NUDT4 - NUDT4

NUDT4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2DUK
Идентификаторы
Псевдонимы	NUDT4, DIPP2, DIPP2alpha, DIPP2beta, HDCMB47P, нудикс гидролаза 4, DIPP-2B, NUDT4B
Внешние идентификаторы	OMIM: 609229 MGI: 1918457 ГомолоГен: 41726 Генные карты: NUDT4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q22 Начинать 93,377,883 бп[1] Конец 93,408,146 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 C2 Начинать 95,547,007 бп[2] Конец 95,564,146 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность инозитолдифосфаттетракисфосфатдифосфатазы • активность инозитол-1-дифосфат-2,3,4,5,6-пентакисфосфатдифосфатазы • инозитол-3,5-бисдифосфат-2,3,4,6-тетракисфосфат-5-дифосфатазная активность • активность инозитол-5-дифосфат-1,2,3,4,6-пентакисфосфатдифосфатазы • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • активность инозитол-3-дифосфат-1,2,4,5,6-пентакисфосфатдифосфатазы • гидролазная активность • активность дифосфоинозит-полифосфатдифосфатазы • инозитол-1,5-бисдифосфат-2,3,4,6-тетракисфосфат-1-дифосфатазная активность • активность инозитол-1,5-бисдифосфат-2,3,4,6-тетракисфосфат-5-дифосфатазы • активность инозитолдифосфата пентакисфосфатдифосфатазы • активность инозитолбисдифосфаттетракисфосфатдифосфатазы • активность эндополифосфатазы • бис (5'-аденозил) -гексафосфатазная активность • активность бис (5'-аденозил) пентафосфатазы • Активность дифосфатазы m7G (5 ') pppN • связывание snoRNA Сотовый компонент • внутриклеточный • ядро клетки • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • процесс метаболизма циклических нуклеотидов • метаболический процесс инозитолфосфата • передача сигналов, опосредованная циклическими нуклеотидами • кальций-опосредованная передача сигналов • дифосфоинозитол полифосфат метаболический процесс • катаболический процесс диаденозинпентафосфата • катаболический процесс диаденозин гексафосфата • аденозин 5 '- (гексагидроген пентафосфат) катаболический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	11163	71207
Ансамбль	ENSG00000173598	ENSMUSG00000020029
UniProt	Q9NZJ9	Q8R2U6
RefSeq (мРНК)	NM_001301022 NM_001301023 NM_001301024 NM_019094 NM_199040	NM_027722 NM_001358996
RefSeq (белок)	NP_001287951 NP_001287952 NP_001287953 NP_061967 NP_950241	NP_081998 NP_001345925
Расположение (UCSC)	Chr 12: 93,38 - 93,41 Мб	Chr 10: 95,55 - 95,56 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Дифосфоинозитол полифосфат фосфогидролаза 2 является фермент что у людей кодируется NUDT4 ген.^[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, регулирует оборот полифосфатов дифосфоинозитола. Оборот этих высокоэнергетических полифосфатов дифосфоинозитола представляет собой молекулярную переключающую активность с важными регуляторными последствиями. Переключение молекул полифосфатами дифосфоинозитола может способствовать регулированию внутриклеточного трафика. Было описано несколько альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, но полноразмерная природа некоторых вариантов не была определена. Изоформы DIPP2alpha и DIPP2beta отличаются друг от друга только тем, что DIPP2beta обладает одной дополнительной аминокислотой из-за смещения границ интрона при альтернативном сплайсинге.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000173598 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000020029 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Caffrey JJ, Safrany ST, Yang X, Shears SB (июнь 2000 г.). «Открытие молекулярного и каталитического разнообразия среди дифосфоинозитол-полифосфатфосфогидролаз человека. Расширяющееся семейство Nudt». J Biol Chem. 275 (17): 12730–6. Дои:10.1074 / jbc.275.17.12730. PMID  10777568.
6. Кэффри Дж. Дж., Ширс С.Б. (май 2001 г.). «Генетическое обоснование микрогетерогенности полифосфатфосфогидролазы дифосфоинозитол человека 2 типа». Ген. 269 (1–2): 53–60. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00446-2. PMID  11376937.
7. «Ген Entrez: NUDT4 nudix (фрагмент X, связанный с нуклеозиддифосфатом), мотив 4».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Секи Н., Охира М., Нагасе Т. и др. (1998). «Характеристика клонов кДНК в библиотеках кДНК, фракционированных по размеру, из человеческого мозга». ДНК Res. 4 (5): 345–9. Дои:10.1093 / днарес / 4.5.345. PMID  9455484.
• Лесли Н.Р., McLennan AG, Safrany ST (2002). «Клонирование и характеристика hAps1 и hAps2, гидролаз Nudix, метаболизирующих диаденозинполифосфат человека». BMC Biochem. 3: 20. Дои:10.1186/1471-2091-3-20. ЧВК  117780. PMID  12121577.
• Фишер Д.И., Сафрани С.Т., Страйк П. и др. (2003). «Гидролазы Nudix, которые расщепляют полифосфаты динуклеозидов и дифосфоинозитола, также обладают активностью 5-фосфорибозил-1-пирофосфат (PRPP) пирофосфатазы, которая генерирует гликолитический активатор рибозо-1,5-бисфосфат». J. Biol. Chem. 277 (49): 47313–7. Дои:10.1074 / jbc.M209795200. PMID  12370170.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Фортна А, Ким Й., Макларен Э. и др. (2006). «Дублирование и утрата генов, специфичных для происхождения, в эволюции человека и человекообразных обезьян». ПЛОС Биол. 2 (7): E207. Дои:10.1371 / journal.pbio.0020207. ЧВК  449870. PMID  15252450.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.