OSTF1 - OSTF1

OSTF1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1X2K, 1ZLM, 3EHQ, 3EHR
Идентификаторы
Псевдонимы	OSTF1, OSF, SH3P2, bA235O14.1, фактор стимуляции остеокластов 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 610180 MGI: 700012 ГомолоГен: 8227 Генные карты: OSTF1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q21.13 Начните 75,088,514 бп[1] Конец 75,147,265 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 B | 19 13,17 см Начните 18,516,137 бп[2] Конец 18,631,823 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Привязка домена SH3 • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • внутриклеточный • просвет секреторной гранулы • Просвет гранул, богатых фиколином-1 • внеклеточная область Биологический процесс • окостенение • преобразование сигнала • дегрануляция нейтрофилов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	26578	20409
Ансамбль	ENSG00000134996	ENSMUSG00000024725
UniProt	Q92882	Q62422
RefSeq (мРНК)	NM_012383	NM_017375
RefSeq (белок)	NP_036515	NP_059071
Расположение (UCSC)	Chr 9: 75.09 - 75.15 Мб	Chr 19: 18.52 - 18.63 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Остеокласт -стимулирующий фактор 1 это белок что в люди кодируется OSTF1 ген.^[5][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000134996 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024725 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Редди С., Девлин Р., Менаа К., Нишимура Р., Чой С.Дж., Даллас М., Йонеда Т., Рудман Г.Д. (апрель 1999 г.). «Выделение и характеристика клона кДНК, кодирующего новый пептид (OSF), который усиливает образование остеокластов и резорбцию кости». J Cell Physiol. 177 (4): 636–45. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4652 (199812) 177: 4 <636 :: AID-JCP14> 3.0.CO; 2-H. PMID  10092216.
6. «Ген Entrez: фактор, стимулирующий остеокласты 1 OSTF1».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Спаркс А.Б., Хоффман Н.Г., МакКоннелл С.Дж. и др. (1998). «Клонирование лигандных мишеней: систематическое выделение белков, содержащих домен SH3». Nat. Биотехнология. 14 (6): 741–4. Дои:10.1038 / nbt0696-741. PMID  9630982. S2CID  11166026.
• Шауб Р., Дюпон Б., Рудман Г. Д. и др. (2000). «Отнесение OSTF1 к полосам хромосомы человека 12q24.1 → q24.2 путем гибридизации in situ». Cytogenet. Cell Genet. 88 (1–2): 87–8. Дои:10.1159/000015492. PMID  10773673. S2CID  41580372.
• Курихара Н., Менаа С., Маеда Х. и др. (2001). «Фактор, стимулирующий остеокласты, взаимодействует с продуктом гена спинальной мышечной атрофии, чтобы стимулировать образование остеокластов». J. Biol. Chem. 276 (44): 41035–9. Дои:10.1074 / jbc.M100233200. PMID  11551898.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Szymkiewicz I, Destaing O, Jurdic P, Dikic I (2004). «SH3P2 в комплексе с Cbl и Src». FEBS Lett. 565 (1–3): 33–8. Дои:10.1016 / j.febslet.2004.03.100. PMID  15135048. S2CID  22127534.
• Хамфрей С.Дж., Оливер К., Хант А.Р. и др. (2004). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 9 человека». Природа. 429 (6990): 369–74. Дои:10.1038 / природа02465. ЧВК  2734081. PMID  15164053.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Ли М., Мэн З., Сюй И и др. (2006). «Кристаллизация и предварительный рентгеновский кристаллографический анализ остеокласт-стимулирующего фактора». Acta Crystallographica Раздел F. 61 (Pt 1): 128–30. Дои:10.1107 / S1744309104031653. ЧВК  1952375. PMID  16508112.
• Чен Л., Ван И, Уэллс Д. и др. (2006). «Структура SH3-домена человеческого фактора, стимулирующего остеокласты, при атомном разрешении». Acta Crystallographica Раздел F. 62 (Пт 9): 844–8. Дои:10.1107 / S1744309106030004. ЧВК  2242886. PMID  16946461.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.