Нитратираптор - Nitratiruptor

Нитратираптор
Научная классификация
Королевство:
Бактерии
Тип:
Протеобактерии
Учебный класс:
Эпсилонпротеобактерии
Заказ:
Эпсилонпротеобактерии[1]
Семья:
неклассифицированные Epsilonproteobacteria[1]
Род:
Нитратираптор[1]

Накагава и др. 2005 г.[2]
Типовой вид
Nitratiruptor tergarcus[2]
Разновидность

N. tergarcus[2]

Нитратираптор sp. (штамм SB155-2) - род глубоководных грамотрицательный ε-протеобактерии изолирован из Северного гидротермального поля Ихея в Окинавском прогибе (Япония).[3] Этот палочковидный микроорганизм (0,5 х 1,5 мкм) растет хемолитоавтотрофно в широком спектре доноров и акцепторов электронов (например, серы, водорода, кислорода и нитратов) в отсутствие света и кислорода. Это также термофильная группа, способная расти в диапазоне 37–65 ° C с оптимальным значением 55 ° C.

Генетические особенности

DAPI окрашенный Нитратираптор клетки (SB155-2), выращиваемые в лабораторных условиях

Нитратираптор sp. Геном состоит из одной кольцевой хромосомы из 1877931 п.н. с содержанием GC 43,8% и 39,7%.[4] Из-за геохимической изменчивости глубоководных гидротермальных источников, Нитратираптор sp. демонстрирует метаболическую гибкость, позволяющую адаптироваться к этой враждебной среде, которая включает резкие градиенты в источниках энергии, акцепторах электронов или источниках углерода. Например, из-за богатых металлами жидкостей, характеризующих эти области, в общей сложности было описано 17 генов, связанных с системами транспорта и механизмами детоксикации тяжелых металлов (включая As, Cd и Cu). Несмотря на то, что это не патогенная бактерия, она обладает некоторыми генами вирулентности (включая фактор вирулентности mviN, гемолизин или кластер генов N-сцепленного гликозилирования), которые позволяют понять происхождение вирулентности у их патогенных родственников. Helicobacter и Campylobacter разновидность.[5]

Рекомендации

  1. ^ а б c "Nitratiruptor tergarcus". www.uniprot.org.
  2. ^ а б c «Нитратираптор». LPSN.
  3. ^ Накагава, Сатоши; Такай, Кен; Инагаки, Фумио; Хорикоши, Коки; Сако, Йошихико (2005). «Nitratiruptor tergarcus gen. Nov., Sp. Nov. И Nitratifractor salsuginis gen. Nov., Sp. Nov., Восстанавливающие нитрат хемолитоавтотрофы ε-протеобактерий, выделенные из глубоководной гидротермальной системы в Средне-Окинавском прогибе». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 55 (2): 925–933. Дои:10.1099 / ijs.0.63480-0. PMID  15774687.
  4. ^ "ПАТРИК". www.patricbrc.org. Получено 2019-06-07.
  5. ^ Хорикоши, Коки; Такай, Кен; Рейзенбах, Анна-Луиза; Шимамура, Сигеру; Такаки, ​​Ёсихиро; Накагава, Сатоши (17 июля 2007 г.). «Глубоководные источники ε-протеобактерий дают представление о возникновении патогенов». Труды Национальной академии наук. 104 (29): 12146–12150. Дои:10.1073 / pnas.0700687104. ISSN  0027-8424. ЧВК  1907315. PMID  17615243.