NIP7 - NIP7

NIP7
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1SQW, 1T5Y
Идентификаторы
Псевдонимы	NIP7, HSPC031, KD93, CGI-37, ядрышковый белок процессинга пре-рРНК, ядрышковый белок процессинга пре-рРНК NIP7
Внешние идентификаторы	MGI: 1913414 ГомолоГен: 56743 Генные карты: NIP7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16q22.1 Начинать 69,337,996 бп[1] Конец 69,343,106 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 | 8 D3 Начинать 107,056,877 бп[2] Конец 107,060,931 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • ядро клетки • ядрышко • прерибосома, предшественник большой субъединицы • цитозоль Биологический процесс • биогенез рибосом • сборка рибосом • биогенез большой субъединицы рибосомы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51388	66164
Ансамбль	ENSG00000132603	ENSMUSG00000031917
UniProt	Q9Y221	Q9CXK8
RefSeq (мРНК)	NM_016101 NM_001199434	NM_001164472 NM_025391
RefSeq (белок)	NP_001186363 NP_057185	NP_001157944 NP_079667
Расположение (UCSC)	Chr 16: 69.34 - 69.34 Мб	Chr 8: 107.06 - 107.06 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гомолог белка биогенеза 60S субъединицы рибосомы NIP7 это белок что у людей кодируется NIP7 ген.^[5][6]

Взаимодействия

NIP7 был показан взаимодействовать с NOL8.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000132603 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031917 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Секигучи Т., Тодака Ю., Ван И, Хиросе Э, Накашима Н., Нисимото Т. (февраль 2004 г.). «Новый ядрышковый белок человека, Nop132, связывается с белками G, RRAG A / C / D». J Biol Chem. 279 (9): 8343–50. Дои:10.1074 / jbc.M305935200. PMID  14660641.
6. «Ген Entrez: ядерный гомолог импорта 7 NIP7 (S. cerevisiae)».

дальнейшее чтение

• Лай Ч., Чжоу Ц.Ю., Чан ЛЙ, Лю Ц.С., Лин В. (2000). «Идентификация новых человеческих генов, эволюционно консервативных у Caenorhabditis elegans, с помощью сравнительной протеомики». Genome Res. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК  310876. PMID  10810093.
• Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
• Шаньон П., Мишо Дж., Митчелл Дж., Мерсье Дж., Марион Дж. Ф., Друин Е., Раскин-Вебер А., Хадсон Т. Дж., Рихтер А. (2003). «Миссенс-мутация (R565W) цирроза печени (FLJ14728) при циррозе у детей в Северной Америке». Являюсь. J. Hum. Genet. 71 (6): 1443–9. Дои:10.1086/344580. ЧВК  378590. PMID  12417987.
• Шерл А., Коуте Й, Деон С., Калле А., Киндбайтер К., Санчес Дж. К., Греко А., Хохштрассер Д., Диас Дж. Дж. (2003). «Функциональный протеомный анализ ядрышка человека». Мол. Биол. Клетка. 13 (11): 4100–9. Дои:10.1091 / mbc.E02-05-0271. ЧВК  133617. PMID  12429849.
• Лю Дж. Ф., Ван XQ, Ван З. X, Чен Дж. Р., Цзян Т., Ань ХМ, Чанг В. Р., Лян, округ Колумбия (2005). «Кристаллическая структура KD93, нового белка, экспрессируемого в человеческих гемопоэтических стволовых / предшественниках». J. Struct. Биол. 148 (3): 370–4. Дои:10.1016 / j.jsb.2004.06.010. PMID  15522784.
• Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К., Онг С. Е., Лион CE, Ламонд А. И., Манн М. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• О ДжХ, Ян Джо, Хан И, Ким М.Р., Бён СС, Чон Й.Дж., Ким Дж.М., Сон К.С., Но С.М., Ким С., Ю HS, Ким Ю.С., Ким Н.С. (2006) «Транскриптомный анализ рака желудка человека». Мамм. Геном. 16 (12): 942–54. Дои:10.1007 / s00335-005-0075-2. PMID  16341674. S2CID  69278.