PCBP3 - PCBP3

PCBP3
Идентификаторы
Псевдонимы	PCBP3, АЛЬФА-CP3, поли (rC) связывающий белок 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 608502 MGI: 1890470 ГомолоГен: 23233 Генные карты: PCBP3
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[1] Группа 10 | 10 C1 Начинать 76,761,857 бп[1] Конец 76,961,887 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание нуклеиновой кислоты • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание двухцепочечной ДНК • Связывание C-богатой одноцепочечной ДНК • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • внеклеточная экзосома • ядро клетки Биологический процесс • метаболический процесс мРНК • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	54039	59093
Ансамбль	ENSG00000183570	ENSMUSG00000001120
UniProt	P57721	P57722
RefSeq (мРНК)	NM_020528 NM_001130141	NM_021568 NM_001347216
RefSeq (белок)	NP_001123613 NP_065389 NP_001335167 NP_001335168 NP_001335169 NP_001335170 NP_001335171 NP_001335172 NP_001335173 NP_001335174 NP_001369205 NP_001369206 NP_001369207 NP_001369208 NP_001369210 NP_001369211 NP_001369212 NP_001369213 NP_001369214 NP_001369215 NP_001369216 NP_001369217 NP_001371085	NP_001334145 NP_067543
Расположение (UCSC)	н / д	Chr 10: 76.76 - 76.96 Мб
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Поли (rC) -связывающий белок 3 это белок что у людей кодируется PCBP3 ген.^[4][5]

Этот ген кодирует член KH домен белковое подсемейство. Белки этого подсемейства, также называемые альфа-CP, связываются с РНК со спецификой для C-rich пиримидин регионы. Альфа-CP играют важную роль в посттранскрипционной активности и имеют различное клеточное распределение. Белок этого гена находится в цитоплазма, но у него отсутствуют сигналы ядерной локализации, обнаруженные у других членов подсемейства. Несколько полиаденилирование сайты существуют для этого гена.^[5]

Рекомендации

1. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000001120 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Макеев А.В., Либхабер С.А. (сентябрь 2000 г.). «Идентификация двух новых генов млекопитающих создает подсемейство РНК-связывающих белков KH-домена». Геномика. 67 (3): 301–16. Дои:10.1006 / geno.2000.6244. PMID  10936052.
5. «Ген Entrez: PCBP3 поли (rC) связывающий белок 3».

дальнейшее чтение

• Макеев А.В., Либхабер С.А. (2002). «Поли (С) -связывающие белки: множество функций и поиск механизмов». РНК. 8 (3): 265–78. Дои:10.1017 / S1355838202024627. ЧВК  1370249. PMID  12003487.
• Kiledjian M, Wang X, Liebhaber SA (1995). «Идентификация двух белков домена KH в комплексе стабильности мРНП альфа-глобина». EMBO J. 14 (17): 4357–64. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb00110.x. ЧВК  394520. PMID  7556077.
• Хаттори М., Фудзияма А., Тейлор Т.Д. и др. (2000). «Последовательность ДНК хромосомы 21 человека». Природа. 405 (6784): 311–9. Bibcode:2000Натура.405..311H. Дои:10.1038/35012518. PMID  10830953.
• Макеев А.В., Истмонд Д.Л., Либхабер С.А. (2002). «Нацеливание на белок KH-домена с помощью ловушек РНК». РНК. 8 (9): 1160–73. Дои:10.1017 / S135583820202808X. ЧВК  1370330. PMID  12358435.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чхеидзе А.Н., Либхабер С.А. (2003). «Новый набор сигналов ядерной локализации определяет распределение белков, связывающих РНК alphaCP». Мол. Клетка. Биол. 23 (23): 8405–15. Дои:10.1128 / MCB.23.23.8405-8415.2003. ЧВК  262676. PMID  14612387.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть межбелкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Клетка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Ху YH, Warnatz HJ, Vanhecke D, et al. (2006). «Скрининг внутриклеточной локализации на основе массива клеток выявляет новые функциональные особенности белков хромосомы 21 человека». BMC Genomics. 7: 155. Дои:10.1186/1471-2164-7-155. ЧВК  1526728. PMID  16780588.