NeuroNames - NeuroNames

NeuroNames
BrainInfo Снимок экрана 2014-02-01.png
Содержание
ОписаниеИсчерпывающая иерархическая номенклатура структур мозга приматов (человек и макака)
Типы данных
захвачен
Нейроанатомия
Доступ
Интернет сайтhttp://braininfo.rprc.washington.edu/
Разное
ЛицензияCC-BY icon.svg
Лицензия Creative Commons Attribution 3.0 без переноса

NeuroNames представляет собой комплексную номенклатуру конструкций в мозг и спинной мозг из четырех видов, наиболее изученных нейробиологами: человек, макака, крыса и мышь. Он предлагает стандартный, контролируемый словарный запас общепринятых названий конструкций, что подходит для однозначных нейроанатомический индексация информации в электронных базах данных. Термины из стандартного словаря были выбраны из-за простоты произношения, мнемонической ценности и частоты использования в последних нейробиологических публикациях. Структуры и их отношения друг к другу определяются в терминах стандартного словаря. В настоящее время NeuroNames содержит стандартные названия, синонимы и определения около 2500 нейроанатомических образований.

Номенклатура поддерживается Вашингтонский университет и является основным компонентом инструмента BrainInfo. BrainInfo помогает идентифицировать структуры в мозге. Можно выполнить поиск по названию структуры или найти структуру в атлас мозга и получить такую ​​информацию, как его расположение в классической иерархии мозга, изображения структуры, какие клетки у него есть, его связи и экспрессируемые там гены. К информации можно получить доступ по любому из примерно 16 000 синонимов на восьми языках.

NeuroNames - это исходный словарь метатезавров Единая система медицинского языка. Он подробно описан в следующих трех научные статьи:

  • Д. М. Боуден и Р. Ф. Мартин (март 1995 г.). «Иерархия мозга NeuroNames». NeuroImage. 2 (1): 63–83. Дои:10.1006 / nimg.1995.1009. PMID  9410576. S2CID  24847350.
  • Д. М. Боуден и М. Ф. Дубач (2003). «NeuroNames 2002». Нейроинформатика. 1 (1): 43–59. Дои:10.1385 / NI: 1: 1: 043. PMID  15055392. S2CID  12575028.
  • Д. М. Боуден; Е. Песня; Ж. Кошелева; М. Ф. Дубач (2011). «NeuroNames: онтология для портала BrainInfo по нейробиологии в Интернете». Нейроинформатика. 10 (1): 97–114. Дои:10.1007 / s12021-011-9128-8. ЧВК  3247656. PMID  21789500.

Смотрите также

внешняя ссылка