PCDH7 - PCDH7

PCDH7
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2YST
Идентификаторы
Псевдонимы	PCDH7, BH-Pcdh, BHPCDH, PPP1R120, протокадгерин 7
Внешние идентификаторы	OMIM: 602988 MGI: 1860487 ГомолоГен: 36101 Генные карты: PCDH7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4п15.1 Начинать 30,720,415 бп[1] Конец 31,146,805 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 C1 Начинать 57,717,967 бп[2] Конец 58,133,230 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • клеточная мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • мембрана • мембрана альфа-гранул тромбоцитов Биологический процесс • клеточная адгезия • гомофильная клеточная адгезия через молекулы адгезии плазматической мембраны • дегрануляция тромбоцитов Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5099	54216
Ансамбль	ENSG00000169851	ENSMUSG00000029108
UniProt	O60245	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001173523 NM_002589 NM_032456 NM_032457	NM_001122758 NM_018764 NM_001310606 NM_001310608
RefSeq (белок)	NP_001166994 NP_002580 NP_115832 NP_115833	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 4: 30.72 - 31.15 Мб	Chr 5: 57.72 - 58.13 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Протокадгерин-7 это белок что у людей кодируется PCDH7 ген.^[5][6]

Этот ген принадлежит к семейству генов протокадгерина, подсемейству кадгерин надсемейство. Ген кодирует белок с внеклеточный домен, содержащий 7 повторов кадгерина. Продукт гена представляет собой интегральный мембранный белок, который, как считается, функционирует в клетка-клеточное распознавание и адгезия. Альтернативные варианты сращивания изоформы с уникальным цитоплазматический хвосты.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000169851 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029108 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ёсида К., Ёситомо-Накагава К., Секи Н., Сасаки М., Сугано С. (август 1998 г.). «Клонирование, анализ экспрессии и хромосомная локализация BH-протокадгерина (PCDH7), нового члена суперсемейства кадгеринов». Геномика. 49 (3): 458–61. Дои:10.1006 / geno.1998.5271. PMID  9615233.
6. «Энтрез Ген: протокол 7 PCDH7».

дальнейшее чтение

• Яги Т., Такейчи М. (2000). «Гены суперсемейства кадгеринов: функции, геномная организация и неврологическое разнообразие». Genes Dev. 14 (10): 1169–80. Дои:10.1101 / gad.14.10.1169 (неактивно 11.10.2020). PMID  10817752.
• Ноллет Ф., Кулс П., Ван Рой Ф. (2000). «Филогенетический анализ суперсемейства кадгеринов позволяет идентифицировать шесть основных подсемейств помимо нескольких отдельных членов». J. Mol. Биол. 299 (3): 551–72. Дои:10.1006 / jmbi.2000.3777. PMID  10835267.
• Йошида К., Ватанабе М., Като Х. и др. (1999). «BH-протоколадгерин-c, член суперсемейства кадгеринов, взаимодействует с протеинфосфатазой 1 альфа через свой внутриклеточный домен». FEBS Lett. 460 (1): 93–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 01309-5. PMID  10571067. S2CID  24377126.
• Ву Кью, Маниатис Т. (2000). «Большие экзоны, кодирующие несколько эктодоменов, являются характерной чертой генов протокадгерина». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (7): 3124–9. Дои:10.1073 / pnas.060027397. ЧВК  16203. PMID  10716726.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.