NUDT5 - NUDT5

NUDT5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2DSB, 2DSC, 2DSD, 3AC9, 3ACA, 3БМ4, 3L85
Идентификаторы
Псевдонимы	NUDT5, YSA1, YSA1H, YSAH1, hYSAH1, nudix гидролаза 5, hNUDT5
Внешние идентификаторы	OMIM: 609230 MGI: 1858232 ГомолоГен: 5388 Генные карты: NUDT5
Номер ЕС	3.6.1.58
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10п14 Начинать 12,165,330 бп[1] Конец 12,196,144 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 A1 Начинать 5,845,019 бп[2] Конец 5,871,895 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Активность дифосфатазы m7G (5 ') pppN • гидролазная активность • связывание ионов магния • связывание ионов металлов • нуклеозид-дифосфатазная активность • Связывание РНК • Активность АДФ-сахарной дифосфатазы • связывание snoRNA • Активность 8-оксо-dGDP фосфатазы • GO: 0001948 связывание с белками • трансферазная активность • Активность АДФ-рибозодифосфатазы • активность гомодимеризации белков • нуклеотидилтрансферазная активность Сотовый компонент • цитозоль • внеклеточная экзосома • внутриклеточный • ядро клетки Биологический процесс • низкомолекулярный катаболический процесс, содержащий нуклеооснования • катаболический процесс рибонуклеозиддифосфата • метаболический процесс соединения, содержащего азотистые основания • нуклеотидный метаболический процесс • Катаболический процесс D-рибозы • ремоделирование хроматина • Генерация АТФ из поли-АДФ-D-рибозы • нуклеозид-фосфатный метаболический процесс • метаболический процесс рибозофосфата Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	11164	53893
Ансамбль	ENSG00000165609	ENSMUSG00000025817
UniProt	Q9UKK9	Q9JKX6
RefSeq (мРНК)	NM_014142 NM_001321647 NM_001321648	NM_016918
RefSeq (белок)	NP_001308576 NP_001308577 NP_054861	NP_058614
Расположение (UCSC)	Chr 10: 12.17 - 12,2 Мб	Chr 2: 5,85 - 5,87 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

АДФ-сахарная пирофосфатаза является фермент что у людей кодируется NUDT5 ген.^[5][6]

Гидролазы Nudix, такие как NUDT5, устраняют токсичные нуклеотид производные клетки и регулируют уровни важных сигнальных нуклеотидов и их метаболиты (МакЛеннан, 1999 г.) [предоставлено OMIM]^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000165609 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025817 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. McLennan AG (август 1999 г.). «Семейство мотивов MutT нуклеотид-фосфогидролаз у человека и человеческих патогенов (обзор)». Инт Дж Мол Мед. 4 (1): 79–89. Дои:10.3892 / ijmm.4.1.79. PMID  10373642.
6. «Ген Entrez: мотив 5 типа nudix NUDT5 (фрагмент X, связанный с нуклеозиддифосфатом)».

дальнейшее чтение

• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Исибаши Т, Хаякава Х, Секигучи М (2004). «Новый механизм предотвращения мутаций, вызванных окислением гуаниновых нуклеотидов». EMBO Rep. 4 (5): 479–83. Дои:10.1038 / sj.embor.embor838. ЧВК  1319193. PMID  12717453.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чжан К.Х., Е М., Ву XY и др. (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гемопоэтических стволовых / клетках-предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
• Ян Х., Слупска М.М., Вэй Ю.Ф. и др. (2000). «Клонирование и характеристика нового члена гидролаз Nudix от человека и мыши». J. Biol. Chem. 275 (12): 8844–53. Дои:10.1074 / jbc.275.12.8844. PMID  10722730.
• Гасми Л., Картрайт Дж. Л., МакЛеннан А.Г. (2000). «Клонирование, экспрессия и характеристика YSA1H, человеческой аденозин-5'-дифосфосахарпирофосфатазы, имеющей мотив MutT». Biochem. J. 344 Pt 2 (Pt 2): 331–7. Дои:10.1042/0264-6021:3440331. ЧВК  1220648. PMID  10567213.