NPAT (ген) - NPAT (gene)

NPAT
Идентификаторы
Псевдонимы	NPAT, E14, E14 / p220, ядерный белок, коактиватор транскрипции гистонов, ядерный белок, коактиватор транскрипции гистонов
Внешние идентификаторы	OMIM: 601448 MGI: 107605 ГомолоГен: 1888 Генные карты: NPAT
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q22.3 Начните 108,157,215 бп[1] Конец 108,222,638 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 A5.3 | 9 29,12 см Начните 53,537,047 бп[2] Конец 53,574,342 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • связывание с С-концом белка • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • связывание с N-концом белка • GO: 0001104 активность корегулятора транскрипции Сотовый компонент • цитоплазма • Тело Кахала • ядро клетки • Близнецы свернутых тел • нуклеоплазма Биологический процесс • регуляция экспрессии генов • положительная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • клеточный цикл • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, вовлеченная в G1 / S переход митотического клеточного цикла • транскрипция, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с использованием шаблона нуклеиновой кислоты Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4863	244879
Ансамбль	ENSG00000149308	ENSMUSG00000033054
UniProt	Q14207	Q8BMA5
RefSeq (мРНК)	NM_002519 NM_001321307	NM_001081152
RefSeq (белок)	NP_001308236 NP_002510	NP_001074621
Расположение (UCSC)	Chr 11: 108.16 - 108.22 Мб	Chr 9: 53,54 - 53,57 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок NPAT также известен как ядерный белок локуса ATM это белок что у людей кодируется NPAT ген.^[5][6]

Взаимодействия

NPAT (ген) показал взаимодействовать с Глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа^[7] и POU2F1.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000149308 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000033054 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Имаи Т., Сугавара Т., Нишияма А., Шимада Р., Оки Р., Секи Н., Сагара М., Ито Х., Ямаути М., Хори Т. (июнь 1997 г.). «Структура и организация человеческого гена NPAT». Геномика. 42 (3): 388–92. Дои:10.1006 / geno.1997.4769. PMID  9205109.
6. «Ген Entrez: ядерный белок NPAT, локус атаксии-телеангиэктазии».
7. Чжэн Л., Редер Р., Ло И (июль 2003 г.). «Активация S-фазы промотора гистона H2B с помощью OCA-S, коактиваторного комплекса, который содержит GAPDH в качестве ключевого компонента». Клетка. 114 (2): 255–66. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00552-X. PMID  12887926. S2CID  5543647.

