NFKBIB - NFKBIB

NFKBIB
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1K3Z, 1OY3
Идентификаторы
Псевдонимы	NFKBIB, IKBB, TRIP9, бета-ингибитор NFKB
Внешние идентификаторы	OMIM: 604495 MGI: 104752 ГомолоГен: 37631 Генные карты: NFKBIB
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.2 Начинать 38,899,700 бп[1] Конец 38,908,893 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 B1 Начинать 28,758,251 бп[2] Конец 28,767,512 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность преобразователя сигнала • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки • цитозоль Биологический процесс • транскрипция, ДНК-шаблон • клеточный ответ на липополисахарид • преобразование сигнала • позитивная регуляция транскрипции, основанной на нуклеиновых кислотах Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4793	18036
Ансамбль	ENSG00000104825 ENSG00000282905	ENSMUSG00000030595
UniProt	Q15653	Q60778
RefSeq (мРНК)	NM_001001716 NM_001243116 NM_002503 NM_001369699 NM_001369700	NM_010908 NM_001306222
RefSeq (белок)	NP_001230045 NP_002494 NP_001356628 NP_001356629	NP_001293151 NP_035038
Расположение (UCSC)	Chr 19: 38.9 - 38.91 Мб	Chr 7: 28.76 - 28.77 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Бета-ингибитор NF-каппа-B это белок что у людей кодируется NFKBIB ген.^[5]

Функция

NFKB1 (MIM 164011) или NFKB2 (MIM 164012) связан с REL (MIM 164910), RELA (MIM 164014) или RELB (MIM 604758) с образованием комплекса NFKB. Комплекс NFKB ингибируется белками I-каппа-B (NFKBIA, MIM 164008 или NFKBIB), которые инактивируют NF-каппа-B, улавливая его в цитоплазме. Фосфорилирование сериновых остатков на белках I-каппа-B с помощью киназ (IKBKA, MIM 600664 или IKBKB, MIM 603258) маркирует их для разрушения через путь убиквитинирования, тем самым позволяя активировать комплекс NF-каппа-B. Активированный комплекс NFKB перемещается в ядро ​​и связывает ДНК по каппа-B-связывающим мотивам, таким как 5-первичный GGGRNNYYCC 3-первичный или 5-первичный HGGARNYYCC 3-первичный (где H представляет собой A, C или T; R представляет собой A или G пурин; и Y представляет собой C- или T-пиримидин). [Поставляется OMIM]^[6]

Взаимодействия

NFKBIB был показан взаимодействовать с:

• IKK2,^[7]
• РЕЛА,^[8][9] и
• Ретиноидный рецептор X альфа.^[10]

Рекомендации

1. ENSG00000282905 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000104825, ENSG00000282905 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030595 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Окамото Т., Оно Т., Хори М., Ян Дж. П., Тецука Т., Кавабе Т., Сонта С. (ноябрь 1998 г.). «Отнесение гена IkappaB-beta NFKBIB к полосе хромосомы человека 19q13.1 путем гибридизации in situ». Cytogenet Cell Genet. 82 (1–2): 105–6. Дои:10.1159/000015077. PMID  9763672. S2CID  85077804.
6. "Ген Entrez: NFKBIB ядерный фактор усилителя гена легкого полипептида каппа в ингибиторе B-клеток, бета".
7. Woronicz JD, Gao X, Cao Z, Rothe M, Goeddel DV (октябрь 1997 г.). «IkappaB киназа-бета: активация NF-kappaB и образование комплекса с IkappaB киназой-альфа и NIK». Наука. 278 (5339): 866–9. Дои:10.1126 / science.278.5339.866. PMID  9346485.
8. Чен Й, Ву Дж, Гош Г. (июнь 2003 г.). «KappaB-Ras связывается с уникальной вставкой в ​​домене анкириновых повторов IkappaBbeta и регулирует удерживание в цитоплазме комплексов IkappaBbeta x NF-kappaB». J. Biol. Chem. 278 (25): 23101–6. Дои:10.1074 / jbc.M301021200. PMID  12672800.
9. Суян Х., Филлипс Р., Дуглас И., Гош С. (октябрь 1996 г.). «Роль нефосфорилированного, недавно синтезированного I каппа B бета в стойкой активации NF-каппа B». Мол. Клетка. Биол. 16 (10): 5444–9. Дои:10.1128 / mcb.16.10.5444. ЧВК  231544. PMID  8816457.
10. На СИ, Ким Х.Дж., Ли С.К., Чой Х.С., На Д.С., Ли МО, Чанг М., Мур Д.Д., Ли Дж.В. (февраль 1998 г.). «IkappaBbeta взаимодействует с рецептором ретиноида X и ингибирует ретиноид-зависимую трансактивацию в клетках, обработанных липополисахаридом». J. Biol. Chem. 273 (6): 3212–5. Дои:10.1074 / jbc.273.6.3212. PMID  9452433.

