PCDH18 - PCDH18

PCDH18
Идентификаторы
Псевдонимы	PCDH18, PCDH68L, протокадгерин 18
Внешние идентификаторы	OMIM: 608287 MGI: 1920423 ГомолоГен: 10389 Генные карты: PCDH18
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q28.3 Начинать 137,518,918 бп[1] Конец 137,532,494 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 С Начинать 49,743,296 бп[2] Конец 49,757,325 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • клеточная мембрана • мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны Биологический процесс • развитие мозга • гомофильная клеточная адгезия через молекулы адгезии плазматической мембраны • клеточная адгезия • передача сигналов от клетки к клетке • развитие нервной системы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	54510	73173
Ансамбль	ENSG00000189184	ENSMUSG00000037892
UniProt	Q9HCL0	Q8VHR0
RefSeq (мРНК)	NM_001300828 NM_019035	NM_130448
RefSeq (белок)	NP_001287757 NP_061908	NP_569715
Расположение (UCSC)	Chr 4: 137,52 - 137,53 Мб	Chr 3: 49,74 - 49,76 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Протокадгерин-18 это белок что у людей кодируется PCDH18 ген.^[5][6][7]

Этот ген принадлежит к семейству генов протокадгерина, подсемейству кадгерин надсемейство. Этот ген кодирует белок, содержащий 6 внеклеточный кадгериновые домены, а трансмембранный домен и цитоплазматический хвост отличается от таковых у классических кадгеринов. Хотя его конкретная функция не определена, связанный с кадгерином нейронный Считается, что рецептор играет роль в установлении и функционировании определенных межклеточных связей в головном мозге.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000189184 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037892 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ноллет Ф., Кулс П., Ван Рой Ф. (июль 2000 г.). «Филогенетический анализ суперсемейства кадгеринов позволяет идентифицировать шесть основных подсемейств помимо нескольких отдельных членов». Дж Мол Биол. 299 (3): 551–72. Дои:10.1006 / jmbi.2000.3777. PMID  10835267.
6. Волвертон Т., Лаланд М. (сентябрь 2001 г.). «Идентификация и характеристика трех членов нового подкласса протокадгеринов». Геномика. 76 (1–3): 66–72. Дои:10.1006 / geno.2001.6592. PMID  11549318.
7. "Entrez Gene: PCDH18 протокадгерин 18".

дальнейшее чтение

• Suzuki ST (2000 г.). «Недавний прогресс в исследованиях протокадгерина». Exp. Cell Res. 261 (1): 13–8. Дои:10.1006 / excr.2000.5039. PMID  11082270.
• Яги Т., Такейчи М. (2000). «Гены суперсемейства кадгеринов: функции, геномная организация и неврологическое разнообразие». Genes Dev. 14 (10): 1169–80. Дои:10.1101 / gad.14.10.1169 (неактивно 11.10.2020). PMID  10817752.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Хомаюни Р., Райс Д.С., Курран Т. (2002). «Disabled-1 взаимодействует с новым протокадгерином, регулируемым в процессе развития». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 289 (2): 539–47. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5998. PMID  11716507.
• Нагасе Т., Кикуно Р., Накаяма М. и др. (2001). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XVIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 7 (4): 273–81. Дои:10.1093 / dnares / 7.4.271. PMID  10997877.
• Ву Кью, Маниатис Т. (2000). «Большие экзоны, кодирующие несколько эктодоменов, являются характерной чертой генов протокадгерина». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (7): 3124–9. Дои:10.1073 / pnas.060027397. ЧВК  16203. PMID  10716726.