_001359360 NP_001359361 NP_001359362 NP_001359363 NP_001359364
Расположение (UCSC)	Chr 16: 58,46 - 58,51 Мб	Chr 8: 95.68 - 95.72 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок NDRG4 это белок что у людей кодируется NDRG4 ген.^[5][6][7]

Этот ген является членом семейства генов с подавлением N-myc, которое принадлежит к альфа / бета гидролаза надсемейство. Белок, кодируемый этим геном, представляет собой цитоплазматический белок, который может участвовать в регуляции митогенный сигнализация в сосуде гладкие мышцы клетки. Было описано несколько альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов этого гена, но полноразмерная природа некоторых из этих вариантов не была определена.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000103034 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036564 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чжоу Р.Х., Кокаме К., Цукамото Ю., Ютани С., Като Х., Мията Т. (май 2001 г.). «Характеристика семейства генов NDRG человека: недавно идентифицированный член, NDRG4, специфически экспрессируется в мозге и сердце». Геномика. 73 (1): 86–97. Дои:10.1006 / geno.2000.6496. PMID  11352569.
6. Хонго С., Ватанабэ Т., Такахаши К., Миядзаки А. (апрель 2006 г.). «Ndrg4 усиливает активацию ERK, индуцированную NGF, не связанную с активацией Elk-1». J Cell Biochem. 98 (1): 185–93. Дои:10.1002 / jcb.20763. PMID  16408304. S2CID  10192022.
7. «Entrez Gene: NDRG4 член семьи NDRG 4».

дальнейшее чтение

• Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Н. и др. (2003). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Res. 9 (3): 99–106. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID  12168954.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Хиросава М., Нагасе Т., Исикава К. и др. (2000). «Характеристика клонов кДНК, выбранных с помощью анализа GeneMark из фракционированных по размеру библиотек кДНК головного мозга человека». ДНК Res. 6 (5): 329–36. Дои:10.1093 / днарес / 6.5.329. PMID  10574461.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Цюй X, Чжай Ю., Вэй Х и др. (2002). «Характеристика и экспрессия трех новых генов, связанных с дифференцировкой, принадлежат к семейству генов NDRG человека». Мол. Cell. Биохим. 229 (1–2): 35–44. Дои:10.1023 / А: 1017934810825. PMID  11936845. S2CID  24226208.
• Оки Т., Хонго С., Накада Н. и др. (2002). «Ингибирование роста нейритов за счет снижения уровня белка NDRG4 в клетках PC12, трансфицированных антисмыслом». Brain Res. Dev. Мозг Res. 135 (1–2): 55–63. Дои:10.1016 / S0165-3806 (02) 00300-0. PMID  11978393.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Нишимото С., Тавара Дж, Тойода Х и др. (2003). «Новый чувствительный к гомоцистеину ген, smap8, модулирует митогенез в гладкомышечных клетках сосудов крыс». Евро. J. Biochem. 270 (11): 2521–31. Дои:10.1046 / j.1432-1033.2003.03626.x. PMID  12755708.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.