PARP4 - PARP4

PARP4
Идентификаторы
Псевдонимы	PARP4, ADPRTL1, ARTD4, PARP-4, PARPL, PH5P, VAULT3, VPARP, VWA5C, p193, член семейства поли (АДФ-рибоза) полимеразы 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 607519 MGI: 2685589 ГомолоГен: 124423 Генные карты: PARP4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 13 (человек)[1] Группа 13q12.12 Начинать 24,420,931 бп[1] Конец 24,512,778 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 14 (мышь)[2] Группа 14 | 14 C3 Начинать 56,575,619 бп[2] Конец 56,659,794 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов Молекулярная функция • трансферазная активность • Связывание ДНК • трансферазная активность, перенос гликозильных групп • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ферментов • НАД + АДФ-рибозилтрансферазная активность • активность протеина АДФ-рибозилазы Сотовый компонент • цитоплазма • мембрана • шпиндель • микротрубочка веретена • внеклеточная экзосома • цитоскелет • ядро клетки • цитозоль • рибонуклеопротеин Биологический процесс • АДФ-рибозилирование белков • смерть клетки • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • процесс модификации клеточного белка • воспалительная реакция • Ремонт ДНК • ответ на наркотик • регуляция активности теломеразы • транспорт • моно-АДФ-рибозилирование белков Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	143	328417
Ансамбль	ENSG00000102699	ENSMUSG00000054509
UniProt	Q9UKK3	E9PYK3
RefSeq (мРНК)	NM_006437	NM_001145978
RefSeq (белок)	NP_006428	NP_001139450
Расположение (UCSC)	Chr 13: 24,42 - 24,51 Мб	Chr 14: 56,58 - 56,66 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Поли [АДФ-рибоза] полимераза 4 является фермент что у людей кодируется PARP4 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует поли (АДФ-рибозил) трансферазоподобный белок 1, который способен катализировать реакцию поли (АДФ-рибозилирования). Этот белок имеет каталитический домен, который гомологичен поли (АДФ-рибозил) трансферазе, но не имеет N-концевой ДНК-связывающий домен, который активирует C-терминал каталитический домен поли (АДФ-рибозил) трансферазы. Поскольку этот белок не способен напрямую связывать ДНК, его трансферазная активность может быть активирована другими факторами, такими как межбелковое взаимодействие, опосредованное обширным карбоксильным концом.^[6]

Взаимодействия

PARP4 был показан взаимодействовать с участием Основной белок свода.^[7][8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000102699 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000054509 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Тем не менее IH, Винс П., Коуэлл JK (март 2000 г.). «Идентификация нового гена (ADPRTL1), кодирующего потенциальный белок поли (ADP-рибозил) трансферазы». Геномика. 62 (3): 533–6. Дои:10.1006 / geno.1999.6024. PMID  10644454.
6. «Ген Entrez: семейство поли (АДФ-рибоза) полимераз PARP4, член 4».
7. ван Зон, Аренд; Mossink Marieke H; Schoester Martijn; Scheffer George L; Scheper Rik J; Сонневельд Питер; Вимер Эрик А.С. (март 2002 г.). «Структурные домены белков хранилища: роль домена спиральной спирали в сборке хранилища». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 291 (3): 535–41. Дои:10.1006 / bbrc.2002.6472. ISSN  0006-291X. PMID  11855821.
8. Кикхофер, Вирджиния; Шива А С; Кедерша Н Л; Inman E M; Ruland C; Streuli M; Rome LH (сентябрь 1999 г.). «Белок свода 193 кДа, VPARP, представляет собой новую поли (АДФ-рибоза) полимеразу». J. Cell Biol. 146 (5): 917–28. Дои:10.1083 / jcb.146.5.917. ISSN  0021-9525. ЧВК  2169495. PMID  10477748.

