PCDH20 - PCDH20

PCDH20
Идентификаторы
Псевдонимы	PCDH20, PCDH13, протоколадгерин 20
Внешние идентификаторы	OMIM: 614449 MGI: 2443376 ГомолоГен: 11277 Генные карты: PCDH20
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 13 (человек)[1] Группа 13q21.2 Начинать 61,409,685 бп[1] Конец 61,415,522 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 14 (мышь)[2] Группа 14 | 14 E1 Начинать 88,464,743 бп[2] Конец 88,471,396 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • Связывание РНК Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • клеточная мембрана • мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны Биологический процесс • клеточная адгезия • гомофильная клеточная адгезия через молекулы адгезии плазматической мембраны Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	64881	219257
Ансамбль	ENSG00000280165	ENSMUSG00000050505
UniProt	Q8N6Y1	Q8BIZ0
RefSeq (мРНК)	NM_022843	NM_178685
RefSeq (белок)	NP_073754	NP_848800
Расположение (UCSC)	Chr 13: 61.41 - 61.42 Мб	Chr 14: 88.46 - 88.47 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Протокадгерин-20 это белок что у людей кодируется PCDH20 ген.^[5]

Этот ген принадлежит к протоколадгерин Генное семейство, подсемейство надсемейства кадгеринов. Этот ген кодирует белок, содержащий 6 внеклеточных доменов кадгерина, a трансмембранный домен и цитоплазматический хвост отличается от таковых у классических кадгеринов. Хотя его конкретная функция не определена, связанный с кадгерином нейронный Считается, что рецептор играет роль в установлении и функционировании определенных межклеточных связей в головном мозге.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000280165 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000050505 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Entrez Gene: PCDH20 протокадгерин 20".

дальнейшее чтение

• Suzuki ST (2000 г.). «Недавний прогресс в исследованиях протокадгерина». Exp. Cell Res. 261 (1): 13–8. Дои:10.1006 / excr.2000.5039. PMID  11082270.
• Ноллет Ф., Кулс П., Ван Рой Ф. (2000). «Филогенетический анализ суперсемейства кадгеринов позволяет идентифицировать шесть основных подсемейств помимо нескольких отдельных членов». J. Mol. Биол. 299 (3): 551–72. Дои:10.1006 / jmbi.2000.3777. PMID  10835267.
• Яги Т., Такейчи М. (2000). «Гены суперсемейства кадгеринов: функции, геномная организация и неврологическое разнообразие». Genes Dev. 14 (10): 1169–80. Дои:10.1101 / gad.14.10.1169. PMID  10817752.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ву Кью, Маниатис Т. (2000). «Большие экзоны, кодирующие несколько эктодоменов, являются характерной чертой генов протокадгерина». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (7): 3124–9. Дои:10.1073 / pnas.060027397. ЧВК  16203. PMID  10716726.
• Кросс С.Х., Чарльтон Дж. А., Нэн Х, Берд А. П. (1994). «Очистка CpG-островков с использованием колонки для связывания метилированной ДНК». Nat. Genet. 6 (3): 236–44. Дои:10.1038 / ng0394-236. PMID  8012384.