Семья NhaC - NhaC family

В Семья NhaC (ТК № 2.А.35 ) принадлежит Ion Transporter (IT) Суперсемейство.^[1] Репрезентативный список белков, принадлежащих к семейству NhaC, можно найти в База данных классификации транспортеров.

Функционально охарактеризованы два члена семейства NhaC. Один считается Na⁺:ЧАС⁺ антипортер;^[2] другой - малат · H⁺: лактат · Na⁺ антипортер.^[3] Несколько паралогов можно найти в Холерный вибрион, и два паралога закодированы в полностью секвенированных геномах обоихHaemophilus influenzae и Bacillus subtilis. Кишечная палочка нет такого гомолога. Пирококк у каждого вида также есть по крайней мере по одному гомологу. Таким образом, члены семейства NhaC встречаются как в Грамотрицательные бактерии и Грамположительные бактерии а также архей. NhaC Б. фирма имеет длину 462 аминоацильных остатка и содержит 12 предполагаемых трансмембранных α-спиральных сегментов. Млен из Б. subtilis (468 аас; ТК № 2.A.35.1.2 ) также демонстрирует 12 предполагаемых ТМС.

Транспортная реакция, катализируемая NhaC, вероятно:

Na + (вход) + nH + (выход) ⇌ Na + (выход) + nH + (вход). (п> 1)

Это, вероятно, вызвано MleN:

Малат (уходит) + H⁺ (выход) + лактат (вход) + Na⁺ (дюйм) ⇌ Малат (дюйм) + H⁺ (вход) + лактат (выход) + Na⁺ (из)

Смотрите также

• Натрий-протонный антипортер
• Антипортер
• База данных классификации транспортеров

дальнейшее чтение

• Айви, Д. М .; Guffanti, A. A .; Bossewitch, J. S .; Padan, E .; Крулвич, Т.А. (1991-12-05). «Молекулярное клонирование и секвенирование гена из алкалифильной Bacillus firmus OF4, который функционально дополняет штамм Escherichia coli, несущий делецию в гене nhaA Na + / H + -антипортера». Журнал биологической химии 266 (34): 23483–23489. ISSN  0021-9258. PMID  1660475.
• Лью, Чонг Вай; Illias, Rosli Md; Махади, Нор Мухаммад; Наджимудин, Назалан (01.11.2007).«Экспрессия гена антипортера Na + / H + (g1-nhaC) алкалифильных Bacillus sp. G1 в Escherichia coli». Письма о микробиологии FEMS 276 (1): 114–122. Дои:10.1111 / j.1574-6968.2007.00925.x. ISSN  0378-1097. PMID  17937670.
• Панина, Екатерина М .; Витрещак, Алексей Г .; Миронов Андрей А .; Гельфанд, Михаил Сергеевич (28 мая 2003 г.).«Регулирование биосинтеза и транспорта ароматических аминокислот в грамположительных бактериях с низким ГХ». Письма о микробиологии FEMS 222 (2): 211–220. ISSN  0378-1097.PMID  12770710.
• Равчеев Дмитрий А .; Бест, Аарон А .; Тинтл, Натан; Деджонг, Мэтью; Остерман, Андрей Л .; Новичков, Павел С .; Родионов, Дмитрий А. (01.07.2011).«Вывод о сети регуляции транскрипции у Staphylococcus aureus путем интеграции экспериментальных и основанных на геномике данных». Журнал бактериологии 193(13): 3228–3240. Дои:10.1128 / JB.00350-11. ISSN  1098-5530. ЧВК  3133287. PMID  21531804.
• Родионов, Дмитрий А .; Hebbeln, Питер; Эдес, Эймерик; тер Бик, Джози; Родионова Ирина А .; Erkens, Guus B .; Слотбум, Дирк Дж .; Гельфанд, Михаил С .; Остерман, Андрей Леонидович (01.01.2009). «Новый класс модульных транспортеров витаминов в прокариотах». Журнал бактериологии 191 (1): 42–51. Дои:10.1128 / JB.01208-08.ISSN  1098-5530. ЧВК  2612444. PMID  18931129.

Рекомендации

1. Пракаш, Шраддха; Купер, Гаррет; Сингхи, Сумья; Сайер, Милтон Х. (2003-12-03). «Суперсемейство ионных переносчиков». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биомембраны. 1618 (1): 79–92. Дои:10.1016 / j.bbamem.2003.10.010. ISSN  0006-3002. PMID  14643936.
2. Ито, М .; Guffanti, A. A .; Земский, Дж .; Айви, Д. М .; Крулвич, Т.А. (1 июня 1997 г.). «Роль nhaC-кодируемого Na + / H + -антипортера алкалифильной Bacillus firmus OF4». Журнал бактериологии. 179 (12): 3851–3857. Дои:10.1128 / jb.179.12.3851-3857.1997. ISSN  0021-9193. ЧВК  179192. PMID  9190799.
3. Wei, Y .; Guffanti, A. A .; Ито, М .; Крулвич, Т. А. (29 сентября 2000 г.). «Bacillus subtilis YqkI - новый антипортер яблочной кислоты / Na + -лактата, который усиливает рост малата при низкой протонодвижущей силе». Журнал биологической химии. 275 (39): 30287–30292. Дои:10.1074 / jbc.M001112200. ISSN  0021-9258. PMID  10903309.

По состоянию на это редактирование, в этой статье используется контент из "2.A.35 Семейство NhaC Na +: H + Antiporter (NhaC)", который лицензирован таким образом, чтобы разрешить повторное использование в соответствии с Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Непортированная лицензия, но не под GFDL. Все соответствующие условия должны быть соблюдены.