PARD3 - PARD3

PARD3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2КОМ
Идентификаторы
Псевдонимы	PARD3, ASIP, Baz, PAR3, PAR3alpha, PARD-3, PARD3A, PPP1R118, SE2-5L16, SE2-5LT1, SE2-5T2, регулятор полярности клеток семейства par-3
Внешние идентификаторы	OMIM: 606745 MGI: 2135608 ГомолоГен: 10489 Генные карты: PARD3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10п11.22-п11.21 Начинать 34,109,560 бп[1] Конец 34,815,325 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 E2 | 8 74,66 см Начинать 127,063,893 бп[2] Конец 127,612,286 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание фосфатидилинозитол-3-фосфата • GO: 0001948 связывание с белками • связывание фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфата • связывание протеинфосфатазы • связывание фосфатидилинозитол-3,4,5-трифосфата • связывание липидов • идентичное связывание с белками • связывание фосфатидилинозита Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • мембрана • межклеточное соединение • двухклеточное плотное соединение • клеточная мембрана • конус роста аксонов • междоузлия аксона • соединение клеток • тело нейрональной клетки • клеточная кора • цитоскелет • эндомембранная система • стык • макромолекулярный комплекс • апикальная плазматическая мембрана • комплекс апикального соединения Биологический процесс • установление полярности эпителиальных клеток • дифференциация клеток • аксоногенез • нацеливание белка на мембрану • отрицательная регуляция фосфорилирования пептидил-треонина • миелинизация периферической нервной системы • деление клеток • установление или поддержание полярности клеток • положительное регулирование миелинизации • регуляция клеточной локализации • сигнальный путь рецептора, активирующего протеинкиназу С, сопряженного с G-белком • асимметричное деление клеток • сборка двухклеточного плотного спая • клеточный цикл • трансформирующий сигнальный путь бета-рецептора фактора роста • сборка макромолекулярного комплекса • организация цитоскелета микротрубочек • клеточная адгезия • локализация белка • установление полярности клеток • установление или поддержание апикальной / базальной полярности эпителиальных клеток • установление локализации центросомы Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	56288	93742
Ансамбль	ENSG00000148498	ENSMUSG00000025812
UniProt	Q8TEW0	Q99NH2
RefSeq (мРНК)	NM_001184785 NM_001184786 NM_001184787 NM_001184788 NM_001184789 NM_001184790 NM_001184791 NM_001184792 NM_001184793 NM_001184794 NM_019619	NM_001013580 NM_001013581 NM_001122850 NM_033620 NM_001309391 NM_001309392 NM_001363431 NM_001363432
RefSeq (белок)	NP_001171714 NP_001171715 NP_001171716 NP_001171717 NP_001171718 NP_001171719 NP_001171720 NP_001171721 NP_001171722 NP_001171723 NP_062565	NP_001013598 NP_001013599 NP_001116322 NP_001296320 NP_001296321 NP_296369 NP_001350360 NP_001350361
Расположение (UCSC)	Chr 10: 34,11 - 34,82 Мб	Chr 8: 127.06 - 127.61 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Разделение дефектных 3 гомологов это белок что у людей кодируется PARD3 ген.^[5][6]

Функция

Белки PARD, которые были впервые идентифицированы у C. elegans, необходимы для асимметричного деления клеток и поляризованного роста, тогда как CDC42 (MIM 116952) опосредует установление полярности клеток. ГТФаза CDC42, которая контролируется факторами обмена нуклеотидов (GEF; см. MIM 606057) и белками, активирующими ГТФазу (GAP; см. MIM 604980), взаимодействует с большим набором эффекторных белков, которые обычно содержат CDC42 / RAC (MIM 602048). - домен интерактивного связывания (CRIB). [поставляется OMIM]^[6]

Взаимодействия

PARD3 был показан взаимодействовать с:

• JAM2,^[7]
• JAM3,^[7]
• PRKCI,^[8] и
• PVRL3.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000148498 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025812 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Джоберти Г., Петерсен С., Гао Л., Макара И.Г. (октябрь 2000 г.). «Белок клеточной полярности Par6 связывает Par3 и атипичную протеинкиназу C с Cdc42». Nat Cell Biol. 2 (8): 531–9. Дои:10.1038/35019573. PMID  10934474. S2CID  27139234.
6. «Entrez Gene: PARD3 par-3, разделяющий дефектный 3 гомолог (C. elegans)».
7. Эбнет К., Орранд-Лайонс М., Кун А., Кифер Ф., Бутц С., Зандер К., Мейер цу Брикведде М.К., Сузуки А., Имхоф Б.А., Вествебер Д. (октябрь 2003 г.). «Члены семейства JAM-2 и JAM-3 соединительной молекулы адгезии (JAM) связываются с белком клеточной полярности PAR-3: возможная роль JAM в полярности эндотелиальных клеток». J. Cell Sci. 116 (Pt 19): 3879–91. Дои:10.1242 / jcs.00704. PMID  12953056.
8. Кодзима М., Нода Й, Такея Р., Сайто Н., Такеучи К., Сумимото Х. (декабрь 2002 г.). «PAR3beta, новый гомолог белка клеточной полярности PAR3, локализуется в плотных контактах». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 299 (4): 641–6. Дои:10.1016 / s0006-291x (02) 02698-0. PMID  12459187.
9. Такэкуни К., Икеда В., Фудзито Т., Моримото К., Такеучи М., Монден М., Такай Ю. (февраль 2003 г.). «Прямое связывание белка клеточной полярности PAR-3 с нектином молекулы межклеточной адгезии в нейроэпителиальных клетках развивающейся мыши». J. Biol. Chem. 278 (8): 5497–500. Дои:10.1074 / jbc.C200707200. PMID  12515806.