дальнейшее чтение

• Жан Л., Рислер Дж. Л., Нагасе Т. и др. (1999). «Ядерный белок PH5P суперсемейства интер-альфа-ингибиторов: недостающее звено между поли (АДФ-рибоза) полимеразой и семейством интер-альфа-ингибиторов и новый участник репарации ДНК?». FEBS Lett. 446 (1): 6–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00173-8. PMID  10100603.
• Soldani C, Scovassi AI (2003). «Расщепление поли (АДФ-рибозы) полимеразы-1 во время апоптоза: обновление». Апоптоз. 7 (4): 321–8. Дои:10.1023 / А: 1016119328968. PMID  12101391.
• Бушар VJ, Rouleau M, Poirier GG (2003). «PARP-1, определяющий выживаемость клеток в ответ на повреждение ДНК». Exp. Гематол. 31 (6): 446–54. Дои:10.1016 / S0301-472X (03) 00083-3. PMID  12829019.
• Соарес М.Б., Боналдо М.Ф., Джелен П. и др. (1994). «Построение и характеристика нормализованной библиотеки кДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 91 (20): 9228–32. Bibcode:1994PNAS ... 91.9228S. Дои:10.1073 / пнас.91.20.9228. ЧВК  44785. PMID  7937745.
• Нагасе Т., Секи Н., Исикава К. и др. (1996). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. V. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0161-KIAA0200), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 3 (1): 17–24. Дои:10.1093 / dnares / 3.1.17. PMID  8724849.
• Кикхофер В.А., Сива А.С., Кедерша Н.Л. и др. (1999). «Белок свода 193 кДа, VPARP, представляет собой новую поли (АДФ-рибоза) полимеразу». J. Cell Biol. 146 (5): 917–28. Дои:10.1083 / jcb.146.5.917. ЧВК  2169495. PMID  10477748.
• Кикхофер В.А., Стивен А.Г., Харрингтон Л. и др. (2000). «Хранилища и теломераза имеют общую субъединицу, TEP1». J. Biol. Chem. 274 (46): 32712–7. Дои:10.1074 / jbc.274.46.32712. PMID  10551828.
• Сива А.С., Раваль-Фернандес С., Стивен А.Г. и др. (2001). «Повышающая регуляция сводов может быть необходима, но недостаточна для множественной лекарственной устойчивости». Int. J. Рак. 92 (2): 195–202. Дои:10.1002 / 1097-0215 ​​(200102) 9999: 9999 <:: AID-IJC1168> 3.0.CO; 2-7. PMID  11291045.
• ван Зон А., Моссинк М. Х., Шестер М. и др. (2001). «Множественные человеческие РНК хранилища. Выражение и связь с комплексом хранилища». J. Biol. Chem. 276 (40): 37715–21. Дои:10.1074 / jbc.M106055200. PMID  11479319.
• ван Зон А., Моссинк М. Х., Шестер М. и др. (2002). «Структурные домены белков хранилища: роль домена спиральной спирали в сборке хранилища». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 291 (3): 535–41. Дои:10.1006 / bbrc.2002.6472. PMID  11855821.
• Маццон Э., Дуго Л., Ли Дж. Х. и др. (2002). «GPI 6150, ингибитор PARP, уменьшает повреждение толстой кишки, вызванное динитробензолсульфоновой кислотой у крыс». Biochem. Pharmacol. 64 (2): 327–37. Дои:10.1016 / S0006-2952 (02) 01075-4. PMID  12123754.
• Лю Т.Дж., Линь С.Ю., Чау Ю.П. (2002). «Ингибирование активации поли (АДФ-рибозы) полимеразы ослабляет вызванную бета-лапахоном некротическую гибель клеток в клетках остеосаркомы человека». Toxicol. Appl. Pharmacol. 182 (2): 116–25. Дои:10.1006 / taap.2002.9438. PMID  12140175.
• Nie Z, Phenix BN, Lum JJ и др. (2003). «Протеаза ВИЧ-1 обрабатывает прокаспазу 8, чтобы вызвать митохондриальное высвобождение цитохрома с, расщепление каспазы и фрагментацию ядра». Разница в гибели клеток. 9 (11): 1172–84. Дои:10.1038 / sj.cdd.4401094. PMID  12404116.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Данхэм А., Мэтьюз Л.Х., Бертон Дж. И др. (2004). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 13 человека». Природа. 428 (6982): 522–8. Bibcode:2004Натура.428..522D. Дои:10.1038 / природа02379. ЧВК  2665288. PMID  15057823.
• Лю Ю., Сноу Б.Е., Кикхофер В.А. и др. (2004). «Полимераза хранилища поли (АДФ-рибоза) связана с теломеразой млекопитающих и незаменима для функции теломеразы и структуры хранилища in vivo». Мол. Клетка. Биол. 24 (12): 5314–23. Дои:10.1128 / MCB.24.12.5314-5323.2004. ЧВК  419898. PMID  15169895.