дальнейшее чтение

• Ли Дж. У., Чой Х. С., Гьюрис Дж., Брент Р., Мур Д. Д. (1995). «Два класса белков, которые зависят от наличия или отсутствия тироидного гормона для взаимодействия с рецептором тироидного гормона». Мол. Эндокринол. 9 (2): 243–54. Дои:10.1210 / me.9.2.243. PMID  7776974.
• Хархадж Э., Блейни Дж., Миллхаус С., Сан SC (1996). «Дифференциальные эффекты молекул I каппа B на Tat-опосредованную трансактивацию LTR ВИЧ-1». Вирусология. 216 (1): 284–7. Дои:10.1006 / viro.1996.0062. PMID  8615004.
• ДиДонато Дж., Меркурио Ф., Розетка С, Ву-Ли Дж., Суян Х., Гош С., Карин М. (1996). «Картирование индуцибельных сайтов фосфорилирования IkappaB, которые сигнализируют о его убиквитинизации и деградации». Мол. Клетка. Биол. 16 (4): 1295–304. Дои:10.1128 / mcb.16.4.1295. ЧВК  231113. PMID  8657102.
• Бопарлан П., Квон Х., Кларк М., Лин Р., Соненберг Н., Вайнберг М., Хискотт Дж. (1996). «Трансдоминантные мутанты I каппа B альфа блокируют Tat-фактор некроза опухоли, синергетическая активация экспрессии гена вируса иммунодефицита человека типа 1 и размножения вируса». Дж. Вирол. 70 (9): 5777–85. Дои:10.1128 / JVI.70.9.5777-5785.1996. ЧВК  190591. PMID  8709193.
• Суян Х., Филлипс Р., Дуглас И., Гош С. (1996). «Роль нефосфорилированного, недавно синтезированного I каппа B бета в стойкой активации NF-каппа B». Мол. Клетка. Биол. 16 (10): 5444–9. Дои:10.1128 / mcb.16.10.5444. ЧВК  231544. PMID  8816457.
• Whiteside ST, Epinat JC, Rice NR, Israël A (1997). «I kappa B epsilon, новый член семейства I kappa B, контролирует активность RelA и cRel NF-kappa B». EMBO J. 16 (6): 1413–26. Дои:10.1093 / emboj / 16.6.1413. ЧВК  1169738. PMID  9135156.
• ДиДонато Дж.А., Хаякава М., Ротварф Д.М., Занди Э., Карин М. (1997). «Цитокин-чувствительная киназа IkappaB, которая активирует фактор транскрипции NF-kappaB». Природа. 388 (6642): 548–54. Дои:10.1038/41493. PMID  9252186. S2CID  4354442.
• McKinsey TA, Chu ZL, Ballard DW (1997). "Фосфорилирование домена PEST IkappaBbeta регулирует функцию комплексов NF-kappaB / IkappaBbeta". J. Biol. Chem. 272 (36): 22377–80. Дои:10.1074 / jbc.272.36.22377. PMID  9278383.
• Воронич Дж. Д., Гао X, Цао З., Роте М., Геддел Д. В. (1997). «IkappaB киназа-бета: активация NF-kappaB и образование комплекса с IkappaB киназой-альфа и NIK». Наука. 278 (5339): 866–9. Дои:10.1126 / science.278.5339.866. PMID  9346485.
• На СИ, Ким Х.Дж., Ли С.К., Чой Х.С., На Д.С., Ли МО, Чанг М., Мур Д.Д., Ли Дж.В. (1998). «IkappaBbeta взаимодействует с рецептором ретиноида X и ингибирует ретиноид-зависимую трансактивацию в клетках, обработанных липополисахаридом». J. Biol. Chem. 273 (6): 3212–5. Дои:10.1074 / jbc.273.6.3212. PMID  9452433.