дальнейшее чтение

• Йоханссон А., Дриссенс М., Аспенстрём П. (2000). «Гомолог белка полярности Caenorhabditis elegans PAR-6 у млекопитающих является партнером по связыванию для Rho GTPases Cdc42 и Rac1». J. Cell Sci. 113 (18): 3267–75. PMID  10954424.
• Eichmuller S, Usener D, Dummer R, Stein A, Thiel D, Schadendorf D (2001). «Серологическое обнаружение антигенов, связанных с кожной Т-клеточной лимфомой». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (2): 629–34. Дои:10.1073 / pnas.021386498. ЧВК  14639. PMID  11149944.
• Судзуки А., Яманака Т., Хиросе Т., Манабэ Н., Мидзуно К., Симидзу М., Акимото К., Изуми Ю., Ониси Т., Оно С. (2001). «Атипичная протеинкиназа С участвует в эволюционно законсервированном белковом комплексе par и играет важную роль в создании эпителиальных структур соединения».. J. Cell Biol. 152 (6): 1183–96. Дои:10.1083 / jcb.152.6.1183. ЧВК  2199212. PMID  11257119.
• Нода Й, Такея Р., Оно С., Наито С., Ито Т., Сумимото Х (2001). «Человеческие гомологи белка PAR6 клеточной полярности Caenorhabditis elegans в качестве адаптера, который связывает малые GTPases Rac и Cdc42 с атипичной протеинкиназой C.». Гены Клетки. 6 (2): 107–19. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2001.00404.x. PMID  11260256. S2CID  8789941.
• Эбнет К., Сузуки А., Хорикоши Ю., Хиросе Т., Мейер Зу Брикведде М.К., Оно С., Вествебер Д. (2001). «Белок клеточной полярности ASIP / PAR-3 напрямую связан с соединительной молекулой адгезии (JAM)». EMBO J. 20 (14): 3738–48. Дои:10.1093 / emboj / 20.14.3738. ЧВК  125258. PMID  11447115.
• Фанг CM, Сюй YH (2002). «Пониженная экспрессия изоформ asip с удаленным PKC-связывающим доменом в гепатоцеллюлярных карциномах человека». Cell Res. 11 (3): 223–9. Дои:10.1038 / sj.cr.7290090. PMID  11642408.
• Гао Л., Макара И.Г., Джоберти Г. (2003). «Множественные варианты сплайсинга Par3 и нового родственного гена Par3L производят белки с разными связывающими свойствами». Ген. 294 (1–2): 99–107. Дои:10.1016 / S0378-1119 (02) 00681-9. PMID  12234671.
• Кодзима М., Нода Й, Такея Р., Сайто Н., Такеучи К., Сумимото Х (2003). «PAR3beta, новый гомолог белка клеточной полярности PAR3, локализуется в плотных контактах». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 299 (4): 641–6. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02698-0. PMID  12459187.
• Такэкуни К., Икеда В., Фудзито Т., Моримото К., Такеучи М., Монден М., Такай Ю. (2003). «Прямое связывание белка клеточной полярности PAR-3 с нектином молекулы межклеточной адгезии в нейроэпителиальных клетках развивающейся мыши». J. Biol. Chem. 278 (8): 5497–500. Дои:10.1074 / jbc.C200707200. PMID  12515806.
• Уорнер Д. Р., Пизано М. М., Робертс Е. А., Грин Р. М. (2003). «Идентификация трех новых связывающих Smad белков, участвующих в клеточной полярности». FEBS Lett. 539 (1–3): 167–73. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 00155-8. PMID  12650946.
• Браженович М., Джоберти Г., Кюстер Б., Бауместер Т., Дрюс Г. (2004). «Всесторонний протеомный анализ человеческих белковых комплексов Par показывает взаимосвязанную белковую сеть». J. Biol. Chem. 279 (13): 12804–11. Дои:10.1074 / jbc.M312171200. PMID  14676191.
• Наварро-Лерида I, Мартинес Морено М., Ронкал Ф., Гавиланес Ф., Альбар Дж. П., Родригес-Креспо I (2004). «Протеомная идентификация белков мозга, которые взаимодействуют с легкой цепью динеина LC8». Протеомика. 4 (2): 339–46. Дои:10.1002 / pmic.200300528. PMID  14760703. S2CID  8868600.
• Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (2004). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из Т-клеток человека с использованием аффинной хроматографии с иммобилизованным металлом и тандемной масс-спектрометрии». Анальный. Chem. 76 (10): 2763–72. Дои:10.1021 / ac035352d. PMID  15144186.
• Лю XF, Исида Х, Разиуддин Р., Мики Т (2004). «Фактор обмена нуклеотидов ECT2 взаимодействует с белковым комплексом полярности Par6 / Par3 / протеинкиназой Czeta (PKCzeta) и регулирует активность PKCzeta». Мол. Клетка. Биол. 24 (15): 6665–75. Дои:10.1128 / MCB.24.15.6665-6675.2004. ЧВК  444862. PMID  15254234.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М. А., Кантли Л. К., Гиги С. П. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С., Уэллс К. Д., Фосетт Дж. П., Кулкарни С., Метальников П., О'Доннелл П., Тейлор П., Тейлор Л., Зугман А., Вудгетт Дж. Р., Лангеберг Л. К., Скотт Д. Д., Поусон Т. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Биол. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID  15324660.