OPCML - OPCML

OPCML
Идентификаторы
Псевдонимы	OPCML, IGLON1, OBCAM, OPCM, опиоидсвязывающий белок / молекула клеточной адгезии, подобная молекуле опиоидсвязывающего белка / клеточной адгезии
Внешние идентификаторы	OMIM: 600632 MGI: 97397 ГомолоГен: 55663 Генные карты: OPCML
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q25 Начинать 132,414,977 бп[1] Конец 133,532,519 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 A4 | 9 13,73 см Начинать 27,790,775 бп[2] Конец 28,925,410 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • закрепленный компонент мембраны • клеточная мембрана • мембрана • внеклеточная область Биологический процесс • распознавание нейронов • клеточная адгезия Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4978	330908
Ансамбль	ENSG00000183715	ENSMUSG00000062257
UniProt	Q14982	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001012393 NM_002545 NM_001319103 NM_001319104 NM_001319105 NM_001319106	NM_177906
RefSeq (белок)	NP_001012393 NP_001306032 NP_001306033 NP_001306034 NP_001306035 NP_002536 NP_002536.1	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 11: 132,41 - 133,53 Мб	Chr 9: 27.79 - 28.93 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Опиоид-связывающий белок / молекула клеточной адгезии это белок что у людей кодируется OPCML ген.^[5][6]

Этот ген кодирует члена подсемейства IgLON в иммуноглобулин белковое суперсемейство. Кодируемый белок локализован в клеточная мембрана и может играть вспомогательную роль в опиоид рецепторная функция. Этот ген имеет ортолог у крыс и крупного рогатого скота. Молекула связывания опиоидов-клеточной адгезии, кодируемая геном крысы, связывает опиоид алкалоиды в присутствии кислого липиды, проявляет селективность в отношении мю-лигандов и действует как GPI-заякоренный белок. Поскольку кодируемый белок является высококонсервативным у видов во время эволюции, он может играть фундаментальную роль в млекопитающее системы. Два варианта транскрипции, кодирующие разные изоформы были обнаружены для этого гена.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000183715 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000062257 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Смит М.В., Кларк С.П., Хатчинсон Д.С., Вей Ю.Х., Чурукян А.С., Дэниэлс Л. (Декабрь 1993 г.). «Карта сайта хромосомы человека с меткой последовательностей 11». Геномика. 17 (3): 699–725. Дои:10.1006 / geno.1993.1392. PMID  8244387.
6. «Ген Entrez: опиоид-связывающий белок OPCML / молекула клеточной адгезии».

дальнейшее чтение

• Lane CM, Elde R, Loh HH, Ли Н.М. (1993). «Регуляция опиоид-связывающего белка в клетках NG108-15 параллельна регуляции дельта-опиоидных рецепторов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 89 (23): 11234–8. Дои:10.1073 / пнас.89.23.11234. ЧВК  50524. PMID  1333602.
• Акула КБ, Ли Н.М. (1995). «Клонирование, секвенирование и локализация в хромосоме 11 кДНК, кодирующей человеческую молекулу адгезии опиоид-связывающих клеток (OBCAM)». Ген. 155 (2): 213–7. Дои:10.1016 / 0378-1119 (94) 00830-Л. PMID  7721093.
• Struyk AF, Canoll PD, Wolfgang MJ, et al. (1995). «Клонирование нейротримина определяет новое подсемейство дифференциально экспрессируемых молекул адгезии нервных клеток». J. Neurosci. 15 (3, часть 2): 2141–56. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.15-03-02141.1995. ЧВК  6578143. PMID  7891157.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Sellar GC, Watt KP, Rabiasz GJ, et al. (2003). «OPCML в 11q25 эпигенетически инактивирован и обладает функцией подавления опухолей при эпителиальном раке яичников». Nat. Genet. 34 (3): 337–43. Дои:10.1038 / ng1183. PMID  12819783. S2CID  24411276.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Шмитт-Ульмс Г., Хансен К., Лю Дж. И др. (2005). «Регулируемая по времени транскардиальная перфузия кросслинкинга для изучения белковых взаимодействий в сложных тканях». Nat. Биотехнология. 22 (6): 724–31. Дои:10.1038 / nbt969. PMID  15146195. S2CID  36630738.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Мэй ФК, Молодой Т.В., Лю Дж., Ченг X (2006). «Опосредованная RAS эпигенетическая инактивация OPCML в онкогенной трансформации поверхностных эпителиальных клеток яичников человека». FASEB J. 20 (3): 497–9. Дои:10.1096 / fj.05-4586fje. PMID  16384911. S2CID  24792515.
• Ван Л., Чжу Дж. С., Сонг MQ и др. (2007). «Сравнение профилей экспрессии генов между первичной опухолью и метастатическими поражениями у пациентов с раком желудка с использованием лазерной микродиссекции и микроматрицы кДНК». Мир J. Гастроэнтерол. 12 (43): 6949–54. Дои:10.3748 / wjg.v12.i43.6949. ЧВК  4087337. PMID  17109515.
• Czekierdowski A, Czekierdowska S, Szymanski M, et al. (2007). «Опиоид-связывающий белок / подобный молекуле клеточной адгезии (OPCML) ген и статус метилирования промотора у женщин с раком яичников». Neuro Endocrinol. Латыш. 27 (5): 609–13. PMID  17159813.
• Рид Дж. Э., Данн Дж. Р., Дю Плесси Д. Г. и др. (2007). «Экспрессия молекулы клеточной адгезии 'OPCML' подавляется в глиомах и других опухолях головного мозга». Neuropathol. Appl. Нейробиол. 33 (1): 77–85. Дои:10.1111 / j.1365-2990.2006.00786.x. PMID  17239010. S2CID  22479211.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q14982 (Опиоид-связывающий белок / молекула клеточной адгезии) на PDBe-KB.