NUDT2 - NUDT2

NUDT2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1XSA, 1XSB, 1XSC, 3U53, 4ICK, 4IJX
Идентификаторы
Псевдонимы	NUDT2, APAH1, нудикс гидролаза 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 602852 MGI: 1913651 ГомолоГен: 896 Генные карты: NUDT2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9п13.3 Начните 34,329,506 бп[1] Конец 34,343,711 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 A5 Начните 41,465,151 бп[2] Конец 41,480,926 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • бис (5'-нуклеозил) тетрафосфатазная активность • Связывание GTP • бис (5'-нуклеозил) тетрафосфатаза (симметричная) активность • GO: 0001948 связывание с белками • гидролазная активность • бис (5'-нуклеозил) тетрафосфатаза (асимметричная) активность Сотовый компонент • митохондриальный матрикс Биологический процесс • метаболический процесс соединения, содержащего азотистые основания • апоптотический процесс • клеточный ответ на окислительный стресс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	318	66401
Ансамбль	ENSG00000164978	ENSMUSG00000028443
UniProt	P50583	P56380
RefSeq (мРНК)	NM_147173 NM_001161 NM_001244390 NM_147172	NM_025539
RefSeq (белок)	NP_001152 NP_001231319 NP_671701 NP_671702	NP_079815
Расположение (UCSC)	Chr 9: 34.33 - 34.34 Мб	Chr 4: 41.47 - 41.48 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Бис (5'-нуклеозил) тетрафосфатаза [асимметричная] является фермент что у людей кодируется NUDT2 ген.^[5][6][7]

Этот ген кодирует члена семейства нуклеотидпирофосфатаз MutT, подмножество более крупного семейства гидролаз NUDIX. Продукт гена содержит модификацию мотива последовательности MutT, обнаруженного в некоторых нуклеотидпирофосфатазах. Фермент асимметрично гидролизует Ap4A с образованием AMP и ATP и отвечает за поддержание внутриклеточного уровня динуклеотида. Ap4A, функции которых еще предстоит установить. Этот ген может быть кандидатом в ген-супрессор опухоли. В этом локусе наблюдался альтернативный сплайсинг, и были идентифицированы три варианта транскрипта, все кодирующие один и тот же белок.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000164978 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028443 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Торн Н.М., Хэнкин С., Уилкинсон М.К., Нуньес С., Барраклаф Р., МакЛеннан А.Г. (декабрь 1995 г.). «Человеческий диаденозин 5 ', 5»' - P1, P4-тетрафосфатпирофосфогидролаза является членом семейства нуклеотидпирофосфатаз MutT ». Biochem J. 311 (3): 717–21. Дои:10.1042 / bj3110717. ЧВК  1136061. PMID  7487923.
6. МакЛеннан А.Г., Фланнери А.В., Мортен Дж.Э., Риданпаа М. (апрель 1998 г.). «Хромосомная локализация человеческого гена диаденозина 5 ', 5»' - P1, P4-тетрафосфатпирофосфогидролазы (Ap4A-гидролаза) (APAH1) в 9p13 ». Геномика. 47 (2): 307–9. Дои:10.1006 / geno.1997.5092. PMID  9479504.
7. «Ген Entrez: NUDT2 nudix (фрагмент X, связанный с нуклеозиддифосфатом), мотив 2».

дальнейшее чтение

• Бессман MJ, Фрик DN, О'Хэндли SF (1996). «Белки MutT или гидролазы« Nudix », семейство универсальных, широко распространенных ферментов для« уборки дома »». J. Biol. Chem. 271 (41): 25059–62. Дои:10.1074 / jbc.271.41.25059. PMID  8810257.
• Пинто Р. М., Костас М. Дж., Фернандес А. и др. (1991). «Динуклеозидтетрафосфатаза из клеток крови человека. Очистка и характеристика фермента с высокой специфической активностью, распознаваемого антителом против тетрафосфатазы крысы». FEBS Lett. 287 (1–2): 85–8. Дои:10.1016 / 0014-5793 (91) 80021-Т. PMID  1652465. S2CID  45540631.
• Ханкин С., Мэтью Н., Торн Н., МакЛеннан А.Г. (1995). «Диаденозин 5 ', 5»' - P1, P4-тетрафосфатгидролаза присутствует в эритроцитах, лейкоцитах и ​​тромбоцитах человека ». Int. J. Biochem. Cell Biol. 27 (2): 201–6. Дои:10.1016 / 1357-2725 (94) 00076-Н. PMID  7767787.
• Lazewska D, Starzyńska E, Guranowski A (1993). «Человеческий плацентарный (асимметричный) диаденозин 5 ', 5-P1, P4-тетрафосфатгидролаза: очистка до гомогенности и некоторых свойств ». Protein Expr. Purif. 4 (1): 45–51. Дои:10.1006 / преп.1993.1007. PMID  8381042.
• Ротлан П., Родригес-Феррер С. Р., Асенсио А. С., Оакнин С. (1998). «Сильное ингибирование специфических диаденозин полифосфатгидролаз сурамином». FEBS Lett. 429 (2): 143–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (98) 00579-1. PMID  9650578. S2CID  22827879.
• Вартанян А., Александров И., Прудовский И. и др. (1999). «Ap4A вызывает апоптоз в культивируемых клетках человека». FEBS Lett. 456 (1): 175–80. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00956-4. PMID  10452553. S2CID  24954275.
• Гурановски А., Гальбас М., Хартманн Р., Юстесен Дж. (2000). «Селективное разложение 2'-аденилированных диаденозинтри- и тетрафосфатов, Ap (3) A и Ap (4) A, двумя специфическими динуклеозид полифосфатгидролазами человека». Arch. Biochem. Биофизы. 373 (1): 218–24. Дои:10.1006 / abbi.1999.1556. PMID  10620341.
• Абдельгани Х.М., Гасми Л., Картрайт Дж. Л. и др. (2002). «Клонирование, характеристика и кристаллизация диаденозин 5 ', 5»' - P (1), P (4) -тетрафосфатпирофосфогидролазы из Caenorhabditis elegans ». Биохим. Биофиз. Acta. 1550 (1): 27–36. Дои:10.1016 / S0167-4838 (01) 00263-1. PMID  11738085.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Гурановски А., Силлеро А., Гюнтер Силлеро М.А. (2003). «Селективное расщепление 3'-аденилированных полифосфатов динуклеозидов специфическими ферментами, разрушающими полифосфаты динуклеозидов». Acta Biochim. Pol. 50 (1): 123–30. Дои:10.18388 / abp.2003_3719. PMID  12673352.
• Питчер WH, Кирби Т.В., ДеРоуз Э.Ф., Лондон RE (2003). «Метаболическая трансформация AZTp4A гидролазой Ap4A восстанавливает трифосфат AZT». Противовирусный Res. 58 (3): 227–33. Дои:10.1016 / S0166-3542 (03) 00003-2. PMID  12767470.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Сварбрик Дж. Д., Буйя С., Гунавардана Д. и др. (2005). «Структура и механизм связывания субстрата человеческой гидролазы Ap4A». J. Biol. Chem. 280 (9): 8471–81. Дои:10.1074 / jbc.M412318200. PMID  15596429.
• Сварбрик Дж. Д., Буйя С., Гунавардана Д. и др. (2005). «Резонансные отнесения 1H, 13C и 15N гидролазы Ap4A 17 кДа из Homo sapiens в присутствии и в отсутствие АТФ». J. Biomol. ЯМР. 31 (2): 181–2. Дои:10.1007 / s10858-004-7440-4. PMID  15772762. S2CID  35502399.