• Ли ФС, Питерс РТ, Данг Л.С., Маниатис Т (1998). «MEKK1 активирует как киназу IκB α, так и киназу β IκB». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (16): 9319–24. Дои:10.1073 / пнас.95.16.9319. ЧВК  21336. PMID  9689078.
• Занди Э, Чен Й, Карин М (1998). «Прямое фосфорилирование IkappaB с помощью IKKalpha и IKKbeta: различение между свободным и связанным с NF-kappaB субстратом». Наука. 281 (5381): 1360–3. Дои:10.1126 / science.281.5381.1360. PMID  9721103.
• Бласкес М.В., Мачо А., Ортис С., Лусена С., Лопес-Кабрера М., Санчес-Мадрид Ф., Муньос Е. (1999). «Внеклеточный белок Tat 1 ВИЧ типа 1 индуцирует экспрессию CD69 посредством активации NF-kappaB: возможная корреляция с Tat-связывающими белками клеточной поверхности». AIDS Res. Гм. Ретровирусы. 15 (13): 1209–18. Дои:10.1089/088922299310304. PMID  10480634.
• Ву С., Гош С. (1999). «бета-TrCP опосредует индуцированное сигналом убиквитинирование IkappaBbeta». J. Biol. Chem. 274 (42): 29591–4. Дои:10.1074 / jbc.274.42.29591. PMID  10514424.
• Кумар А., Дхаван С., Мукхопадхьяй А., Аггарвал Б. Б. (2000). «Вирус иммунодефицита человека-1-tat индуцирует матриксную металлопротеиназу-9 в моноцитах посредством опосредованной протеинтирозинфосфатазой активации ядерного фактора транскрипции NF-kappaB». FEBS Lett. 462 (1–2): 140–4. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 01487-8. PMID  10580107. S2CID  86721940.
• Фенвик С., На С.Ю., Волл Р.Э., Чжун Х., Им С.Ю., Ли Дж. У., Гош С. (2000). «Подкласс белков Ras, регулирующих деградацию IkappaB». Наука. 287 (5454): 869–73. Дои:10.1126 / science.287.5454.869. PMID  10657303.
• Манна СК, Аггарвал ББ (2000). «Дифференциальная потребность в p56lck в ВИЧ-tat по сравнению с клеточными ответами, индуцированными TNF: влияние на NF-каппа B, протеин-активатор-1, N-концевую киназу c-Jun и апоптоз». J. Immunol. 164 (10): 5156–66. Дои:10.4049 / jimmunol.164.10.5156. PMID  10799874.
• Ли Х, Йозеф Дж, Мараско В.А. (2001). «Hiv-1 Tat может существенно повысить способность NIK вызывать деградацию IkappaB». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 286 (3): 587–94. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5442. PMID  11511100.
• Пейдж М., Такерман Э.М., Ли Т.К., Лэрд С.М. (2002). «Экспрессия компонентов ядерного фактора каппа B в эндометрии человека». J. Reprod. Иммунол. 54 (1–2): 1–13. Дои:10.1016 / S0165-0378 (01) 00122-X. PMID  11839392.