дальнейшее чтение

• Имаи Т., Ямаути М., Секи Н., Сугавара Т., Сайто Т., Мацуда И., Ито Х., Нагасе Т., Номура Н., Хори Т. (май 1996 г.). «Идентификация и характеристика нового гена, физически связанного с геном ATM». Геномные исследования. 6 (5): 439–47. Дои:10.1101 / гр.6.5.439. PMID  8743993.
• Берд П.Дж., МакКонвилл С.М., Купер П., Паркхилл Дж., Станкович Т., Макгуайр Г.М., Толстый Д.А., Тейлор А.М. (январь 1996 г.). «Мутации, выявленные путем секвенирования 5'-половины гена атаксии телеангиэктазии». Молекулярная генетика человека. 5 (1): 145–9. Дои:10.1093 / hmg / 5.1.145. PMID  8789452.
• Берд П.Дж., Купер П.Р., Станкович Т., Куллар Х.С., Уоттс Г.Д., Робинсон П.Дж., Тейлор М.Р. (ноябрь 1996 г.). «Ген, транскрибируемый с двунаправленного промотора ATM, кодирующий богатый серином белок: исследования аминокислотной последовательности, структуры и экспрессии». Молекулярная генетика человека. 5 (11): 1785–91. Дои:10.1093 / hmg / 5.11.1785. PMID  8923007.
• Чжао Дж., Динлахт Б., Имаи Т., Хори Т., Харлоу Э. (февраль 1998 г.). «Экспрессия NPAT, нового субстрата циклина E-CDK2, способствует переходу в S-фазу». Гены и развитие. 12 (4): 456–61. Дои:10.1101 / gad.12.4.456. ЧВК  316526. PMID  9472014.
• Чжао Дж., Кеннеди Б.К., Лоуренс Б.Д., Барби Д.А., Матера А.Г., Флетчер Дж. А., Харлоу Э. (сентябрь 2000 г.). «NPAT связывает циклин E-Cdk2 с регуляцией зависимой от репликации транскрипции гистонового гена». Гены и развитие. 14 (18): 2283–97. Дои:10.1101 / gad.827700. ЧВК  316937. PMID  10995386.
• Сагара М., Такеда Е., Нишияма А., Уцуми С., Тояма Ю., Юаса С., Ниномия Ю., Имаи Т. (декабрь 2002 г.). «Характеристика функциональных областей для ядерной локализации NPAT». Журнал биохимии. 132 (6): 875–9. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a003300. PMID  12473189.
• Гао Джи, Бракен А.П., Буркард К., Пазини Д., Классон М., Аттвуолл С., Сагара М., Имаи Т., Хелин К., Чжао Дж. (Апрель 2003 г.). «Экспрессия NPAT регулируется E2F и необходима для развития клеточного цикла». Молекулярная и клеточная биология. 23 (8): 2821–33. Дои:10.1128 / MCB.23.8.2821-2833.2003. ЧВК  152552. PMID  12665581.
• Вэй Й, Джин Дж, Харпер Дж. У. (май 2003 г.). «Субстрат циклина E / Cdk2 и компонент тельца Кахаля p220 (NPAT) активируют транскрипцию гистонов через новый LisH-подобный домен». Молекулярная и клеточная биология. 23 (10): 3669–80. Дои:10.1128 / MCB.23.10.3669-3680.2003. ЧВК  164767. PMID  12724424.
• Чжэн Л., Редер Р., Ло И (июль 2003 г.). «Активация S-фазы промотора гистона H2B с помощью OCA-S, коактиваторного комплекса, который содержит GAPDH в качестве ключевого компонента». Клетка. 114 (2): 255–66. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00552-X. PMID  12887926. S2CID  5543647.
• Е Икс, Вэй И, Налепа Дж., Харпер Дж. У. (декабрь 2003 г.). «Субстрат p220 циклина E / Cdk2 (NPAT) необходим для входа в S-фазу, экспрессии гистонового гена и поддержания тельца Кахаля в соматических клетках человека». Молекулярная и клеточная биология. 23 (23): 8586–600. Дои:10.1128 / MCB.23.23.8586-8600.2003. ЧВК  262656. PMID  14612403.
• Ван А., Икура Т., Это К., Ота М.С. (декабрь 2004 г.). «Динамическое взаимодействие p220 (NPAT) и CBP / p300 способствует переходу в S-фазу». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 325 (4): 1509–16. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.10.198. PMID  15555599.
• Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (январь 2006 г. ). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Геномные исследования. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Калла С., Шойерманн М.О., Кубе И., Шлоттер М., Мертенс Д., Дёнер Х., Штильгенбауэр С., Лихтер П. (май 2007 г.). «Анализ генов-мишеней делеции 11q22-q23 в B-клеточной хронической лимфоцитарной лейкемии: доказательства патогенной роли NPAT, CUL5 и PPP2R1B». Европейский журнал рака. 43 (8): 1328–35. Дои:10.1016 / j.ejca.2007.02.005. PMID  17449237.
• Medina R, van der Deen M, Miele-Chamberland A, Xie RL, van Wijnen AJ, Stein JL, Stein GS (ноябрь 2007 г.). «Путь передачи сигнала клеточного цикла HiNF-P / p220NPAT контролирует негистоновые гены-мишени». Исследования рака. 67 (21): 10334–42. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-1560. PMID  17974976.