ODF1 - ODF1 - Wikipedia

ODF1
Идентификаторы
Псевдонимы	ODF1, CT133, HSPB10, ODF, ODF2, ODF27, ODFP, ODFPG, ODFPGA, ODFPGB, RT7, SODF, внешнее плотное волокно хвостов сперматозоидов 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 182878 MGI: 97424 ГомолоГен: 7456 Генные карты: ODF1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8q22.3 Начинать 102,551,589 бп[1] Конец 102,561,018 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 B3.1 | 15 15,14 см Начинать 38,219,203 бп[2] Конец 38,226,735 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • специфическое связывание белкового домена Сотовый компонент • ядро клетки • внешнее плотное волокно Биологический процесс • развитие многоклеточного организма • дифференциация клеток • сперматогенез Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4956	18285
Ансамбль	ENSG00000155087	ENSMUSG00000061923
UniProt	Q14990	Q61999
RefSeq (мРНК)	NM_024410	NM_008757
RefSeq (белок)	NP_077721	NP_032783
Расположение (UCSC)	Chr 8: 102,55 - 102,56 Мб	Chr 15: 38.22 - 38.23 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок внешней плотной клетчатки 1 это белок что у людей кодируется ODF1 ген.^[5][6]

Наружные плотные волокна цитоскелет структуры, которые окружают аксонема в средней части и основной части сперма хвост. Волокна функционируют в поддержании эластичной структуры и отдачи сперма хвоста, а также для защиты хвоста от поперечных сил во время эпидидимального транспорта и эякуляция. Дефекты внешних плотных волокон приводят к аномальной морфологии сперматозоидов и бесплодие. Внешние плотные волокна человека содержат не менее 10 основных белков, и этот ген кодирует основной белок.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000155087 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061923 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Гастманн О., Бурфейнд П., Гюнтер Э, Хамейстер Х., Шпирер С., Хойер-Фендер С. (март 1994 г.). «Последовательность, экспрессия и хромосомная принадлежность гена внешнего плотного волокна спермы человека». Мол Репрод Дев. 36 (4): 407–418. Дои:10.1002 / мрд.1080360402. PMID  8305202. S2CID  2447785.
6. "Entrez Gene: ODF1 внешнее плотное волокно хвостов сперматозоидов 1".

дальнейшее чтение

• Кирзенбаум А.Л. (2002). «Кератины: раскрытие скоординированной конструкции каркасов в сперматогенных клетках». Мол. Репрод. Dev. 61 (1): 1–2. Дои:10.1002 / мрд.1124. PMID  11774369. S2CID  28475473.
• Хенкель Р., Стальф Т., Миска В. (1992). «Выделение и частичная характеристика белков внешней плотной клетчатки из сперматозоидов человека». Биол. Chem. Hoppe-Seyler. 373 (8): 685–9. Дои:10.1515 / bchm3.1992.373.2.685. PMID  1418683.
• Хофферберт С., Бурфейнд П., Хойер-Фендер С. и др. (1994). «Гомозиготная делеция 27 пар оснований в кодирующей области гена белка внешней плотной клетчатки человека не приводит к патологическому фенотипу». Гм. Мол. Genet. 2 (12): 2167–2170. Дои:10.1093 / hmg / 2.12.2167. PMID  8111388.
• Burmester S, Hoyer-Fender S (1997). «Транскрипция и трансляция гена внешнего плотного волокна (Odf1) во время спермиогенеза у крысы. Исследование с помощью анализа in situ и фракционирования полисом». Мол. Репрод. Dev. 45 (1): 10–20. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-2795 (199609) 45: 1 <10 :: AID-MRD2> 3.0.CO; 2-V. PMID  8873064.
• Шао X, ван дер Хорн Ф.А. (1997). «Самовзаимодействие основного белка внешней плотной клетчатки 27 килодальтон частично опосредуется доменом лейциновой молнии у крысы». Биол. Репрод. 55 (6): 1343–1350. Дои:10.1095 / биолрепрод55.6.1343. PMID  8949892.
• Shao X, Tarnasky HA, Schalles U, et al. (1997). «Взаимодействующее клонирование главного белка внешней плотной клетчатки Odf84 массой 84 кДа. Лейциновые молнии опосредуют ассоциации Odf84 и Odf27». J. Biol. Chem. 272 (10): 6105–6113. Дои:10.1074 / jbc.272.10.6105. PMID  9045620.
• Shao X, Tarnasky HA, Lee JP и др. (1999). «Spag4, новый белок сперматозоидов, связывает белок внешней плотной клетчатки Odf1 и локализуется в микротрубочках манжеты и аксонемы». Dev. Биол. 211 (1): 109–123. Дои:10.1006 / dbio.1999.9297. PMID  10373309.
• Петерсен С., Фюзези Л., Хойер-Фендер С. (1999). «Белки внешней плотной клетчатки из хвоста сперматозоидов человека: молекулярное клонирование и анализ экспрессии двух транскриптов кДНК, кодирующих белки примерно 70 кДа». Мол. Гм. Репрод. 5 (7): 627–635. Дои:10,1093 / моль · ч / 5.7.627. PMID  10381817.
• Шао X, Сюэ Дж, ван дер Хорн Ф.А. (2001). «Яичковый белок Spag5 имеет сходство с белком митотического веретена Deepest и связывает белок внешней плотной клетчатки Odf1». Мол. Репрод. Dev. 59 (4): 410–416. Дои:10.1002 / мрд.1047. PMID  11468777. S2CID  13590694.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–16903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Зарский HA, Tarnasky HA, Cheng M, van der Hoorn FA (2003). «Новый белок пальца кольца OIP1 связывается с консервативными аминокислотными повторами в белке кончика сперматозоида ODF1». Биол. Репрод. 68 (2): 543–552. Дои:10.1095 / биолрепрод.102.009076. ЧВК  3158802. PMID  12533418.
• Бхуллар Б., Чжан И, Юнко А. и др. (2003). «Ассоциация легкой цепи кинезина с внешними плотными волокнами независимым от микротрубочек образом». J. Biol. Chem. 278 (18): 16159–16168. Дои:10.1074 / jbc.M213126200. ЧВК  3178653. PMID  12594206.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.